胰腺導(dǎo)管腺癌中長(zhǎng)鏈非編碼RNA生物信息學(xué)分析及l(fā)ncRNA n407201的預(yù)后相關(guān)性研究.pdf

1、長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一類超過200核苷酸單位的RNA分子，它們并不具有蛋白編碼功能，而是在多種層面上（表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等）調(diào)控基因的表達(dá)水平以及參與疾病的發(fā)生發(fā)展。近年來研究報(bào)道多種腫瘤中存在lncRNA的異常表達(dá)，表明其在腫瘤的病理生理過程中可能扮演著重要角色。
　　為了探索胰腺導(dǎo)管腺癌(Pancreatic Ductal Adenocarcinoma，PD

2、AC)中l(wèi)ncRNA表達(dá)譜及其與microRNA、蛋白編碼RNA(Messenger RNA，mRNA)間的相互作用，本研究通過基因芯片技術(shù)在人PDAC及相應(yīng)癌旁組織中檢測(cè)lncRNA、microRNA及mRNA差異表達(dá)譜，分析三者間復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并從中篩選潛在的內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性RNA(competingendogenous RNAs，ceRNA)。此外，通過實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Real-time Quantitative PCR，

3、qRT-PCR)分析27對(duì)胰腺導(dǎo)管腺癌及相應(yīng)癌旁組織中5lncRNA的表達(dá)量。同時(shí)，應(yīng)用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法研究lncRNAn407201表達(dá)水平與PDAC患者臨床病理特征及預(yù)后的相關(guān)性。
　　芯片實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)結(jié)果顯示，與癌旁組織對(duì)比，共有570lncRNAs、47microRNA及1409mRNA在PDAC組織中異常表達(dá)(變化倍數(shù)≥2，P＜0.05，F(xiàn)DR＜0.05)。生物信息學(xué)分析顯示，lncRNA、microRNA及mRNA三者之間存在復(fù)

4、雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。qRT-PCR結(jié)果顯示lncRNAn407201在17/27位患者癌組織中表達(dá)水平顯著上調(diào)。此外，lncRNAn407201高表達(dá)與腫瘤最大直徑、CA199水平呈正相關(guān)(P＜0.05)，而與組織學(xué)分化水平呈負(fù)相關(guān)(P＜0.05)。Kaplan-Meier生存分析結(jié)果顯示lncRNAn407201高表達(dá)患者的預(yù)后顯著差于低表達(dá)者，同時(shí)Cox比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型結(jié)果顯示n407201高表達(dá)是患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素?？傊?，本研究結(jié)果