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文檔簡介
1、華中科技大學碩士學位論文高溫動力學方法篩選提高蛋白質熱穩(wěn)定性的突變位點姓名:宋苗苗申請學位級別:碩士專業(yè):理論物理指導教師:肖奕20110107II華中科技大學碩士學位論文AbstractProteinisganismfunctionperfmerisalsoaimptantresearchobjectinlifesciences.Alllifeactioncannotgowithouttheparticipationofprotein
2、.Eachkindofproteinhavingacertainoptimumtemperaturescopetodisplayitsfunctionproteinactivitywillbeinfluencedifthetemperatureishigherthanlowerthanthistemperaturerangeevenwillbedeactivated.Butnowinfoodchemicalindustrymolecul
3、ardesignbiomedicinesoonproteinsthatcanmaintainitsiginalstructurefunctionunderhightemperatureareneededtherefetoenhanceprotein’sthermostabilityunderstthemechanismthattheproteindisplaysitsfunctiondiscoverthekeyfactsthatinfl
4、uencedprotein’sthermostabilitywasnotonlyascientificproblembuthasplayedamemevitalroleinpeoplesdailylifeattractingmemescientiststospendmassivetimeenergytotheproteinthermostabilityresearch.Residuemutationisanefficientmethod
5、toenhanceprotein’sthermostability.Topredictthemutationalsitesnumeroussuccesseshavebeenachievedthroughproteinengineeringmethodfinstancetherationaldesignrommutagenesisconsensusmethod.Buthowtochoosemutationalsitesstillhaven
6、’tbeencompletelysolvedatpresent.Theefficiencythescreeningvalidityalsoneedtofurtherenhance.Fthispurposeweusethehightemperaturedynamicsmethodconsideringtheinterresidueenergytheproteinstructureaswellasthestructurealongwitht
7、emperatureinfmationtoscreenmutationalsitesthatcanenhanceprotein’sthermostability.Wechose4proteinsasourresearchmaterialfromtheProThermdatabaseundercertainconditions.Theproteinsare:1csp1qqv1rop1pga.Take1cspastheexamplewedi
8、ddynamicssimulationatTmTm50kTm100kTm150ktemperaturewecarriedoutthestatisticalanalysistotheanalogueresultedasuitabletemperatureinwhichdynamicssimulationwasmade.Thenwemadedynamicssimulationunderthistemperaturetothethreeoth
9、erproteins.Accdingtotheinfluencefactsaswellasthesefacts’contributiontoprotein’sthermostabilitywedidapreliminaryscreeningtotheproteinresiduefirstfthesuitedresidueswefurtheranalyzedthedistancebetweentheresidueschangealongw
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