5′UTR中AUG的分布及其對翻譯起始的影響.pdf

1、在翻譯起始時(shí)，核糖體首先要與mRNA的5'非翻譯區(qū)(5' untranslated region，5'UTR)的核糖體結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合，因此5' UTR的序列特征對翻譯起始的準(zhǔn)確性和翻譯的效率都有很大的影響。論文運(yùn)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法討論了在5' UTR中三聯(lián)體AUG對翻譯起始的可能影響。 論文的第一部分以細(xì)菌和古菌基因組的mRNA的5' UTR序列作為研究對象，分析了在5' UTR的3個(gè)不同閱讀框架中三聯(lián)體AUG的分布，發(fā)現(xiàn)無論是細(xì)菌還

2、是古菌基因組都在閱讀框1中有非常明顯的AUG缺失(depletion)。與AUG在閱讀框1出現(xiàn)明顯的缺失相反，三聯(lián)體UAA在起始密碼子附近的頻率有了顯著的增加。AUG的缺失和UAA頻率的增加可能會避免基因被錯(cuò)誤地翻譯起始，提高翻譯效率。 論文的第二部分將5' UTR中的三聯(lián)體AUG按照存在形式分類，發(fā)現(xiàn)絕大部分的AUG都是以uORF(upstream open reading frame)的形式出現(xiàn)的，uAUG(upstrea