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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)1、氨基酸(amino acid, aa): 蛋白質(zhì)多肽鏈的基本結(jié)構(gòu)單位 蛋白質(zhì)多肽鏈的基本結(jié)構(gòu)單位, 或稱構(gòu)件分子、 構(gòu)造單元 (buildingblock)2、旋光性:旋光物質(zhì)使平面偏振光的偏振面發(fā)生旋轉(zhuǎn)的能力3、氨基酸的等電點(diǎn) 氨基酸的等電點(diǎn):當(dāng)氨基酸在某一 pH 值時(shí),氨基酸所帶正電荷和負(fù)電荷相等,即凈電荷為零,此時(shí)的 pH 值稱為氨基酸的等電點(diǎn), 用 pI 表示。氨基酸在等電點(diǎn)時(shí)主要以兼性離子形式存在4、肽鍵:一個(gè)氨基酸
2、的氨基與另一個(gè)氨基酸的羧基之間失水形成的酰胺鍵稱為肽鍵,所形成的化合物稱為肽。組成肽的氨基酸單元稱為氨基酸殘基5、氨基酸順序:在多肽鏈中,氨基酸殘基按一定的順序排列,這種排列順序6、蛋白質(zhì):成百上千個(gè)氨基酸分子以肽鍵相連,組成的長鏈分子(多肽鏈)7、蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)多肽鏈的氨基酸排列順序和連接方式8、同源蛋白質(zhì) 同源蛋白質(zhì):進(jìn)化上相關(guān)的一組蛋白質(zhì),它們常在不同物種中行使著相同的功能9、序列同源性 序列同源性:同源蛋白質(zhì)的氨基酸序
3、列具有明顯的相似性,這種相似性稱序列同源性10、不變殘基 不變殘基: 同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列中有許多位置的氨基酸殘基對所有已經(jīng)研究過的物種來說都是相同的,稱為不變殘基11、可變殘基 可變殘基:其它位置的氨基酸殘基對不同物種有相當(dāng)大的變化,稱可變殘基12、進(jìn)化樹: 根據(jù)同源蛋白質(zhì)氨基酸差異數(shù)所提供的信息可以構(gòu)建物種進(jìn)化樹, 顯示在進(jìn)化過程中各個(gè)物種的起源和出現(xiàn)順序13、疏水相互作用 疏水相互作用: 非極性分子進(jìn)入水中, 有聚集在一起形成最
4、小疏水面積的趨勢, 保持這些非極性分子聚集在一起的作用則稱為疏水作用。 對蛋白質(zhì)來說, 在水相溶液中, 球狀蛋白質(zhì)的折疊總是傾向于把疏水殘基埋藏在分子的內(nèi)部,這種現(xiàn)象可稱為疏水作用14、鹽鍵 鹽鍵(又稱離子鍵):正電荷和負(fù)電荷之間的一種靜電作用15、肽平面 肽平面: 因?yàn)殡逆I不能自由旋轉(zhuǎn), 所以肽鍵的四個(gè)原子和與之相連的兩個(gè)α碳原子共處一個(gè)平面,稱肽平面16、蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)主鏈的折疊產(chǎn)生的有規(guī)則的構(gòu)象。17
5、、二級結(jié)構(gòu)元件 二級結(jié)構(gòu)元件:主要有α-螺旋、β-折疊片、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲18、影響α-螺旋穩(wěn)定性的 5 個(gè)因素:相連殘基 R 基團(tuán)的靜電排斥或吸引相鄰 R 基的大小相隔 3 個(gè)殘基的 R 基的相互作用Pro 和 Gly 的出現(xiàn)α-螺旋末端 aa 殘基的極性19、超二級結(jié)構(gòu) 超二級結(jié)構(gòu):相鄰的二級結(jié)構(gòu)元件組合在一起, 彼此相互作用, 形成有規(guī)則, 在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合或二級結(jié)構(gòu)串,充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件,稱為超二級結(jié)構(gòu)。20、結(jié)構(gòu)
6、域 結(jié)構(gòu)域: 多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)及超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上, 進(jìn)一步卷曲折疊, 形成三級結(jié)構(gòu)的局部折疊區(qū),它是相對獨(dú)立的緊密球狀實(shí)體,稱為結(jié)構(gòu)域21、蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu): 一個(gè)蛋白質(zhì)中所有原子的整體排列被稱為蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)。 包括一級結(jié)構(gòu)中相距遠(yuǎn)的肽段之間的幾何相互關(guān)系和側(cè)鏈在三維空間中彼此間的相互關(guān)系22、寡聚蛋白 寡聚蛋白:由兩個(gè)或兩個(gè)以上獨(dú)立的球狀蛋白質(zhì)通過非共價(jià)鍵結(jié)合成的多聚體23、亞基:寡聚蛋白中的每個(gè)獨(dú)立的球狀蛋白質(zhì)稱
7、為亞基( subunit),亞基一般由一條肽鏈構(gòu)成,也稱為單體(monomer)24、原體: 對稱的寡聚蛋白質(zhì)分子可視為是由兩個(gè)或多個(gè)不對稱的相同結(jié)構(gòu)成分組成, 這種相同結(jié)構(gòu)成分被稱為原體或原聚體25、蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu): 指亞基的種類、 數(shù)量以及各個(gè)亞基在寡聚蛋白質(zhì)中的空間排布和亞等電聚焦(IEF):等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)混合物的各組分將分別聚焦在各自等電點(diǎn)相應(yīng)的 pH 位置上雙向電泳43、透析法: 透析是利用蛋白質(zhì)分子不
8、能通過半透膜的性質(zhì), 使蛋白質(zhì)和其它小分子物質(zhì)分開44、超濾: 用壓力或離心力, 強(qiáng)行使水和其他小分子溶質(zhì)通過半透膜, 而蛋白質(zhì)被截留在膜上,以達(dá)到濃縮和脫鹽的目的45、協(xié)同效應(yīng) 協(xié)同效應(yīng): 一個(gè)寡聚體蛋白質(zhì)的一個(gè)亞基與其配體結(jié)合后, 能影響此寡聚體中其他亞基與配體結(jié)合能力的現(xiàn)象,稱為協(xié)同效應(yīng)46、別構(gòu)效應(yīng) 別構(gòu)效應(yīng): 配體與寡聚蛋白質(zhì)上的一個(gè)部位結(jié)合將通過構(gòu)象變化影響同一蛋白質(zhì)分子上其他結(jié)合部位的結(jié)合親和力。具有別構(gòu)效應(yīng)的蛋白質(zhì)稱為別
9、構(gòu)蛋白47、同促效應(yīng) 同促效應(yīng):作用物和效應(yīng)物為同一種物質(zhì)48、異促效應(yīng) 異促效應(yīng):作用物和效應(yīng)物不同49、BPG BPG 效應(yīng) 效應(yīng):BPG 降低了血紅蛋白對 O2 的親和力50、波爾效應(yīng):H+、CO2 促進(jìn) O2 的釋放51、分子病 分子病: 蛋白質(zhì)分子一級結(jié)構(gòu)的改變有可能引起其生物功能的顯著變化, 甚至引起疾病核酸1、DNA DNA 的一級結(jié)構(gòu) 的一級結(jié)構(gòu):DNA 是 dAMP、dGMP、dCMP、 dTMP 通過 3’,5’-磷
10、酸二酯鍵連接 起來的線形或環(huán)形多聚體,沒有分支DNA DNA 的二級結(jié)構(gòu) 的二級結(jié)構(gòu):雙螺旋結(jié)構(gòu)。兩條反向平行(一條 5’→3’,另一條 3’→5’)的多核苷酸鏈繞同一中心軸相互纏繞,形成右手雙股螺旋。2、DNA DNA 的三級結(jié)構(gòu) 的三級結(jié)構(gòu):DNA 在雙螺旋的基礎(chǔ)上通過扭曲和折疊形成的構(gòu)象超螺旋 超螺旋:DNA 分子的一種扭曲狀態(tài)。當(dāng)將線性過旋或欠旋的雙螺旋DNA 連接形成一個(gè)環(huán)時(shí),都會自動形成額外的超螺旋來抵消過旋或欠旋造成的張力
11、,目的是維持B 構(gòu)象。過旋 DNA會自動形成額外右手螺旋,而欠旋形成額外左手螺旋,稱為負(fù)超螺旋。3、環(huán)狀 DNA 的三種典型構(gòu)象:①松弛環(huán)狀 DNA 線形 DNA 直接環(huán)化②解鏈環(huán)狀 DNA 線形 DNA擰松后再環(huán)化③超螺旋 DNA4、連環(huán)數(shù) 連環(huán)數(shù):指一條鏈以右手螺旋繞另一條鏈的次數(shù)5、扭轉(zhuǎn)數(shù) 扭轉(zhuǎn)數(shù):Watson-Crick 螺旋數(shù)目6、超螺旋存在的意義:(1)超螺旋 DNA 具有更致密的結(jié)構(gòu),在細(xì)胞內(nèi)所占體積更為經(jīng)濟(jì)。(2)負(fù)超螺
12、旋導(dǎo)致 DNA 易于解鏈,有利于 DNA 參與復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、重組等過程。7、基因:DNA 分子上攜帶并傳遞遺傳信息的單位8、基因組: 指生物體所含的全部基因。對于真核生物,常指單倍體基因組9、內(nèi)含子 內(nèi)含子:基因中不編碼的居間序列,不出現(xiàn)于成熟的 mRNA 分子中10、外顯子 外顯子:基因中為蛋白質(zhì)編碼的片段11、 斷裂基因 斷裂基因: 大多數(shù)為蛋白質(zhì)編碼的基因都含有內(nèi)含子和外顯子。 由于內(nèi)含子的存在使基因成為不連續(xù)基因或斷裂基因12、R
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