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文檔簡介
1、Sirtuin家族的酶能夠催化無論組蛋白還是非組蛋白底物上的?;嚢彼醾孺湹娜ヵ;磻?。細菌和古生菌通常包含一至兩個sirtuins,而真核生物包含多個sirtuin成員。自從2000年發(fā)現首個sirtuin家族成員后,在過去的幾年里,sirtuin催化的去?;磻呀洷蛔C實在多個關鍵的細胞過程發(fā)揮重要的調節(jié),比如基因轉錄,DNA損傷修復和新陳代謝。這個反應也被用于人類的一些疾病譬如癌癥,代謝和神經變性相關疾病的靶向治療。通過一系列實驗
2、基礎上的sirtuin酶化學機制的探索,sirtuin獨特的依賴于NAD+的去?;磻獧C制被廣泛研究。近幾年,各種新型的sirtuin催化的去?;磻囊种苿┖鸵种撇呗韵嗬^被報道,這些研究可以幫助我們更好的去理解sirtuin催化去酰化化學反應的生物學和藥理學方面的知識,并且對于開發(fā)在新陳代謝,神經退行,年齡相關的疾病,特別是癌癥方面的新的治療方法有著巨大的意義。
在我的導師堅實的前期工作基礎上,本論文主要進行了以下三個方面的
3、探索:
(1)利用酶的催化核心區(qū)域的三維空間結構中Nε-乙酰-賴氨酸側鏈的延伸空間,我們設計了一系列基于Nε-乙酰-賴氨酸的具有不同linker和末端基團的雙齒類化合物,被并對其進行了SIRT1抑制測試,我們發(fā)現了幾個比Nε-乙酰-賴氨酸單齒化合物更強效的SIRT1抑制劑,從而證明我們以此設計sirtuin抑制劑的可行性。通過動力學測試我們驗證了該抑制劑相對于NAD+符合一個非競爭性(non-competitive)的抑制模式
4、,而相對于Nε-乙酰-賴氨酸底物是一個競爭性(competitive)的抑制模式。這一發(fā)現符合SIRT1催化的去?;饔玫膭恿W機制,即SIRT1首先與Nε-乙酰-賴氨酸底物綁定之后再與NAD+綁定。這個發(fā)現也表明該類抑制劑能夠進入Nε-乙酰-賴氨酸側鏈延伸部位的結合口袋,通過阻止Nε-乙酰-賴氨酸底物和NAD+與酶的活性中心結合而發(fā)揮其抑制作用,這將鞏固雙齒類抑制劑的設計原理;
(2)在導師前期工作的基礎上,對肽類先導化合物
5、中Nε-硫乙酰-賴氨酸周邊的側鏈進行修飾,作為課題的重要貢獻者,我合成了該系列化合物中的8個化合物,并對其進行了SIRT1/2/3抑制測試,結合本課題組另一位同學的測試結果,我們成功的找到了一個能夠保持先導化合物強效(?M)的抑制能力并且具有SIRT3選擇性(相對于SIRT1/2~10倍,相對于SIRT5>1,000倍,相對于SIRT6~161倍)的新型抑制劑;
(3)我的論文的第三部分工作是我們嘗試發(fā)展一個不可逆的sirtu
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