遺傳性腫瘤科室會(huì)v1.1

1、二代測(cè)序助力 遺傳性腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),胡 元 華大基因腫瘤產(chǎn)品部,Cancer is a genetic disease — that is, cancer is caused by certain changes to genes that control the way our cells function, especially how they grow and divide. 《NCI-The G

2、enetics of Cancer》,,癌癥是一種基因病,· 除遺傳性腫瘤，所有惡性腫瘤（癌癥）的發(fā)生都是體細(xì)胞基因突變導(dǎo)致的。· 在人的一生中，腫瘤細(xì)胞是通過一系列進(jìn)行性的改變而逐漸變成惡性的。,Genetics, Genomics and Cancer Risk Assessment: State of the art and future directions in the era of personaliz

3、ed medicine,人類基因研究史,,,腫瘤也會(huì)遺傳嗎？,各類腫瘤中遺傳性腫瘤的占比,AACR cancer progress report 2015,腫瘤的治療效果與發(fā)現(xiàn)時(shí)期有關(guān),癌癥防控：早發(fā)現(xiàn) 早診斷 早治療,Ref：WHO world cancer report,世界衛(wèi)生組織（WHO）- “ 抗擊癌癥 重在預(yù)防！”,1/3的癌癥可以預(yù)防1/3的癌癥可以根治1/3

4、的經(jīng)過治療可以長期生存,,,疫苗（宮頸癌疫苗，乙肝疫苗）生物制劑（胸腺肽、卡介菌多糖）,自檢血清學(xué)（CEA、CA199）影像學(xué)（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,病理診斷手術(shù)放療化療靶向治療,血清學(xué)（CEA、CA199）影像學(xué)（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,,傳統(tǒng)方法,,,,遺傳性腫瘤基因檢測(cè),,基因科技,,,,根據(jù)腫瘤基因變異及免疫組庫情況，進(jìn)行病情監(jiān)測(cè)并及時(shí)調(diào)整治療方案,無創(chuàng)腫瘤早早篩,基于基因

5、突變的精準(zhǔn)檢測(cè)及個(gè)體化用藥方案,基因科技助力腫瘤精準(zhǔn)預(yù)防,臨床基因檢測(cè)的方法,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR：qPCR，dPCR，ARMS,……)熒光原位雜交技術(shù)(FISH)一代測(cè)序（Sanger sequencing）二代測(cè)序（Next-generation sequencing）,,如果將人生比作一本自傳，那么不同的基因檢測(cè)方法，就像不同的檢索方式，以此探索生命的密碼。,位點(diǎn)檢測(cè)是在目錄中檢索某個(gè)關(guān)鍵詞基因芯片是在全書中檢索某個(gè)

6、關(guān)鍵詞二代測(cè)序是在全書中檢索所有關(guān)鍵詞,臨床基因檢測(cè)方法的差別,腫瘤有遺傳性和散發(fā)性之分,美國癌癥學(xué)會(huì)（www.cancer.org） Brozek I et al. J Appl Genet 2009; 50(4): 379–384,‘第一次打擊’ 是胚系突變所有體細(xì)胞均成為雜合BRCA,‘第二次打擊’ 是腫瘤細(xì)胞的突變導(dǎo)致細(xì)胞失去雜合性,所有體細(xì)胞均為野生型,僅病灶處腫瘤細(xì)胞突變,,,與生俱來（胚系突變） VS 與時(shí)俱進(jìn)（體細(xì)胞

7、突變）,由于遺傳性原因?qū)е碌娜旧w和基因異常，特別是常染色體及其上的基因，而使患某些腫瘤的機(jī)會(huì)大大增加，病理學(xué)上稱之為遺傳性腫瘤綜合征,,家族性/遺傳性腫瘤人群特征,· 僅用于初步判斷人群是否具有家族性/遺傳性腫瘤的特征。· 各種遺傳性腫瘤高危篩查人群的判斷需綜合臨床表現(xiàn)和權(quán)威指南的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。,遺傳性乳腺癌卵巢癌綜合征,,遺傳性乳腺癌/卵巢癌相關(guān)基因在乳腺癌人群中的檢出情況,由于遺傳性原因?qū)е碌娜旧w和基因異常，特

8、別是常染色體及其上的基因，而使患某些腫瘤的機(jī)會(huì)大大增加，病理學(xué)上稱之為遺傳性腫瘤綜合征。,Nils et al. Dtsch Arztebl 2008; 105(41): 706–14 http://www.breastlink.com/blog/nimmi-s-kapoor-md-gene-tests-asbs/,,遺傳風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估： 基因檢測(cè),遺傳易感基因與乳腺癌/卵巢癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

9、,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,乳腺癌(31%-56%),卵巢癌(2%-19%),,,BRCA1 突變 BRCA2 突變,BRCA1,BRCA 2,BRCA1——定位于17q21，約10

10、0 kb，含有24個(gè)外顯子，其中第1、4號(hào)外顯子不編碼氨基酸，另外22個(gè)轉(zhuǎn)錄出7.6 kb mRNA，最終可編碼含1863個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。而第11號(hào)外顯子較大，長3.4 kb。 已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于1785個(gè)BRCA2——定位在13q12-13，有27個(gè)外顯子,僅編碼區(qū)就有11.4K。其中11號(hào)外顯子幾乎含編碼序列的一半，完整的BRCA2編碼3418個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì) 。已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于2011個(gè),參考數(shù)據(jù)庫：http://res

11、earch.nhgri.nih.gov/bic/,BRCA1/2基因沒有熱點(diǎn)突變,遺傳性乳腺癌/卵巢癌,CA Cancer J Clin 2014;64:52-62.,遺傳性乳腺癌發(fā)病年齡較散發(fā)性乳腺癌發(fā)病年齡低隨著時(shí)間的發(fā)展，乳腺癌的死亡率逐漸下降50歲以上的人群，因?yàn)槿橄侔┖Y查技術(shù)的完善有效降低浸潤性乳腺癌發(fā)病率50歲以下人群發(fā)病率無明顯變化，死亡率下降緩慢,乳腺癌篩查有效降低浸潤性乳腺癌發(fā)病率，基因檢測(cè)是否可以降低遺傳性乳

12、腺癌發(fā)病率？,測(cè)位點(diǎn)還是測(cè)基因外顯子？,BRCA1基因共5592bp，外顯子+內(nèi)含子共81189 bp，其中2600+位點(diǎn)的變異可導(dǎo)致乳腺癌/卵巢癌風(fēng)險(xiǎn)上升。,Research Themes of HKU Department of Surgery http://www.surgery.hku.hk/research_div_br.php,遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè),檢測(cè)優(yōu)勢(shì)科學(xué) 可檢測(cè)遺傳性結(jié)直腸癌的14個(gè)易感基因，結(jié)合亞洲人

13、群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評(píng)估腫瘤風(fēng)險(xiǎn)精準(zhǔn) 標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)操作工序和數(shù)據(jù)分析流程，直擊突變基因，準(zhǔn)確率達(dá)99.9%全面 目標(biāo)基因外顯子區(qū)域捕獲測(cè)序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測(cè),遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè),檢測(cè)優(yōu)勢(shì)科學(xué) 可檢測(cè)遺傳性結(jié)直腸癌的14個(gè)易感基因，結(jié)合亞洲人群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評(píng)估腫瘤風(fēng)險(xiǎn)精準(zhǔn) 標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)操作工序和數(shù)據(jù)

14、分析流程，直擊突變基因，準(zhǔn)確率達(dá)99.9%全面 目標(biāo)基因外顯子區(qū)域捕獲測(cè)序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測(cè),遺傳性結(jié)直腸癌,Kenneth W Kinzler1,et al, Cell, 1996.,遺傳性結(jié)直腸癌相關(guān)綜合征,遺傳性結(jié)直腸癌基因檢測(cè),檢測(cè)優(yōu)勢(shì)科學(xué) 可檢測(cè)遺傳性結(jié)直腸癌的14個(gè)易感基因，結(jié)合亞洲人群遺傳數(shù)據(jù)庫及華大本地12000例樣本數(shù)據(jù)庫，綜合評(píng)估腫瘤風(fēng)險(xiǎn)精準(zhǔn) 標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)

15、驗(yàn)操作工序和數(shù)據(jù)分析流程，直擊突變基因，準(zhǔn)確率達(dá)99.9%全面 目標(biāo)基因外顯子區(qū)域捕獲測(cè)序，全面覆蓋，查找突變基因便捷 僅需提供5mL外周血或2mL唾液即可完成檢測(cè),APC基因突變的致病風(fēng)險(xiǎn),APC基因突變的風(fēng)險(xiǎn)管理,遺傳性腎癌,,,,,,遺傳性前列腺癌,,Johns LE et al. BJU Int 2003;91:789–94.,先證者為一級(jí)親屬患癌風(fēng)險(xiǎn),先證者為兄弟患癌風(fēng)險(xiǎn),先證者為父親患癌風(fēng)險(xiǎn),家族性,遺傳性,,BRC

16、A1/BRCA2表達(dá)對(duì)不同腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響,,為您的健康保駕護(hù)航-華大基因遺傳性腫瘤基因檢測(cè)產(chǎn)品,腫瘤風(fēng)險(xiǎn)早檢測(cè)，未病先防保健康！一次檢測(cè)，指導(dǎo)一生預(yù)防！,,華大基因遺傳性腫瘤檢測(cè)覆蓋范圍及送樣比例,,華大基因遺傳性腫瘤基因檢測(cè)陽性率,,,,為您的健康保駕護(hù)航-華大基因遺傳性腫瘤基因檢測(cè)產(chǎn)品,準(zhǔn)確率：99.99%，引領(lǐng)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)！,服務(wù)內(nèi)容：女性常見16種遺傳性腫瘤/男性常見15種遺傳性腫瘤適宜人群：患者、近親中有多個(gè)人患癌、患

17、癌近親的發(fā)病年齡小于50歲、近親中有同一人罹患多種癌癥。檢測(cè)樣本類型：外周血、唾液。服務(wù)周期：30個(gè)自然日配套服務(wù)：遺傳性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)管理和健康指導(dǎo)、專業(yè)遺傳咨詢服務(wù),*高風(fēng)險(xiǎn)人群進(jìn)行遺傳性腫瘤相關(guān)基因的檢測(cè)十分必要，早檢測(cè)早預(yù)防！,,專業(yè)遺傳咨詢團(tuán)隊(duì)-國內(nèi)領(lǐng)先,,,檢測(cè)流程,,,疫苗（宮頸癌疫苗，乙肝疫苗）生物制劑（胸腺肽、卡介菌多糖）,自檢血清學(xué)（CEA、CA199）影像學(xué)（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,病理診

18、斷手術(shù)放療化療靶向治療,血清學(xué)（CEA、CA199）影像學(xué)（X片、B超、CT）內(nèi)窺鏡（胃腸鏡）,,傳統(tǒng)方法,,,,遺傳性腫瘤基因檢測(cè),,基因科技,,,,根據(jù)腫瘤基因變異及免疫組庫情況，進(jìn)行病情監(jiān)測(cè)并及時(shí)調(diào)整治療方案,無創(chuàng)腫瘤早早篩,基于基因突變的精準(zhǔn)檢測(cè)及個(gè)體化用藥方案,基因科技助力腫瘤精準(zhǔn)預(yù)防,,無創(chuàng)腫瘤早早篩-ctDNA檢測(cè),,無創(chuàng)腫瘤早早篩-ctDNA檢測(cè),,華大基因發(fā)展歷程,,華大基因科研實(shí)力,截止20