24520.一種新型漢坦病毒的遺傳進(jìn)化和流行病學(xué)研究

1、中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所論文原創(chuàng)性聲明和使用授權(quán)說(shuō)明原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外，本論文不含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的作品或成果。對(duì)本文的研究做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體，均已在文中以明確方式標(biāo)明。本聲明的法律責(zé)任由本人承擔(dān)。學(xué)位論文使用授權(quán)說(shuō)明本人完全了解中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究關(guān)于收集、保存、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：按照中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研

2、究要求提交學(xué)位論文的印刷本和電子版本，并提供目錄檢索和閱覽服務(wù)；武漢病毒研究所可以采用影印、縮印、數(shù)字化或其它復(fù)制手段保存論文；在不以贏利的前提下，武漢病毒研究所可以公布論文的全部或部分內(nèi)容。(保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定)論文作者簽名荔陟師簽名：日期：沙廠c，年，陰／El中國(guó)科學(xué)院研究生院博士學(xué)位論文：一種新型漢坦病毒的遺傳進(jìn)化和流行病學(xué)研究摘要漢坦病毒屬于布尼亞病毒科(Bunyaviridae)漢坦病毒屬(Hantavirus，HV

3、)。HV是一種負(fù)性、單鏈、分節(jié)段、有包膜的RNA病毒，基因組由小(S)、中(M)和大(L)3個(gè)片段組成，分別編碼核衣殼蛋白(N蛋白)、包膜糖蛋白(G蛋白)和病毒RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp蛋白)。在中國(guó)大陸，證實(shí)主要存在漢灘病毒(HTNV)、漢城病毒(SEOV)、類Amur病毒、Puumala病毒、Khabarovsk病毒和Vladivostok病毒等HV。2009年我們?cè)谠颇鲜o西縣大絨鼠(Eothenomysmiletus)體

4、內(nèi)發(fā)現(xiàn)一種新型HV，命名為瀘西漢坦病毒(Luxihantavirus，LUXV)。同時(shí)，對(duì)云南省一起實(shí)驗(yàn)室大白鼠相關(guān)的Hv(其中一株命名為KY)爆發(fā)進(jìn)行了調(diào)查研究。本研究主要對(duì)LUXV和KY進(jìn)行了遺傳進(jìn)化和流行病學(xué)等方面的研究，主要結(jié)果如下：2009年秋季在云南省瀘西縣共捕獲7屬12種217只小型哺乳動(dòng)物，其中居民區(qū)105只，優(yōu)勢(shì)鼠種為黃胸鼠(Rattusflavipectus)：野外山地l12只，優(yōu)勢(shì)種為大絨鼠。用直接免疫熒光法(FA

5、)檢測(cè)動(dòng)物肺臟組織中HV抗原，居民區(qū)HV總的感染率為380％(4／105)，陽(yáng)性鼠為大足鼠(Rattusnitidus)、小家鼠(Musmusculus)和黃胸鼠；野外山地只在大絨鼠中檢測(cè)出Hv感染，感染率為1282％(10／78)。2010年春季共捕獲6屬8種113只小型哺乳動(dòng)物，其中居民區(qū)30只，優(yōu)勢(shì)鼠種為黃胸鼠；野外山地83只，優(yōu)勢(shì)種為大絨鼠。居民區(qū)只在黃胸鼠中檢測(cè)出HV感染，感染率為3570％(1／28)。野外山地只在大絨鼠中檢

6、測(cè)出HV感染，感染率為2549％(13／51)。LUXV的S、M和L片段核苷酸序列全長(zhǎng)度分別為2107bp、3663bp和6538bp，分別編碼HV的N蛋白為438aa，G蛋白為1139aa和I殂I郇蛋白為2154aa。從氨基酸水平上看，該病毒S片段與其它HV比較，同源性從449—792％最接近圖拉病毒(TULV，Ma322／2003株)、IslaVista病毒(ISLV，MCSB1株)和小河病毒(BAYV，Bayou株)，同源性分別為