沙地雀麥質(zhì)膜水孔蛋白基因(BiPIP)和Actin基因克隆與序列分析.pdf

1、植物水孔蛋白在植物體內(nèi)形成水分選擇性運(yùn)輸通道，介導(dǎo)胞內(nèi)或胞間的水分跨膜運(yùn)輸，調(diào)節(jié)植物體內(nèi)的水分平衡，對(duì)于提高克隆植物水分生理整合及抗鹽、抗旱性可能發(fā)揮著重要作用。研究以沙地雀麥（Bromus ircutensis Kom.）為材料，通過(guò)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（RT-PCR）和快速分離 cDNA末端技術(shù)（RACE），克隆得到沙地雀麥的BiPIP1-1基因和Actin基因的全長(zhǎng) cDNA序列，對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。主要結(jié)論如下：
　　

2、BiPIP1-1基因全長(zhǎng) cDNA序列為1077bp，包含54bp的5'端非編碼區(qū)（5' UTR），156bp的3'端非編碼區(qū)（3' UTR），867bp的完整的開(kāi)放閱讀框，編碼288個(gè)氨基酸。BiPIP1-1具有MIP家族的信號(hào)序列和質(zhì)膜水孔蛋白基因的特征信號(hào)序列。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示，BiPIP1-1屬于PIP1亞家族成員，與大麥水孔蛋白（HvPIP1-1）的親緣關(guān)系最近。推測(cè)的BiPIP1-1基因三級(jí)結(jié)構(gòu)中包含6個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域（Ⅰ～Ⅵ

3、，通過(guò)五個(gè)親水環(huán)相連），B環(huán)和E環(huán)各形成半個(gè)跨膜螺旋(HB、HE)，分別從膜的兩側(cè)折向膜內(nèi)，2個(gè) NPA基序位于中心。對(duì)沙地雀麥質(zhì)膜水孔蛋白基因的克隆有助于從分子水平研究其在橫走根莖中的表達(dá)及水分在沙地雀麥生理整合過(guò)程中的影響機(jī)理。
　　BiAct基因全長(zhǎng) cDNA序列為1310 bp，包含44 bp的5'端非編碼區(qū)（5' UTR），135bp的3'端非編碼區(qū)（3' UTR），1131bp的完整的開(kāi)放閱讀框，編碼376個(gè)氨基酸。B