西太平洋暖池核心區(qū)0ntong-Java海臺微生物群落結構多樣性研究.pdf

1、為了研究西太平洋暖池核心區(qū) Ontong-Java海臺中微生物群落及多樣性，本研究以PCR技術為基礎，對古菌和細菌分別構建了6個不同層位的16S rDNA基因克隆文庫。經(jīng) PCR擴增、基因序列測序、序列大于或等于97％相似度分析以及序列提交到在線雜合子檢測系統(tǒng)以檢測其是否為雜合子序列；共得到古菌的有效克隆561個，135種RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP)帶型和50個基

2、因操作分類單元（Operational Taxonomic Units，OTUs）。共得到細菌的有效克隆539個，91種RFLP帶型和62個OTUs。
　　通過系統(tǒng)發(fā)育樹的分析得出，本研究中古菌和細菌的序列與來自各種海洋環(huán)境中的序列有較高的同源性并且絕大多數(shù)是不可培養(yǎng)的。古菌均屬于泉古菌（Crenarchaeota）（45.3％）和廣古菌(Euryarchaeota）（54.7％）。Marine Group II（MG II）(4

3、9.0％)和Marine Group I（MG I）（45.1％）為古菌的優(yōu)勢類群。細菌包含了8個不同的類群，包括變形菌門（Proteobacteria）、酸桿菌門（Acidobacteria）、藍澡門（Cyanobacteria）、擬桿菌門（Bacterioidetes）、綠彎菌門（Chloroflexi）、疣微菌門（Verrucomicrobia）、浮霉菌門（Planctomycetes），以及一個未確定的類群。其中變形菌門包括 A

4、lpha-（α-）、Gamma-（γ-）和Delta-（δ-）變形菌亞門，在細菌的研究中Gamma-變形桿菌亞門為絕對優(yōu)勢類群。
　　香農(nóng)威納指數(shù)（H）、辛普森指數(shù)（1/D）及均勻度（J）等多樣性指標和稀釋度曲線圖顯示，古菌克隆文庫的的CWP-A在6個層位中的多樣性最高，而細菌OWP-D的多樣性最高。
　　對西太平洋暖池核心區(qū) Ontong-Java海臺古菌和細菌中的群落結構進行比較分析發(fā)現(xiàn)，西太平洋暖池核心區(qū) Ontong