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文檔簡介
1、目的:冠心病是一種常見的致死致殘性心血管疾病,遺傳因素對冠心病的發(fā)生有重要作用。已有許多研究發(fā)現(xiàn)冠心病易感性與基因多態(tài)性相關(guān),是由多個基因共同作用并與環(huán)境因素相互累加而發(fā)病。多個基因的不同突變導致不同人群具有不同的冠心病易感性,從而臨床表現(xiàn)各異,治療效果不同。本研究通過PCR技術(shù)及直接測序法對河北漢族冠心病人群CHI3L1基因rs4950928位點、GP6基因rs1671153位點、rs1654419位點的分布情況進行研究,比較各SNP
2、位點等位基因在冠心病人群及正常對照人群中的分布頻率,揭示CHI3L1基因、GP6基因的SNP位點突變與冠心病發(fā)病的關(guān)系及臨床意義。
方法:本課題選擇2013年1月至2015年12月在河北省滄州市人民醫(yī)院診治的患者,經(jīng)彩色多普勒超聲、冠脈 CT、冠狀動脈造影等檢查確診為冠心病患者共1560例,選取性別年齡匹配的同期健康體檢者900例。除外感染、腫瘤、糖尿病、先心病、嚴重肝腎疾病、自身免疫性疾病、心肌炎、嚴重創(chuàng)傷等疾病。取5ml枸
3、櫞酸鈉抗凝血,測定纖維蛋白原及 D二聚體,取5ml促凝血,用于血清指標和炎癥因子的測定。取5ml EDTA-K2抗凝血,提取基因組 DNA,采用生物學軟件 Primer7.0設(shè)計引物,并與GenBank進行比對。采用PCR方法擴增目的基因片段,直接測序法進行多態(tài)性分析。統(tǒng)計數(shù)據(jù)在SPSS19.0軟件包中完成,各統(tǒng)計指標均以均數(shù)±標準差(mean±SD)表示。用基因計數(shù)法計算各等位基因頻率和基因型頻率;冠心病組與對照組間等位基因頻率和基因
4、型頻率的差異用X2檢驗;并通過逐步Logistic回歸分析CHI3L1基因、GP6基因的SNP位點多態(tài)性與冠心病的關(guān)系。P<0.05為有統(tǒng)計學意義。
結(jié)果:
1冠心病組和對照組相比較,性別、年齡、飲酒史均無統(tǒng)計學差異(P>0.05),而冠心病組的吸煙率和家族史明顯高于正常對照組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
2冠心病組血清中TG、LDL、Glu、Fbg、D-D、HCY、HsCRP、CHI3L1、TNF
5、-α、IL-1、GP6、VCAM的濃度均明顯高于對照組。差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05),HDL的水平明顯低于正常對照組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。
3 CHI3L1基因rs4950928位點CC、CT、TT三種不同的基因型,在冠心病組中的頻率分別為0.7808、0.1558、0.0634,CT+TT的頻率為0.2192, T等位基因的頻率是0.1413,而這三種基因型在對照組中的頻率分別為0.9078、0.0756
6、、0.0166,CT+TT的頻率為0.0922,T等位基因的頻率是0.0544。冠心病組中TT、CT基因型、CT+TT基因型和T等位基因的頻率明顯高于正常對照組,差異有統(tǒng)計學意義(X2=38.38,33.14,64.42,88.37, P<0.05)。
4 GP6基因rs1671153位點CC、CA、AA三種不同的基因型,在冠心病組中的頻率分別為0.9276、0.0500、0.0224,CA+AA的頻率為0.0724, A等位
7、基因的頻率是0.047,而這三種基因型在對照組中的頻率分別為0.9466、0.0467、0.0067,CA+AA的頻率為0.0533,A等位基因的頻率是0.0306。冠心病組中AA基因型和A等位基因的頻率明顯高于正常對照組,差異有統(tǒng)計學意義(X2=8.723,8.811, P<0.05)。
5 GP6基因rs1654419位點TT、TC、CC三種不同的基因型,在冠心病組中的頻率分別為0.9288、0.0411、0.0301,
8、TC+CC的頻率為0.0712, C等位基因的頻率是0.0506,而這三種基因型在對照組中的頻率分別為0.9478、0.0378、0.0144,TC+CC的頻率為0.0522,C等位基因的頻率是0.0805。冠心病組中CC基因型、TC+CC基因型和C等位基因的頻率明顯高于正常對照組,差異有統(tǒng)計學意義(X2=5.96,8.05,P<0.05)。
6逐步Logistic回歸:
(1)以冠心?。ㄓ?1,無=0)為因變量,以
9、CHI3L1基因rs4950928位點基因型(CC=0,CT=1,TT=2)、TNF-α、IL-1、Hs-CRP、家族史(有=1,無=0)、WC、BMI、HCY、Fbg、D-Dimer、TC、TG、HDL、LDL為自變量,進行逐步Logistic回歸分析,發(fā)現(xiàn)基因型、LDL與冠心病的發(fā)病關(guān)系密切,能顯著增加其風險,是其發(fā)病的獨立危險因素,OR(95%CI)值分別為2.475(1.172-6.521),1.597(1.12-2.764)(
10、P<0.05)。
(2)以冠心?。ㄓ?1,無=0)為因變量,以GP6基因rs1671153位點基因型(CC=0,CA=1,AA=2)、TNF-α、IL-1、Hs-CRP、家族史(有=1,無=0)、WC、BMI、HCY、Fbg、D-Dimer、TC、TG、HDL、LDL為自變量,進行逐步Logistic回歸分析,發(fā)現(xiàn)基因型、HCY、LDL與與冠心病的發(fā)病關(guān)系密切,能顯著增加其風險,是其發(fā)病的獨立危險因素,OR(95%CI)值分別
11、為9.576(1.753-52.311),1.728(1.112-4.327),2.237(1.013-7.453)(P<0.05)。
(3)以冠心病(有=1,無=0)為因變量,以GP6基因rs1654419位點基因型(TT=0,TC=1,CC=2)、TNF-α、IL-1、Hs-CRP、家族史(有=1,無=0)、WC、BMI、HCY、Fbg、D-Dimer、TC、TG、HDL、LDL為自變量,進行逐步Logistic回歸分析,
12、發(fā)現(xiàn)基因型、LDL、D-Dimer與冠心病的發(fā)病關(guān)系密切,能顯著增加其風險,是其發(fā)病的獨立危險因素, OR(95%CI)值分別為4.494(1.398-22.292),2.26(1.314-5.13),2.582(1.545-12.218)(P<0.05)。
結(jié)論:
1冠心病組血清中TG、LDL、Glu、Fbg、D-D、HCY、HsCRP、CHI3L1、TNF-α、IL-1、GP6、VCAM的濃度升高與冠心病的發(fā)生密
13、切相關(guān)。
2 CHI3L1基因rs4950928位點基因多態(tài)性在冠心病組的分布明顯高于正常對照組,兩組存在顯著性差異,提示該SNP位點基因多態(tài)型與冠心病密切相關(guān),TT基因型顯著增加了冠心病的發(fā)病風險。
3 GP6基因的rs1671153位點基因多態(tài)性在冠心病組的分布明顯高于正常對照組,兩組存在顯著性差異,提示該SNP位點基因多態(tài)型與冠心病密切相關(guān),AA基因型顯著增加了冠心病的發(fā)病風險。
4 GP6基因的rs
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