分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第1頁
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文檔簡介

1、現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手冊現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手冊工具酶工具酶基因工程:在人工可以控制條件下,將基因剪切或重新組合,再導(dǎo)入另一生物體內(nèi),使這些基因在其中表達(dá)并遺傳下去的一門技術(shù)。核心:對基因進(jìn)行人工切割、連接和重新組合,構(gòu)建重組DNA。工具酶:在基因工程的重組DNA過程中,所需要用到的酶的統(tǒng)稱。一、限制性內(nèi)切酶(限制性內(nèi)切酶(restrictionendonuclease)主要功能:對外源性的雙鏈DNA進(jìn)行切割、水解,不允許外源性DNA存在于

2、細(xì)菌自身細(xì)胞內(nèi)。(這種酶能對在自身細(xì)胞內(nèi)存在的DNA種類給予限制——限制性內(nèi)切酶)限制修飾系統(tǒng):合成限制性內(nèi)切酶的細(xì)胞,其自身的DNA不受酶的切割,這是因?yàn)榧?xì)菌細(xì)胞還會(huì)合成一種修飾酶,可以對自身DNA進(jìn)行修飾,即改變DNA原來具有的可以被限制性內(nèi)切酶識別的核酸順序結(jié)構(gòu),從而不被限制性內(nèi)切酶識別及切割、水解。保護(hù)自身遺傳物質(zhì)穩(wěn)定的機(jī)制。限制性內(nèi)切酶:從原核生物中發(fā)現(xiàn)的,約600種,可識別108種不同的特定DNA順序。以內(nèi)切方式水解核酸鏈中

3、的磷酸二酯鍵,產(chǎn)生DNA片段的5’端為P,3’端為OH。命名:獲得該酶的細(xì)菌屬名的第一個(gè)字母(大寫)該菌種名的前兩個(gè)字母(小寫)株系的字母(小寫)或數(shù)字羅馬數(shù)字(同一株菌種不同內(nèi)切酶的編號)例:細(xì)菌屬名細(xì)菌種名菌株名稱限制酶名稱ArthrobacterluteusAluIEscherichiacoliRY13EcIBacillusamyloliquefaciensHHamHIHaemophilusinfluenzaeRdHindIII(

4、一)三種常用內(nèi)切酶(一)三種常用內(nèi)切酶1.I型限制性內(nèi)切酶型限制性內(nèi)切酶同時(shí)兼有切割DNA的功能和修飾酶的修飾功能。在酶的識別位點(diǎn)上,若DNA兩條鏈菌沒有發(fā)生甲基化,則行使內(nèi)切酶的功能,對DNA進(jìn)行切割,同時(shí)轉(zhuǎn)變成ATP酶。若DNA雙鏈中有一條鏈已發(fā)生甲基化,則此類酶顯示修飾酶的作用,對另一條DNA進(jìn)行甲基化修飾,然后在行切割功能。(實(shí)際上,有內(nèi)切酶、修飾酶、ATP酶及解旋酶四種功能)I型限制性內(nèi)切酶在DNA鏈上的識別位點(diǎn)和切割位點(diǎn)不一

5、致,也不固定。沒有時(shí)間應(yīng)用價(jià)值?!綝NA甲基化:DNA化學(xué)修飾的一種形式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)(外遺傳機(jī)制)。多發(fā)生于CpG二核苷序列上(在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG兩個(gè)核苷酸中的胞嘧啶被選擇性添加甲基,形成5甲基胞嘧啶)。甲基化位點(diǎn)可隨DNA的復(fù)制而遺傳(DNA復(fù)制后,甲基化酶用選擇專一性不同而產(chǎn)生相同黏性末端的兩種酶切割兩條不同的DNA片段,可使重組后的DNA片段不再被原來的酶所切割。如:SalI酶切割后

6、產(chǎn)生的黏性末端,XhoI酶切割后產(chǎn)生的黏性末端,兩者經(jīng)連接酶連接產(chǎn)生的序列,既不被SalI酶切割,也不被XhoI酶切割。②在同一位置上切割DNA雙鏈,產(chǎn)生平頭末端。如:(二)其他類型內(nèi)切酶(二)其他類型內(nèi)切酶1.同工酶(Boschizomer):來源不同的兩種II型內(nèi)切酶,它們識別核苷酸順序及切割位點(diǎn)都相同,差別只在于當(dāng)識別核苷酸序列中有甲基化的核苷酸時(shí),一種內(nèi)切酶可以切割,而另一種不能。如:HpaII和MspI識別順序都是5’CCGG

7、3’,若其中有5甲基胞嘧啶,則只有Msp酶可切割(GGmCC)。2.Subset酶:識別順序及切割位點(diǎn)相互有關(guān)的酶,互稱Subset酶。如:SamI酶所識別的6個(gè)核苷酸順序中含有HpaII酶識別的4個(gè)核苷酸順序。所以這兩個(gè)酶可以相互代替使用,它們所切割的DNA片段可以相互連接。3.可變酶(特殊的):識別核苷酸順序一般都大于6個(gè),但其中一個(gè)或幾個(gè)核苷酸時(shí)可以變化的。4.遠(yuǎn)距離切割酶:識別核苷酸順序的位置與切割的位點(diǎn)不一致,一般切割位點(diǎn)與指

8、標(biāo)核苷酸順序的位置之間有10個(gè)左右核苷酸的距離。與I型內(nèi)切酶相似,不過I型內(nèi)切酶識別位點(diǎn)與切割位點(diǎn)的距離更遠(yuǎn)一些。(三)甲基化酶(不屬于內(nèi)切酶)(三)甲基化酶(不屬于內(nèi)切酶)使識別順序中的某個(gè)核苷酸發(fā)生甲基化,保護(hù)DNA不被限制性內(nèi)切酶切開。M5C(5甲基胞嘧啶)大多數(shù)以M5CpG的形式存在,即CpG島中的C最容易是甲基化的底物,而甲基化又與受之調(diào)控的基因的表達(dá)程度有關(guān)。因此,研究CpG島的甲基化是研究基因調(diào)控的一個(gè)重要方向。當(dāng)甲基化酶

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