環(huán)形RNA hsa_circ_001988在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及臨床意義.pdf

1、世界范圍內(nèi)，結(jié)直腸癌(CRC)是癌癥相關(guān)疾病死亡的主要原因之一，是胃腸道常見(jiàn)的惡性腫瘤。2012年全世界約有140萬(wàn)結(jié)直腸癌新發(fā)病例，居惡性腫瘤第3位，給人們的健康構(gòu)成了極大的威脅。但結(jié)直腸癌現(xiàn)有診斷指標(biāo)的診斷效能有限，所以尋找新的腫瘤標(biāo)記物，同時(shí)探索潛在生物治療靶點(diǎn)有助于結(jié)直腸癌的診治。
　　隨著二代測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)的發(fā)展，環(huán)形RNA重新走入人們的視野，它是一類新型的非線性RNA，由前體RNA兩側(cè)的5'末端和3'末端反向剪切

2、而成，構(gòu)成閉合的環(huán)形。雖然環(huán)形RNA已經(jīng)報(bào)道數(shù)十年，但是過(guò)去一度認(rèn)為是拼接的副產(chǎn)物，并未引起科學(xué)家的興趣?，F(xiàn)在越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA廣泛地存在于真核細(xì)胞中，參與細(xì)胞的多種生物學(xué)功能，同時(shí)環(huán)形RNA參與了多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展，其生物學(xué)作用也日益受到人們重視。基于此，我們對(duì)環(huán)形RNA在結(jié)直腸癌中的作用進(jìn)行了初步探索。
　　目的：
　　1、通過(guò)二代測(cè)序和生物信息學(xué)的方法預(yù)測(cè)結(jié)直腸癌患者腫瘤組織與癌旁正常組織中差異性表達(dá)的環(huán)形R

3、NA，對(duì)部分差異明顯的環(huán)形RNA進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
　　2、對(duì)驗(yàn)證的環(huán)形RNA進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)，比較腫瘤組織和癌旁組織中表達(dá)量是否存在差異。
　　3、結(jié)合患者的各種臨床信息進(jìn)行單因素方差分析，探索目的環(huán)形RNA是否與臨床因素有關(guān)。
　　4、根據(jù)實(shí)時(shí)熒光定量PCR的數(shù)據(jù)，對(duì)目的環(huán)形RNA構(gòu)建ROC曲線，探索差異性表達(dá)的環(huán)形RNA是否具有成為潛在診斷指標(biāo)的可能。
　　方法：
　　1、選取2對(duì)樣本（癌

4、和癌旁）進(jìn)行二代測(cè)序分析，應(yīng)用生物信息學(xué)的方法比對(duì)預(yù)測(cè)出在癌組織和癌旁正常組織中差異性表達(dá)的環(huán)形RNA。設(shè)計(jì)引物通過(guò)PCR進(jìn)行驗(yàn)證，應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法測(cè)定癌和癌旁組織的相對(duì)表達(dá)量。
　　2、將癌和癌旁的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，同時(shí)結(jié)合各種臨床信息，找出目的環(huán)形RNA可能相關(guān)的臨床因素。
　　結(jié)果：
　　1、通過(guò)二代測(cè)序以及數(shù)據(jù)分析篩出多條差異表達(dá)的環(huán)形RNA，其中甄選出環(huán)形RNA_hsa_circ_001988進(jìn)行

5、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，證明環(huán)形RNA hsa_circ_001988的存在。
　　2、通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR，發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNA hsa_circ_001988在癌和癌旁組織中表達(dá)是有差異的：癌組織中的表達(dá)量低于癌旁組織。
　　3、對(duì)納入的31例患者的臨床信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNAhsa_circ_001988的表達(dá)量與腫瘤病理分化程度以及神經(jīng)侵犯相關(guān)。
　　4、構(gòu)建ROC曲線(AUC=0.788，95％CI=0.68-0.90，

6、P＜0.001)發(fā)現(xiàn)環(huán)形RNAhsa_circ_001988在結(jié)直腸癌中具有一定的診斷價(jià)值。
　　結(jié)論：
　　1、證實(shí)了環(huán)形RNA hsa_circ_001988的存在。環(huán)形RNA hsa_circ_001988在結(jié)直腸癌和癌旁組織中表達(dá)是有差異的，在本研究中癌組織中的表達(dá)量低于癌旁組織。
　　2、環(huán)形RNA hsa_circ_001988可能參與腫瘤細(xì)胞的分化以及神經(jīng)侵犯的生物學(xué)行為。
　　3、環(huán)形RNA hs