櫛孔扇貝和海灣扇貝的群體遺傳多樣性研究及扇貝科幾種貝類的分子系統(tǒng)學(xué)研究.pdf

1、該文采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)對(duì)櫛孔扇貝(Chlamys farreri)大連、青島、長(zhǎng)島、朝鮮及日本5個(gè)自然群體89個(gè)個(gè)體的核糖體轉(zhuǎn)錄間隔子序列(ITS-1)進(jìn)行了擴(kuò)增.PCR產(chǎn)物純化后經(jīng)T載體連接進(jìn)行了克隆、測(cè)序,排序后得到長(zhǎng)度為306bp(不含引物)的序列,A,T,G,C含量分別為33.1﹪、21.3﹪、20.6﹪、25.0﹪,AT含量高于GC含量.MEGA軟件檢測(cè)到44個(gè)變異位點(diǎn),其中有8個(gè)插入/缺失突變的的核苷酸位點(diǎn),3

2、6個(gè)轉(zhuǎn)換或顛換核苷酸位點(diǎn),其中3個(gè)位點(diǎn)(60、213、215)轉(zhuǎn)換與顛換同時(shí)存在,共51種單倍型.5個(gè)群體中朝鮮群體擁有的單倍型最豐富,為18個(gè),而且擁有最多的多態(tài)性核苷酸位點(diǎn),長(zhǎng)島群體、日本群體和青島群體的單倍型數(shù)分別為16個(gè)、13個(gè)和13個(gè),大連群體的單倍型最少,為9個(gè).各群體遺傳距離在0.006~0.009之間.在多態(tài)位點(diǎn)數(shù)S、平均核苷酸差異數(shù)K和核苷酸多樣性指數(shù)Pi三個(gè)指標(biāo)上,朝鮮群體的值相對(duì)較高,長(zhǎng)島群體次之,其次為日本群體、