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文檔簡介
1、目的:
心血管疾病因其逐年增長的發(fā)病率和死亡率,一直以來受到各界廣泛關(guān)注。盡管目前已有廣泛可用的診斷治療途徑,心血管疾病的流行、死亡率和治療花費在發(fā)達國家及發(fā)展中國家仍呈上升趨勢。急性心肌梗死(acute myocardialinfarction,AMI)是世界范圍內(nèi)最常見的心血管疾病之一,為有效控制AMI的發(fā)生和發(fā)展,尋求新的診斷和治療的指標(biāo)和方法十分必要。
近年以來,研究表明miRNA在疾病發(fā)生發(fā)展中可通過靶向調(diào)
2、節(jié)其下游靶基因發(fā)揮作用。在多個研究領(lǐng)域都得到廣泛重視,包括腫瘤、心血管疾病等等。已發(fā)現(xiàn)多種miRNA在急性心肌梗死患者血液和血漿中發(fā)生改變,如miR-1、miR-133a,miR-208b,miR-499,和miR-328,提示循環(huán)miRNA在AMI早期診斷中具有價值。
本實驗的目的是篩選AMI發(fā)生時血液循環(huán)中異常表達的miRNA;分析異常表達miRNA表達水平變化,并判斷其作為輔助診斷的價值;初步探索AMI發(fā)生時異常表達mi
3、RNA發(fā)揮調(diào)控作用的可能途徑。
第一部分 急性心肌梗死發(fā)生時血液循環(huán)中異常表達miRNA篩選和鑒定
方法:
1.收集30例AMI患者和30例健康成人志愿者的血漿樣本。
2.采用Agilent miRNA芯片分別檢測隨機選取3例AMI患者和3例健康成年志愿者血漿中miRNA的表達情況,篩選有顯著差異表達的miRNA。
3.應(yīng)用qRT-PCR的方法檢測30例AMI患者和30例健康成人志愿者的
4、血漿樣本中miRNA芯片篩選出的有差異表達的miRNA的表達情況,對miRNA芯片的結(jié)果進行驗證。
4.應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)軟件SPSS21.0對實驗數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學(xué)分析,檢驗標(biāo)準α=0.05。
結(jié)果:
1.通過miRNA芯片檢測出共有36種miRNA在AMI患者血漿中出現(xiàn)異常表達,其中有23種miRNA表達水平顯著升高(P<0.05),13種miRNA表達水平明顯下降(P<0.05)。
2.qRT-PCR驗
5、證的結(jié)果表明30例AMI患者血漿中除miR-361-5p,miR-182-5p,miR-497-5p,miR-20a-5p四種miRNA表達水平與正常對照組相比無顯著性差異(P>0.05),其余32種miRNA表達水平較正常對照組相比出現(xiàn)顯著性變化(P<0.05),其中上調(diào)的miRNA有20種,下調(diào)的miRNA有12種。
第二部分 AMI發(fā)生時血液循環(huán)中miR-486,miR-150和miR-26a表達變化分析及作為輔助診斷的
6、價值
方法:
1.收集110例AMI和110例健康成人志愿者的血漿樣本,110例AMI患者中分別有45例NSTEMI患者和65例STEMI患者,采集入院之后發(fā)病4h以內(nèi),24h,48h,72h的血漿樣本。
2.qRT-PCR法檢測miR-486,miR-150和miR-26a在AMI各類型各時間段血漿樣本中的表達水平。
3.應(yīng)用受試者工作特性曲線(ROC)反映靈敏度與特異度,應(yīng)用ROC曲線下面積(
7、AUCROC)比較miR-486,miR-150和miR-26a對AMI的輔助診斷價值。
4.應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)軟件SPSS21.0處理所有數(shù)據(jù),檢驗標(biāo)準α=0.05。
結(jié)果:
1.AMI發(fā)作4h以內(nèi),miR-486和miR-150表達量分別為9.655±1.427和7.420±0.911,與正常對照組相比表達水平均顯著上調(diào)(P<0.05); miR-26a表達量為0.092±0.104,與正常對照組相比表達水平顯
8、著下調(diào)(P<0.05)。
2.AMI發(fā)作4h以內(nèi),24h,48h,72h,miR-486和miR-150表達水平均隨時間延長逐漸降低,至72h時與正常對照組無顯著性差異(P>0.05);miR-26a表達水平隨時間延長逐漸升高,至72h時與正常對照組無顯著性差異(P>0.05)。
3.AMI發(fā)作4h以內(nèi),miR-486,miR-150和miR-26a的AUC曲線下面積分別為0.731(P<0.05),0.678(P<
9、0.05),0.763(P<0.05),表明這三種miRNA的表達水平檢測對檢測AMI的發(fā)生有一定的價值。這三種miRNA聯(lián)合檢測的AUC曲線下面積為0.792(P<0.05),表明具有更高的診斷價值。
4.AMI發(fā)作4h以內(nèi),miR-486,miR-150和miR-26a表達在AMI的兩種類型STEMI和NSTEMI中存在顯著性差異。miR-486,miR-150和miR-26a在STEMI中的AUC曲線下面積分別為0.69
10、5(P<0.05),0.639(P<0.05),0.750(P<0.05),表明這三種miRNA的表達水平檢測對檢測STEMI的發(fā)生有一定的價值;miR-486,miR-150和miR-26a在NSTEMI中的AUC曲線下面積分別為0.782(P<0.05),0.734(P<0.05),0.782(P<0.05),表明這三種miRNA的表達水平檢測對檢測NSTEMI的發(fā)生有一定的價值;在STEMI和NSTEMI時這三種miRNA聯(lián)合檢測
11、的AUC曲線下面積分別為0.765(P<0.05),0.833(P<0.05),說明三者聯(lián)合檢測具有更高的靈敏度和特異度,且在NSTEMI時具有更高的診斷價值。
第三部分 miR-486,miR-150在AMI發(fā)生時的作用機制的初步探索
方法:
1.通過TargetScan和miRanda尋找可能與miR-486,miR-150相關(guān)的靶基因
2.用Overlap PCR的方法擴增突變型CDKN1B
12、3'UTR和ALDH23'UTR片段,用普通PCR來擴增野生型CDKN1B3'UTR和ALDH23'UTR片段,將擴增出來的片段與pmirGLO雙粘載體進行重組,從而分別構(gòu)建野生型和突變型CDKN1B3'UTR和ALDH23'UTR的重組雙熒光素酶報告載體。
3.將野生型和突變型CDKN1B3'UTR重組報告載體分別與miR-150 mimics或者miR-150 scramble共同轉(zhuǎn)染到HEK293T細胞中;將野生型和突變
13、型ALDH23'UTR重組報告載體分別與miR-486 mimics或者miR-486 scramble共同轉(zhuǎn)染到HEK293T細胞中。通過雙熒光素酶報告實驗驗證CDKN1B是否為miR-150的靶基因,ALDH2是否為miR-486的靶基因。
4.應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)軟件SPSS21.0處理所有數(shù)據(jù),檢驗標(biāo)準α=0.05。
結(jié)果:
1.生物信息學(xué)檢測發(fā)現(xiàn)基因CDKN1B的3'UTR區(qū)可能是miR-150的一個下游直
14、接作用靶點,ALDH2的3'UTR區(qū)可能是miR-486的一個下游直接作用靶點。
2.經(jīng)酶切驗證,PCR驗證和測序結(jié)果驗證,成功構(gòu)建了野生型和突變型CDKN1B3'UTR和ALDH23'UTR的重組雙熒光素酶報告載體。
3.雙熒光素報告酶實驗顯示,miR-150 mimics和WT-pmirGLO-CDKN1B共轉(zhuǎn)染組熒光素酶活性為0.54±0.065,顯著低于其他三個共轉(zhuǎn)染組(P<0.05),表明CDKN1B是mi
15、R-150作用的靶基因;miR-486 mimics和WT-pmirGLO-ALDH2共轉(zhuǎn)染組熒光素酶活性為0.62±0.045,顯著低于其他三個共轉(zhuǎn)染組(P<0.05),表明ALDH2是miR-486作用的靶基因。
結(jié)論:
1.急性心肌梗死患者循環(huán)血液中,存在32種miRNA出現(xiàn)表達異常,20種miRNA表達明顯上調(diào),12種miRNA表達明顯下調(diào)。
2.急性心肌梗死發(fā)作4h以內(nèi),miR-486和miR-1
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