中國東北地區(qū)漢族人群3個miniSTR基因座遺傳多態(tài)性的研究.pdf

1、目的：短串聯(lián)重復(fù)序列（short tandem repeats，STR）是廣泛存在于人類基因組中的一類具有長度多態(tài)性的DNA序列，是第二代遺傳學(xué)標記。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，使得人類在認識自己的起源方面取得了突破性的進展，尤其是熒光標記STR復(fù)合擴增技術(shù)和全自動DNA測序儀的結(jié)合使STR分析結(jié)果更加數(shù)字化、標準化。MiniSTR作為一種新的STR分型技術(shù)，它重新設(shè)計引物，使其更接近核心重復(fù)序列，PCR擴增的產(chǎn)物比STR分型短一些。

2、MiniSTR技術(shù)是一種有效的從微量以及降解檢材中獲得遺傳信息的方法。本文旨在了解D1S1677、D2S441和D4S2364基因座在東北地區(qū)漢族群體中基因型分布及等位基因頻率等遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)，以及這些基因座在人類學(xué)、群體遺傳學(xué)和法醫(yī)學(xué)等方面的應(yīng)用價值。 方法：采用Chelex-100法提取138名中國東北地區(qū)漢族無關(guān)個體全血基因組DNA。將基因座D1S1677的上游引物5’端用TAMRA熒光標記，基因座D2S441的上游引物用

3、HEX熒光標記，基因座D4S2364的上游引物用6-FAM熒光標記。應(yīng)用熒光標記多重PCR擴增技術(shù)，即在同一反應(yīng)體系中同時擴增3個基因座。采用ABI-310毛細血管電泳儀對復(fù)合擴增產(chǎn)物進行檢測和分型。利用遺傳分析軟件對分型結(jié)果進行統(tǒng)計分析。用直接計數(shù)法計算等位基因頻率和基因型頻率，用PowerStatsV1．2軟件包自動計算觀察雜合度、個體識別率、非父排除率、多態(tài)信息含量、典型父權(quán)指數(shù)等群體遺傳學(xué)參數(shù)。用X2檢驗進行Hardy-Wein

4、berg平衡的檢測。應(yīng)用Arlequin3．11軟件進行其他國家和地區(qū)間的比較。 結(jié)果：1．在138例東北地區(qū)漢族人群中，D1S1677基因座觀察到8個等位基因，15種基因型；D2S441基因座觀察到8個等位基因，20種基因型；D4S2364基因座觀察到5個等位基因，10種基因型。D1S1677、D2S441、D4S23643個miniSTR基因座的觀察雜合度（H）分別為0．746、0．833、0．768；多態(tài)信息含量（PIC）

5、分別為0．59、0．70、0．61；個體識別率（DP）分別為0．789、0．866、0．795；非父排除率（PE）分別為0．504、0．662、0．541；典型父權(quán)指數(shù)（TPI）分別為1．97、3．00、2．16。累積個體識別率為0．994204，累積非父排除率為0．923049。3個miniSTR基因座均符合哈迪溫伯格平衡。2．3個miniSTR基因座等位基因頻率的民族差和地區(qū)差：中國東北地區(qū)漢族與中國華東地區(qū)漢族相比較只有基因座D2

6、S441（P=0．093）無顯著性差異，其他兩個基因座均具有顯著性差異（P<0．05）；與韓國人相比較基因座D1S1677和基因座D4S2364的P值分別為0．737、0．574，大于0．05，無顯著性差異，基因座D2S441具有顯著性差異（P<0．05）；與日本人相比較只有基因座D2S441（P=0．119）無顯著性差異，其他兩個基因座均有顯著性差異（P<0．05）；與中國廣東地區(qū)漢族相比較均具有顯著性差異（P<0．05）；與新加坡中

7、國人、馬來人、印第安人相比較均具有顯著性差異（P<0．05）；與意大利人、波蘭人、西班牙人、非洲美國人、美國高加索人和美國拉丁人相比較均具有顯著性差異（P<0．05）。 結(jié)論：1．本研究獲得東北地區(qū)漢族人群3個miniSTR基因座的等位基因頻率、基因型計數(shù)等遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)，為人類群體遺傳學(xué)提供了相關(guān)的資料。2．3個miniSTR基因座在東北地區(qū)漢族人群中具有較高的個體識別率和非父排除率，在親子鑒定、個體識別、群體遺傳學(xué)、古人類學(xué)