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文檔簡介
1、腫瘤的化療耐藥是導(dǎo)致腫瘤患者治療過程中死亡的主要原因,但腫瘤化療耐藥具體的分子機制并不清楚。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類長度大于200nt的非編碼RNA。目前越來越多的研究表明,lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中,發(fā)揮著重要的作用。lncRNA發(fā)揮作用的機制較為復(fù)雜,近年來文獻指出,lncRNA可以通過吸附microRNA間接調(diào)控基因的表達,參與腫瘤進程;可以通過吸附蛋白,對蛋白進行修飾
2、,從而通過調(diào)控蛋白水平發(fā)揮作用;也可以在細胞核中富集,通過招募或者阻礙某些核轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,在基因的表達層面發(fā)揮調(diào)控作用;還可以實現(xiàn)對核小體空間的重新構(gòu)向,繼而改變基因的表達。lncRNA豐富的調(diào)控機制,使得lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程發(fā)揮多種不同的功能。目前已有文獻報道,某些lncRNA參與了腫瘤的化療耐藥過程,可能是導(dǎo)致腫瘤化療耐藥的關(guān)鍵因素。因此,研究lncRNA在腫瘤化療耐藥中的關(guān)鍵作用,將可以闡明腫瘤發(fā)生化療耐藥的新機制,補
3、充腫瘤進展的理論依據(jù),為臨床治療提供新的策略和藥物作用靶點。
目的:本研究通過篩選在胃癌組織中高表達的lncRNA,并分析其在胃癌化療耐藥中的作用。
方法:
(1)通過lncRNA芯片篩選出在胃癌組織中高表達的lncRNA;
(2)通過qRT-PCR技術(shù),在60例胃癌患者中檢測該lncRNA的表達水平,并結(jié)合臨床病理資料,分析該lncRNA的臨床相關(guān)性;
(3)檢測該lncRNA在不同胃
4、癌細胞中的表達情況,并通過干擾慢病毒在高表達該lncRNA的胃癌細胞中降低其表達,形成穩(wěn)定低表達的胃癌細胞系作為模型;
(4)采用CCK8實驗、Transwell實驗、劃痕實驗、流式細胞儀檢測細胞周期、裸鼠皮下成瘤實驗、裸鼠腹腔轉(zhuǎn)移實驗、裸鼠尾靜脈轉(zhuǎn)移實驗,對該lncRNA的功能進行檢測;
(5)通過原位雜交技術(shù),檢測lncRNA在胃癌細胞和胃癌組織中的定位情況;
(6)通過表達譜芯片分析該lncRNA參與
5、細胞的具體功能;
(7)通過RNA pull-down技術(shù)檢測該lncRNA可能結(jié)合的蛋白,并分析其余l(xiāng)ncRNA功能之間的關(guān)系;
(8)檢測lncRNA的表達對于胃癌細胞奧沙利鉑敏感性的影響。
結(jié)果:
(1)篩選在胃癌組織中高表達的lncRNA:我們通過lncRNA芯片篩選出在胃癌組織中高表達的lncRNAs,并通過表達倍數(shù)、表達特異性篩選出15條在胃癌組織中高表達的lncRNA。同時在10例胃
6、癌患者癌組織和癌旁組織中進行驗證,最終確定表達差異最明顯且最有統(tǒng)計學(xué)意義的lncRNA為lncRNA AK095203。
(2)lncRNA AK095203在胃癌組織中的表達情況及其臨床意義:我們通過qRT-PCR實驗,在60例胃癌組織和癌旁組織中檢測lncRNA AK095203的表達情況,發(fā)現(xiàn)lncRNAAK095203在胃癌組織中高表達(P=0.00662),且lncRNA的表達與胃癌大小呈正相關(guān),與胃癌分化程度呈反相
7、關(guān)。
(3)lncRNA AK095203的表達對胃癌細胞行為學(xué)的影響:我們通過構(gòu)建穩(wěn)定低表達的胃癌細胞株SGC7901和BGC823,CCK8實驗發(fā)現(xiàn)lncRNA AK095203的低表達,胃癌細胞的增殖能力受到了明顯抑制;流式細胞儀檢測細胞周期發(fā)現(xiàn),干擾lncRNAAK095203的表達后,胃癌細胞難以進入G2期;Transwell實驗和劃痕實驗表明,干擾lncRNA AK095203可以明顯抑制胃癌細胞的侵襲和遷移能力;
8、裸鼠皮下成瘤實驗、裸鼠腹腔種植轉(zhuǎn)移實驗、裸鼠強制肺轉(zhuǎn)移實驗則從體內(nèi)實驗角度證明了干擾lncRNAAK095203的表達,胃癌細胞的增殖和侵襲能力受到了明顯抑制。
(4)lncRNA AK095203在胃癌細胞和組織中的定位:我們通過原位雜交實驗發(fā)現(xiàn),lncRNAAK095203主要在細胞核中富集。
(5)表達譜芯片分析lncRNA AK095203的具體功能:我們通過表達譜芯片檢測發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA AK0952
9、03的表達后胃癌細胞的細胞分裂相關(guān)基因、DNA損傷修復(fù)相關(guān)基因的表達受到了明顯抑制,提示lncRNA AK095203與細胞分裂、DNA損傷修復(fù)密切相關(guān)。
(6)我們通過RNA pull-down實驗發(fā)現(xiàn),lncRNAAK095203可以與SSRP1和H2A/H2B結(jié)合,而SSRP1與胃癌奧沙利鉑導(dǎo)致的DNA損傷修復(fù)密切相關(guān),lncRNAAK095203可能是通過與SSRP1結(jié)合,從而導(dǎo)致胃癌奧沙利鉑耐藥的。
(7)
10、我們發(fā)現(xiàn)干擾lncRNA AK095203的表達后,胃癌細胞SGC7901和BGC823對奧沙利鉑敏感性明顯增加。
結(jié)論:
(1)我們通過lncRNA芯片和qRT-PCR實驗,篩選出一條在胃癌組織中高表達的lncRNA,即lncRNA AK095203,并通過臨床病理資料分析發(fā)現(xiàn),該lncRNA的表達與胃癌大小、分化程度密切相關(guān)。
(2)轉(zhuǎn)染干擾慢病毒,形成穩(wěn)定抑制lncRNA AK095203表達的細胞系
11、,并通過體內(nèi)體外實驗發(fā)現(xiàn),干擾lncRNA AK095203的表達,胃癌細胞的增殖能力、侵襲能力受到了明顯抑制。
(3)表達譜芯片顯示,lncRNA AK095203的表達,與細胞分裂功能、DNA損傷修復(fù)關(guān)系密切。
(4)通過RNA pull-down實驗和原位雜交聯(lián)合免疫熒光實驗,我們初步證明lncRNAAK095203可以與SSRP1和H2A/H2B結(jié)合。干擾lncRNA AK095203的表達,胃癌細胞對奧沙利
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