抗原肽與MHC分子相互作用QM-MM分子動力學模擬研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、在MHCⅠ類(majorhistocompatibilitycomplexclassⅠ)分子抗原加工提呈過程中抗原蛋白在抗原提呈細胞(antigen-presentingcells，APC)的胞漿中被蛋白酶體(proteasome)裂解成短肽peptide，由轉運相關蛋白(transporterassociatedwithantigenprocessing，TAP)將蛋白酶體裂解產生的短肽片段從胞漿轉運至內質網腔。短肽peptide在內

2、質網中與新生成的MHCclassⅠ類分子結合，形成peptide-MHC復合體被提呈到APC細胞表面，與T細胞表面抗原受體TCR特異性識別結合，使得CTL細胞開始活化、增殖、分化，進而對腫瘤細胞進行特異性殺傷。本文采用qm/mm多尺度生物大分子的分子動力學模擬方法，以天然抗原肽TAX(LLFGYPVYVYU)與HLA-A*0201分子結合的晶體結構為模板，替換抗原肽“錨點”氨基酸，將口袋氨基酸殘基的原子極化電荷在空間形成的靜電勢用電多極

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