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1、1第一章 第一章 核酸的結(jié)構(gòu)與功能 核酸的結(jié)構(gòu)與功能DNA 的變性: 的變性:在理化因素作用下,DNA 堿基對間的氫鍵斷裂,雙螺旋解開成為單鏈,從而導(dǎo)致 DNA 的理化性質(zhì)即生物學(xué)性質(zhì)發(fā)生改變,這種現(xiàn)象稱為 DNA 的變性。這是一個躍變過程,伴有增色效應(yīng),DNA 功能喪失。DNA 的復(fù)性: 的復(fù)性:在一定條件下,變性 DNA 單鏈間堿基重新配對,恢復(fù)雙螺旋結(jié)構(gòu),伴有 A260 減?。p色效應(yīng)) ,DNA功能恢復(fù)。 (將變性 DNA 經(jīng)退
2、火處理,使其重新形成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過程,稱為 DNA 的復(fù)性。 ) 增色效應(yīng)和減色效應(yīng): 增色效應(yīng)和減色效應(yīng):當(dāng)將 DNA 的稀鹽溶液加熱到 80-100°C 時,雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)生解體,兩條鏈分開,形成無規(guī)則線團(tuán),一系列理化性質(zhì)也隨之改變:變性后,260nm 紫外吸收值升高,此效應(yīng)稱之為增色效應(yīng)。 核酸的光吸收值常比其各核苷酸成分的光吸收值之和少 30%-40%。這是在有規(guī)律的雙螺旋結(jié)構(gòu)中堿基緊密地堆積在一起造成的。這
3、種現(xiàn)象叫做 DNA 的減色效應(yīng)。增色效應(yīng): 增色效應(yīng):當(dāng) DNA 從雙螺旋結(jié)構(gòu)變?yōu)閱捂湹臒o規(guī)則卷曲狀態(tài)時,它在 260nm 處的吸收便增加,這叫增色效應(yīng)。減色效應(yīng): 減色效應(yīng):DNA 在 260nm 出的光密度比在 DNA 分子中各個堿基在 260nm 處吸收的光密度的總和小得多(約少 35%-40%) ,這種現(xiàn)象稱為減色效應(yīng)。分子雜交: 分子雜交:不同來源的 DNA 單鏈間或單鏈 DNA 與 RNA 之間只要有堿基配對的區(qū)域,在復(fù)性時
4、可形成局部雙螺旋區(qū),稱為核酸分子雜交。 核酸探針 核酸探針:是以研究和診斷為目的,用來檢測特定序列核酸(DNA 或 RNA)的 DNA 片段或 RNA 片段,稱為核酸探針。 回文結(jié)構(gòu) 回文結(jié)構(gòu):脫氧核苷酸的排列在 DNA 兩條鏈中的順讀與倒讀意義是一樣的,脫氧核苷酸以一個假想的軸稱為 180°對稱,這種結(jié)構(gòu)稱為回問結(jié)構(gòu)。回文序列: 回文序列:DNA 分子中以某一中心區(qū)域為對稱軸,中心區(qū)域一側(cè)的堿基序列旋轉(zhuǎn)
5、 180°后與另一側(cè)的堿基序列對稱重復(fù)。 Tm 值: 值:DNA 變性發(fā)生在一個很窄的溫度范圍內(nèi),通常把熱變性過程中 A260 達(dá)到最大值一半時的溫度稱為該 DNA 的溶解溫度或熔點(diǎn),用 Tm 表示。 Chargaff 定律: 定律:腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩爾數(shù)相等,即 A=T;鳥嘌呤和胞腺嘧啶的摩爾數(shù)也相等,即 G=C;含氨基的堿基總數(shù)等于含酮基堿基總數(shù),即 A+C=G+T。? 嘌呤的總數(shù)等于嘧啶的總數(shù),即 A
6、+G=C+T。 堿基互補(bǔ)規(guī)律: 堿基互補(bǔ)規(guī)律:在形成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過程中,由于各種堿基的大小與結(jié)構(gòu)的不同,使得堿基之間的互補(bǔ)配對只能在 G-C(或 C-G)和 A-T(或 T-A)之間進(jìn)行,這種堿基配對的規(guī)律,稱為堿基配對規(guī)律(互補(bǔ)規(guī)律) 。 超螺旋 超螺旋 DNA:雙螺旋 DNA 進(jìn)一步扭曲所形成的麻花狀構(gòu)象。超螺旋 DNA 比雙螺旋 DNA 分子更緊密。雙螺旋的 DNA分子通過自身的多次轉(zhuǎn)動扭曲形成螺旋的螺旋結(jié)構(gòu),稱為超螺
7、旋結(jié)構(gòu);大多數(shù)天然 DNA 分子為負(fù)超螺旋。拓?fù)洚悩?gòu)酶: 拓?fù)洚悩?gòu)酶:是一類剪接 DNA 分子、改變 DNA 拓?fù)錉顟B(tài)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶在 DNA 復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和重組中起重要作用。順反子: 順反子:基因功能的單位,一段染色體,它是一種多肽鏈的密碼,一種結(jié)構(gòu)基因。1、某 、某 DNA 樣品含腺嘌呤 樣品含腺嘌呤 15.1%(按摩爾堿基計) (按摩爾堿基計) ,計算其余堿基的百分含量。 ,計算其余堿基的百分含量。2、DNA 和 RNA 的結(jié)構(gòu)和
8、功能在化學(xué)組成、分子結(jié)構(gòu)、細(xì)胞內(nèi)分布和生理功能上的主要區(qū)別是什么? 的結(jié)構(gòu)和功能在化學(xué)組成、分子結(jié)構(gòu)、細(xì)胞內(nèi)分布和生理功能上的主要區(qū)別是什么?DNA RNA 化學(xué)組成 DNA 中的戊糖是β-D-2'-脫氧核糖DNA 中的堿基是 A、G、C、T脫氧核糖核苷核苷酸:dAMP、dGMP、dCMP、dTMPRNA 中的戊糖是β-D-核糖RNA 中的堿基是 A、G、C、U核糖核苷核苷酸:AMP、GMP、CMP、UMP分子結(jié)構(gòu) 一級結(jié)構(gòu)二級
9、結(jié)構(gòu):雙螺旋結(jié)構(gòu)、三鏈三級結(jié)構(gòu):超螺旋大多數(shù)天然 RNA 分子是一條單鏈,其可以發(fā)生分子自身回折,而使互補(bǔ)堿基區(qū)形成局部類似 DNA 的雙螺旋區(qū)。不能配對的堿基區(qū)域則形成突環(huán),不同的 RNA 分子因堿基序列不同而具有不同比例的雙螺旋區(qū)。tRNA 二級結(jié)構(gòu):單鏈、三葉草形、四臂四環(huán)tRNA 三級結(jié)構(gòu):在二級結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上進(jìn)一步折疊扭曲形成倒 L型細(xì)胞內(nèi)分布在真核細(xì)胞中,DNA 主要集中在細(xì)胞核線粒體和葉綠體中均有各自的 DNA原核細(xì)胞,DNA
10、 存在于類核細(xì)胞質(zhì),少量存在于細(xì)胞核生理功能 DNA 是遺傳物質(zhì),是遺傳信息的載體、 RNA 負(fù)責(zé)遺傳信息的表達(dá),它轉(zhuǎn)錄 DNA 的遺傳信息,直接參3以測定多肽和蛋白質(zhì)含量。蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指多肽中氨基酸的排列順序,其維系鍵是肽鍵,包括二硫鍵的位置,稱為蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu),這是蛋白質(zhì)最基本的結(jié)構(gòu),它內(nèi)寓著決定蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)和生物功能的信息。肽平面: 肽平面:肽鍵具有部分雙鍵的性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn),組成肽鍵的四個原子及其
11、相鄰的兩個α碳原子處在同一個平面,為剛性平面,稱為肽平面或酰胺平面。二面角: 二面角:肽平面之間的 Cα分別以兩個單鍵(Cα-N1)和(Cα-C2)與兩個肽平面相連。繞 Cα-N1 鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱為φ角,繞 Cα-C2 鍵旋轉(zhuǎn)的角度稱為ψ角,這個旋轉(zhuǎn)角度叫二面角,可表示出相鄰的兩個肽平面的相對位置。蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):肽鏈主鏈不同肽段通過自身的相互作用、形成氫鍵,沿某一主軸盤旋折疊而形成的局部空間結(jié)構(gòu),因此是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
12、的構(gòu)象單元,主要有α-螺旋、β-折疊和無規(guī)則卷曲等。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu): 蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):指的是多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,通過側(cè)鏈基團(tuán)的相互作用進(jìn)一步卷曲折疊,借助次級鍵(氫鍵、疏水鍵、范德華力、離子鍵等)維系使α-螺旋、β-折疊片、β-轉(zhuǎn)角等二級結(jié)構(gòu)相互配置而形成的特定的構(gòu)象。三級結(jié)構(gòu)的形成使肽鏈中所有的原子都達(dá)到空間上的重新排布。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):由相同或不同亞基按照一定排布方式聚合而成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),維持司機(jī)結(jié)構(gòu)穩(wěn)
13、定的作用力是疏水鍵、離子鍵、氫鍵、范德華力。亞基是指參與構(gòu)成蛋白質(zhì)司機(jī)結(jié)構(gòu)的而又具有獨(dú)立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈。超二級結(jié)構(gòu): 超二級結(jié)構(gòu):指丟失多肽鏈上若干相鄰的構(gòu)象單元(如α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角等)彼此作用,進(jìn)一步組合成有規(guī)則的結(jié)構(gòu)組合體,如α螺旋-β轉(zhuǎn)角-α螺旋。結(jié)構(gòu)域: 結(jié)構(gòu)域:是存在于球狀蛋白質(zhì)分子中的兩個或多個相對獨(dú)立的、在空間上能辨認(rèn)的三維實體,每個由二級結(jié)構(gòu)組合而成,充當(dāng)三級結(jié)構(gòu)的構(gòu)件,其間由單肽鏈連接。蛋白質(zhì)變性與復(fù)性
14、蛋白質(zhì)變性與復(fù)性:當(dāng)天然蛋白質(zhì)受到某些理化因素的影響,使其分子內(nèi)部原有的高級結(jié)構(gòu)發(fā)生變化時,蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和生物學(xué)功能都隨之改變或喪失,但并未導(dǎo)致蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的變化,這種現(xiàn)象叫變性作用,變性后的蛋白質(zhì)稱為變性蛋白。蛋白質(zhì)的變性作用如果不過于劇烈,則是一種可逆過程。高級結(jié)構(gòu)松散了的變性蛋白質(zhì)通常在去除變性因素后,可緩慢地重新自發(fā)折疊形成原來的構(gòu)象,恢復(fù)原有的理化性質(zhì)和生物活性,這種現(xiàn)象稱為復(fù)性。 分子?。?分子病:由于基因突變導(dǎo)致蛋白
15、質(zhì)一級結(jié)構(gòu)發(fā)生變異,使蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能減退或喪失,甚至造成生理功能的變化而引起的疾病,稱為分子病。鹽析: 鹽析:在蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽,以破壞蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì),使蛋白質(zhì)從溶液中沉淀析出,稱為鹽析。別構(gòu)效應(yīng): 別構(gòu)效應(yīng):通過空間構(gòu)象的轉(zhuǎn)變來完成生物學(xué)功能。1、 為什么說蛋白質(zhì)是生命活動最重要的物質(zhì)基礎(chǔ)?蛋白質(zhì)元素組成有何特點(diǎn)? 為什么說蛋白質(zhì)是生命活動最重要的物質(zhì)基礎(chǔ)?蛋白質(zhì)元素組成有何特點(diǎn)?P29答:生物體最主要的特征是生命活
16、動,而蛋白質(zhì)是生命活動的體現(xiàn)者:酶是以蛋白質(zhì)為主要成分的生物催化劑,代謝反應(yīng)幾乎都是在酶的催化下進(jìn)行的。結(jié)構(gòu)蛋白參與細(xì)胞和組織的建成,如微管蛋白、伸展蛋白、膠原蛋白等。某些動物激素是蛋白質(zhì),如胰島素、生長素、促卵泡激素、促甲狀腺激素等,在代謝調(diào)節(jié)中具有十分重要的意義。運(yùn)動蛋白如肌肉中的肌動蛋白、肌球蛋白以及鞭毛和纖毛蛋白與肌肉收縮和細(xì)胞運(yùn)動有關(guān)。高等動物的抗體、補(bǔ)體、干擾素等蛋白質(zhì)具有防御功能。某些蛋白質(zhì)具有運(yùn)輸功能,如血紅蛋白和肌紅蛋
17、白運(yùn)輸氧;脂蛋白運(yùn)輸脂類。激素和神經(jīng)遞質(zhì)的受體蛋白有接受和傳遞信息的功能。細(xì)胞表面抗原參與免疫反應(yīng)和細(xì)胞識別。染色質(zhì)蛋白、阻遏蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等參與基因表達(dá)的調(diào)控;細(xì)胞周期蛋白等具有調(diào)控細(xì)胞分裂、增殖、生長、分化的功能。種子貯藏蛋白、卵白蛋白、血漿白蛋白等具有貯存氨基酸和蛋白質(zhì)的功能。蛋白質(zhì)主要元素組成:C、H、O、N、S 及 P、Fe、Cu、Zn、I、Se 等微量元素。蛋白質(zhì)平均含 N 量為 16%,這是凱氏定氮法測定蛋白質(zhì)含量的理論依
18、據(jù)。蛋白質(zhì)含量=蛋白質(zhì)含氮量*6.252、試比較較 、試比較較 Gly、Pro 與其它常見氨基酸結(jié)構(gòu)的異同,它們對多肽鏈二級結(jié)構(gòu)的形成有何影響? 與其它常見氨基酸結(jié)構(gòu)的異同,它們對多肽鏈二級結(jié)構(gòu)的形成有何影響?答:都含一個氨基羧基 H 與側(cè)鏈基團(tuán),Pro 側(cè)鏈基團(tuán)與α氨基酸形成環(huán)化結(jié)構(gòu),亞氨基酸,Gly 不含手性碳原子。由于 Pro 的亞氨基參與形成肽鍵之后,氮原子上已米有氫原子,無法充當(dāng)氫鍵供體,致使α-螺旋在該處中斷,并產(chǎn)生一個“結(jié)
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