深海熱液口管狀蠕蟲Ridgeia picesae共生微生物的鑒定及代謝機(jī)制的初步研究.pdf

1、Ridgeia piscesae是熱液口管狀蠕蟲的一種,主要分布于東北太平洋Explorer、Juan de Fuca及Gorda洋中脊。該類管狀蠕蟲具有形態(tài)多樣性,按其形態(tài)主要可分為短胖型及細(xì)長(zhǎng)型蟲體。根據(jù)以往研究,管狀蠕蟲R.piscesae滋養(yǎng)體中的共生微生物類型被認(rèn)為主要為y-proteobacteria,但是也有很多研究報(bào)道反對(duì)這種“滋養(yǎng)體單一菌種”的假說。
　　 本論文的主要目的是鑒定由深海熱液口Juan de Fu

2、ca洋中脊Endeavor段采集的管狀蠕蟲R.piscesae的共生微生物類型,并進(jìn)行相關(guān)代謝機(jī)制研究。實(shí)驗(yàn)中,我們運(yùn)用差速離心的方法分離了該管狀蠕蟲共生微生物,并通過通用引物對(duì)該共生微生物的16S rDNA進(jìn)行了擴(kuò)增,建立了16S rDNA克隆文庫(kù)并對(duì)該文庫(kù)進(jìn)行了限制性酶切片斷多態(tài)性(RFLP)分析。RFLP分析及后續(xù)測(cè)序顯示,該管狀蠕蟲共生微生物只包含一種類型的微生物,即ε-proteobacteria,與以往發(fā)現(xiàn)的共生微生物類型完

3、全不同。為了鑒定該共生微生物的自養(yǎng)特性,我們通過PCR擴(kuò)增了其固碳途徑的關(guān)鍵酶D-ribulose1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase(RuBisCO)基因。我們發(fā)現(xiàn)該共生微生物同時(shí)含有兩種形式的RuBisCO基因(cbbL和cbbM),反應(yīng)了其利用卡爾文循環(huán)固定無機(jī)碳的自養(yǎng)途徑；另一方面,通過對(duì)硫氧化相關(guān)基因的篩選,我們證明該共生微生物自養(yǎng)代謝的能量來源于對(duì)環(huán)境中無機(jī)硫的氧化過程。