上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學研究.pdf

1、目的: 監(jiān)測并分析上海地區(qū)住院和門診腹瀉兒童四種腹瀉病毒的分子流行病學特點，以全面了解及客觀評估腹瀉病毒在兒童腹瀉發(fā)病中的作用，為腹瀉的防治和相關疫苗的開發(fā)應用提供基本數據和理論依據。
　　方法: 收集2006年1月至2011年12月在復旦大學附屬兒科醫(yī)院住院的腹瀉兒童（年齡≤5歲）糞便標本674份，并收集2010年7月至2011年12月在復旦大學附屬兒科醫(yī)院門診就診的腹瀉兒童（年齡≤5歲）糞便標本436份。采用RT-PCR方法檢

2、測糞便標本中的輪狀病毒（Rotavirus，RV）、杯狀病毒(Humancalicivirus，HuCV)、星狀病毒(Human astrovirus，HAstV)及腺病毒(Adenovirus，AdV)。采用引物分型的方法確定RV的基因型別，采用基因測序和進化樹分析的方法確定諾如病毒(Norovirus，NV)、札幌病毒（Sapovirus，SaV）、HAstV和AdV的基因型別。采用SPSS16.0統(tǒng)計分析軟件對研究結果和臨床資料進

3、行統(tǒng)計分析。
　　結果: 一、2006-2011年住院腹瀉兒童腹瀉病毒的分子流行病學研究結果如下:1.腹瀉病毒的總檢出情況:四種腹瀉病毒的總檢出率為92.1％(621/674)，RV、HuCV、HAstV及AdV的總檢出率分別為89.2％(601/674)、30.6％(206/674)、30.1％(203/674)及4.7％(32/674)。腹瀉兒童單一病毒感染的總檢出率為43.5％(293/674)，并以RV的單獨感染為主，其他

4、三種病毒單獨感染的總檢出率均＜2％。腹瀉兒童多重病毒感染的總檢出率為48.6％(328/674)，2006-2011年病毒混合感染的檢出率呈下降趨勢，2011年降為11.7％。多重混合感染中，以RV+HAstV、RV+HuCV及RV+HuCV+HAstV混合感染的檢出為主。2.院內和非院內感染腹瀉兒童腹瀉病毒的檢出:院內感染引起腹瀉者占50.8％(302/626)，以2009年(60.6％)和2008年(60.5％)最多，2011年降至

5、24.5％。非院內感染腹瀉者單一病毒的總檢出率(47.8％，147/308)顯著高于院內感染腹瀉者(38.1％，121/318)（P＜0.05），單一病毒的感染均以RV為主。院內感染腹瀉者感染多重腹瀉病毒的總檢出率(56.9％，181/318)顯著高于非院內感染者(42.9％，132/308)(P＜0.05)，且均以RV+HAstV及RV+HuCV的混合感染為主。3.RV基因型:①G基因型:雖2006-2011年G基因型以G3型為主，但

6、G3型的流行呈波動性下降趨勢，由2006年的64.6％降為2011年的12.8％，而G9和G1型的流行呈上升趨勢，且G9型(51.1％)成為2011年最主要的流行型別，G1型(19.1％)為當年的次要流行型別。2006-2011年G混合基因型所占比例為10.3％(62/601)，混合的G基因型種類較多，以G1、G3及G9型的兩兩混合為主。②P基因型:2006-2011年P基因型以P[4]、P[8]及P混合型的流行為主，而每年P基因型的流

7、行又處于波動性變化中。P混合型以P[4]+P[8]型為主，其次為P[8]+P[10]型。③組合型別:P[8]G3型(27.5％)是上海地區(qū)2006-2011年間最主要的RV流行株，其次為PmG3及P[4]G3型。2011年P[g]G9型躍升為當年最主要的流行型別(40.5％)。院內感染和非院內感染腹瀉兒童中檢出的RV基因型相似。4.HuCV基因型:檢出的206例HuCV陽性標本均屬NV屬且均為GⅡ型。以GⅡ.4型(75.7％，156/2

8、06)為主，其次為GⅡ.12型(22.3％，46/206)。GⅡ.4型中以2006b亞型(73.3％，151/206)的流行為主，同時還分別檢出2例GⅡ.7型及GⅡ.b型。院內感染和非院內感染腹瀉兒童中檢出的HuCV基因型無明顯差異。5.HAstV基因型:住院腹瀉兒童感染HAstV的基因型別單一，均為HAstV-1型。6.AdV基因型:AdV陽性標本的基因型別以Ad-41型為主，占50.0％(16/32)，其次為Ad-3型(25.0％，

9、8/32)。每年各種基因型的流行又有不同。院內感染和非院內感染腹瀉兒童檢出的AdV基因型無異。
　　二、2010-2011年門診腹瀉兒童的分子流行病學研究結果如下:1.總檢出情況:四種病毒的總檢出率為66.7％(291/436)。RV檢出率最高，為43.3％(189/436)，其次為HuCV(29.4％，128/436)，AdV(7.1％，31/436)及HAstV(1.8％，8/436)。門診腹瀉兒童以單一病毒的感染為主(51.

10、8％，226/436)，而RV感染的比例最高(30.0％，131/436)，其次為HuCV(16.0％，72/436)。腹瀉病毒混合感染的比例為14.9％(65/436)，混合感染中均為兩種病毒的混合感染，以RV+HuCV的雙重感染為主。2.RV的流行特點:①流行季節(jié)和年齡分布:2010-2011年門診RV性腹瀉以9-11月份為高峰，10月檢出率最高(70.0％)，0～11月齡者(49.7％)所占比例最高，96.3％的患兒年齡在0～3歲

11、之間。②基因型:G基因型以G1、G3和G9型的流行為主，檢出率分別為31.2％、28.6％和27.0％。P基因型以P[8]型為主(91.0％，172/189)，其次為P[4]型(5.3％，10/189)。G混合基因型以G1+G9型(60.0％，12/20)為主。P混合基因型檢出較少(2.6％)，主要是P[8]+P[4]型。P[8]G3、P[8]G1和P[8]G9型是主要流行的三種組合型別，所占比例分別為27.5％(52/189)、26.

12、9％(51/189)和25.4％(48/189)。3.HuCV的流行特點:①流行季節(jié)和年齡分布:9-10月為門診腹瀉兒童HuCV性腹瀉的流行高峰，9月份(66.7％)的檢出率最高，6月的檢出率也高達60.0％，0～11月齡者最多(56.7％，72/128)，97.6％的腹瀉患兒在0～3歲之間。②HuCV基因型:檢出的128例HuCV陽性標本中，126例屬NV屬，2例為SaV屬。所有NV株均為GⅡ型，并以GⅡ.4型(71.8％，92/12

13、6)為主，其次為GⅡ.b型(15.6％，20/126)，尚檢出少量GⅡ.12、GⅡ.7及GⅡ.2型。GⅡ.4型中以2006b亞型(65.6％)為主，同時檢出8例2006a亞型。檢出的2例SaV分別是GⅠ.2型及GⅡ.1型。4.HAstV基因型:門診腹瀉兒童HAstV陽性者型別均為HAstV-1型。5.AdV基因型:以Ad-41型為主(45.2％，14/31)，其次為Ad-3型(22.6％，7/31)及Ad-40型(16.1％，5/31)