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文檔簡介
1、本論文主要針對蛋白質(zhì)組學中肽段定量相關(guān)的生物信息學問題進行了研究,包括了基于保留時間的譜圖匹配校正和質(zhì)譜響應信號與蛋白質(zhì)濃度關(guān)系的研究。
1988年,應用于生物質(zhì)譜的軟電離技術(shù)發(fā)明。2001年,人類基因組測序完成。蛋白質(zhì)組學隨之進入了飛速發(fā)展的黃金期。
目前在蛋白質(zhì)組學的研究中,極大程度上受到了鑒定技術(shù)的限制,尚沒有合適的方法能夠簡便地一步實現(xiàn)對復雜蛋白混合的鑒定分析,所以必須把樣品預處理、分離、鑒定以及數(shù)據(jù)處理等環(huán)
2、節(jié)進行整合,綜合分析。
本文的工作領(lǐng)域為蛋白質(zhì)組學非標記絕對定量新方法的研究,主要嘗試利用本實驗室的工作流程與產(chǎn)出數(shù)據(jù),建立一套流程化高效率的定量方法。
第一章,通過利用譜圖校正提高色譜質(zhì)譜聯(lián)用數(shù)據(jù)的分析效率,為后續(xù)定量方法的研究提供可靠的肽段信息以及整合數(shù)據(jù)。
第二章,通過發(fā)展新的數(shù)學公式描述了肽段濃度的對數(shù)值與質(zhì)譜響應信號的對數(shù)值在一定數(shù)量級范圍內(nèi)呈線性關(guān)系,以此來幫助蛋白質(zhì)定量過程中的計算模擬。
3、> 第三章,通過查閱文獻和借助數(shù)理編程方法,嘗試編寫用于肽段保留時間預測的程序,并應用于設計實驗中的分析和定量。
本文的主要貢獻及創(chuàng)新點在于:充分了解目前通用的蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理流程的現(xiàn)狀與不足,深入理解蛋白質(zhì)定量分析的數(shù)據(jù)處理要求后,改進和發(fā)展了新的方案,并熟練使用國內(nèi)外先進軟件,最終從各方面提高了數(shù)據(jù)處理的質(zhì)量;對肽段濃度與質(zhì)譜響應信號的定量關(guān)系進行了分析并提出了新的數(shù)學公式幫助計算;編寫的程序能夠在條件實驗中逐漸實現(xiàn)肽
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