基于模糊形態(tài)學(xué)和分水嶺的蛋白質(zhì)點檢測方法研究.pdf

1、二維凝膠圖像的差異蛋白質(zhì)點提取與分析是凝膠電泳技術(shù)的核心內(nèi)容，而凝膠電泳技術(shù)是目前蛋白質(zhì)組學(xué)的重要研究方法之一，該技術(shù)不僅能有效地分離蛋白質(zhì)點，而且被用于蛋白質(zhì)點作定性、定量的研究中。本文結(jié)合國家自然科學(xué)基金項目和江西省自然科學(xué)基金項目，以二維凝膠電泳圖像中蛋白質(zhì)點檢測為研究重點，主要工作、研究成果和創(chuàng)新點如下：
　　(1)對凝膠圖像蛋白質(zhì)點檢測的相關(guān)理論知識進行了系統(tǒng)研究。詳細闡述了圖像預(yù)處理的各種方法和原理、傳統(tǒng)分水嶺變換算法

2、原理以及各種改進的分水嶺變換算法存在的問題，由此提出了基于標(biāo)記控制的分水嶺算法，該算法集合了前幾種分水嶺算法的優(yōu)點，簡單有效。
　　(2)針對蛋白質(zhì)點檢測過程中易出現(xiàn)過分割、邊緣不連續(xù)和蛋白質(zhì)點漏檢等問題，提出了基于標(biāo)記控制分水嶺的蛋白質(zhì)點區(qū)域檢測方法。首先，利用常見的和改進的濾波方法，避免了條紋、裂紋以及背景變換等干擾；然后，采用兩次基于標(biāo)記控制的分水嶺變換，減少了偽極值點，有效地去除了大部分非蛋白質(zhì)點區(qū)域；最后，為了能得到合格

3、的蛋白質(zhì)點區(qū)域，提出了一個蛋白質(zhì)點區(qū)域的合格判定準則。多幅凝膠圖像的實驗結(jié)果表明，該方法能很好地檢測出大部分蛋白質(zhì)點區(qū)域，避免了圖像過分割、目標(biāo)邊緣不連續(xù)和蛋白質(zhì)點區(qū)域漏檢等問題，具有良好的魯棒性和實用性。
　　(3)針對蛋白質(zhì)點檢測過程中飽和蛋白質(zhì)點重疊的問題，提出了基于標(biāo)記控制分水嶺的重疊蛋白質(zhì)點分割方法。該方法采用連通域標(biāo)記和距離變換方法正確找出重疊蛋白質(zhì)點區(qū)域，并進行第三次分水嶺變換，完成了重疊蛋白質(zhì)點的分割。對具有重疊蛋