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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
本研究擬回答以下問題:角質(zhì)形成細(xì)胞經(jīng)過44℃溫?zé)崽幚砗螅欠癞a(chǎn)生特異性高表達(dá)的HSPs?特異性增高的HSPs又能引起哪些分子的改變?溫?zé)嵊绊懴?,這些變化的分子通過何種途徑作用于角質(zhì)形成細(xì)胞?
方法:
一、實(shí)驗(yàn)對(duì)象
細(xì)胞系選擇為人角質(zhì)形成細(xì)胞系(HaCaT),購于江蘇凱基生物技術(shù)股份有限公司。受試者為2013年1月至2014年6月于中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院皮膚科門診診斷為跖疣的患者,符合臨床
2、診斷標(biāo)準(zhǔn),經(jīng)本人或其監(jiān)護(hù)人知情同意,入組衛(wèi)生公益性行業(yè)研究專項(xiàng)經(jīng)費(fèi)(201202013)項(xiàng)目,自愿接受溫?zé)嶂委?。獲得中國醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院倫理委員會(huì)的批準(zhǔn),并符合赫爾辛基宣言。
二、溫?zé)崽幚矸桨?br> 1、儀器
采用紅外溫?zé)醿x(專利號(hào):ZL200720185403.3,中國醫(yī)科大學(xué)),光源為鎢鹵素?zé)?90%以上的波長(zhǎng)為760-2300nm,波峰為1200nm),采取非接觸式定點(diǎn)加熱,通過紅外體溫監(jiān)測(cè)儀實(shí)時(shí)反饋體
3、表溫度,使溫度恒定。
2、細(xì)胞溫?zé)?br> 采用水浴加熱的方式溫?zé)?0分鐘,37℃為對(duì)照組,44℃為實(shí)驗(yàn)組。根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要收集溫?zé)岷蟛煌瑫r(shí)間點(diǎn)的細(xì)胞。
3、在體溫?zé)?br> 選取靶皮損進(jìn)行局部溫?zé)嶂委?。第一階段治療為連續(xù)3天,每天30分鐘,溫度為44℃。10天后進(jìn)行第二階段治療,連續(xù)2天,每天30分鐘,溫度為44℃。隨訪觀察6個(gè)月,觀察治療效果。
三、實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)溫?zé)岷驢SPs的時(shí)相性變化
4、> 分別收集對(duì)照組(37℃)和實(shí)驗(yàn)組(44℃)溫?zé)崽幚砬凹皽責(zé)岷笈囵B(yǎng)1h、2h、4h、12h的HaCaT細(xì)胞,用Qiagen公司的miRNeasy Mini Kit試劑盒提取RNA,逆轉(zhuǎn)錄得到cDNA,以HSPA6(HSP70家族成員)、HSP90為引物行real-time PCR檢測(cè)。
四、PCR Array方法篩選溫?zé)嵯嚓P(guān)的特異生HSPs
收集44℃溫?zé)崽幚砬?,及溫?zé)岷笈囵B(yǎng)2小時(shí)的HaCaT細(xì)胞,提取RNA,逆
5、轉(zhuǎn)錄后行PCR Array檢測(cè),篩選出特異性表達(dá)的HSPs。
五、利用CRISPR/Cas9技術(shù)、慢病毒為載體建立DNAJA4基因敲除細(xì)胞
采用CRISPR/Cas9技術(shù)、慢病毒為載體分別轉(zhuǎn)入Cas9及gRNA基因,利用流式細(xì)胞術(shù)、熒光顯微鏡觀察、基因測(cè)序、western blot的方法對(duì)建立的可穩(wěn)定傳代細(xì)胞進(jìn)行驗(yàn)證。
六、基因表達(dá)譜差異分析方法探討DNAJA4基因敲除后引起的相關(guān)分子的變化
分別
6、收集溫?zé)崽幚砬凹皽責(zé)岷笈囵B(yǎng)2h、18h及36h的空載體及基因敲除細(xì)胞送檢,利用表達(dá)譜差異分析的方法尋找變化的基因,通過相關(guān)通路的對(duì)比分析,尋找與DNAJA4關(guān)系密切的基因,并用real-time PCR的方法驗(yàn)證相關(guān)基因的變化。
七、流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)DNAJA4基因?qū)?xì)胞周期的影響
收集37℃培養(yǎng)的HaCaT、空載體及基因敲除細(xì)胞,及溫?zé)岷笈囵B(yǎng)36h的空載體及基因敲除細(xì)胞,利用流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞周期,分別比較G0/G1
7、期、S期、G2/M期的百分比。
八、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
利用GraphPad Prism5軟件對(duì)資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及圖表的繪制,組間比較用t檢驗(yàn)及方差分析,p<0.05時(shí)認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
結(jié)果:
一、溫?zé)岣深A(yù)下角質(zhì)形成細(xì)胞差異表達(dá)的熱休克蛋白及其時(shí)相性變化
1、44℃溫?zé)崽幚砗?,HSPA6、HSP90在mRNA水平迅速升高
角質(zhì)形成細(xì)胞經(jīng)溫?zé)崽幚砗?,HSPA6、HSP90的表達(dá)量
8、逐漸升高。與溫?zé)岷蠹纯滔啾?,HSPA6從2小時(shí)起開始出現(xiàn)差異性高表達(dá),4小時(shí)后表達(dá)量達(dá)到最高并開始降低;HSP90在4小時(shí)出現(xiàn)差異性高表達(dá),隨后達(dá)到最高并開始降低。
2、通過PCR Array的方法發(fā)現(xiàn)8個(gè)HSPs出現(xiàn)差異性高表達(dá)
從80余種熱休克蛋白中篩選發(fā)現(xiàn):溫?zé)岷?,DNAJA4、DNAJB1、CRYAB、BAG3、HSPA6、HSPA1A、HSPA1B及HSPA1L在角質(zhì)形成細(xì)胞中發(fā)生8倍以上的高表達(dá);12個(gè)基
9、因出現(xiàn)2-6倍的上調(diào);余下基因的變化在0.5-2倍之間。
3、溫?zé)崾菇琴|(zhì)形成細(xì)胞的DNAJA4在蛋白水平上表達(dá)增高
溫?zé)岷?小時(shí),HaCaT細(xì)胞系中DNAJA4基因在蛋白水平上表達(dá)開始增高。
二、構(gòu)建DNAJA4基因敲除角質(zhì)形成細(xì)胞
以慢病毒為載體,分別轉(zhuǎn)入Cas9及gRNA基因,經(jīng)多種方法驗(yàn)證:熒光顯微鏡觀察及流式細(xì)胞術(shù)顯示90%以上慢病毒載體成功轉(zhuǎn)入HaCaT細(xì)胞中;并且在基因及蛋白水平上成功
10、敲除DNAJA4基因。
三、DNAJA4基因影響角質(zhì)形成細(xì)胞中NF-κB通路的IL-1β途徑多個(gè)分子表達(dá)水平
1、基因表達(dá)譜差異分析結(jié)果
基因表達(dá)譜差異分析方法共鑒定22017種基因,溫?zé)岷笈囵B(yǎng)2小時(shí)及18小時(shí)的細(xì)胞中,DNAJA4的敲除分別僅引起7個(gè)及10個(gè)基因發(fā)生差異性變化;培養(yǎng)36小時(shí)的細(xì)胞中,DNAJA4的敲除可引起50個(gè)基因表達(dá)下降,45個(gè)基因表達(dá)增高。經(jīng)生物信息學(xué)分析提示,IL-1β參與其中多條
11、通路,與感染性疾病密切相關(guān),值得進(jìn)一步深入研究。
2、DNAJA4基因敲除后,NF-κB通路中多個(gè)基因表達(dá)降低
對(duì)比溫?zé)崽幚?6小時(shí)后空載體及基因敲除細(xì)胞發(fā)現(xiàn): DNAJA4基因敲除后,IL-1β、IL-1R1、IRAK1、NFKBIA、P50及P65在RNA水平均表達(dá)下降,降低幅度為0.3-0.5倍;P65的S276位點(diǎn)磷酸化蛋白表達(dá)下降。
3、DNAJA4基因敲除后,細(xì)胞周期中G1期比例降低,G2/M期
12、比例增高
對(duì)比溫?zé)崽幚砗笈囵B(yǎng)36小時(shí)的空載體及基因敲除細(xì)胞發(fā)現(xiàn):DNAJA4基因敲除后,DNAJA4基因敲除細(xì)胞的S、G2期比率升高約5個(gè)百分點(diǎn)。
結(jié)論:
1、溫?zé)崽幚斫琴|(zhì)形成細(xì)胞系HaCaT細(xì)胞后,DNAJA4、HSPA6及HSP90等8個(gè)熱休克蛋白發(fā)生8倍以上的高表達(dá);12個(gè)基因出現(xiàn)2-6倍的上調(diào),其余熱休克蛋白未發(fā)生顯著性變化。
2、DNAJA4基因敲除后,NF-κB通路的IL-1β途徑中多
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