大興安嶺地區(qū)紫貂腸道菌群多樣性研究.pdf

1、紫貂（Marteszibellina），屬于哺乳綱（Mammalia），食肉目（Carnivora），鼬科（Mustelidae），貂屬（Martes）。世界范圍內(nèi)記錄到的紫貂共為18個亞種，我國境內(nèi)共分布有4個亞種，分別為：新疆北部地區(qū)的阿爾泰亞種（M.z.averini）；內(nèi)蒙古和黑龍江省大興安嶺地區(qū)的大興安嶺亞種（M.z.princeps）；黑龍江省小興安嶺地區(qū)的小興安嶺亞種（M.z.linkouensis）以及長白山地區(qū)的長白山

2、亞種（M.z.hamgyenensis）。而貂皮作為“東北三寶”之一，在國際珍貴毛皮貿(mào)易市場中更是具有舉足輕重的地位。近年來，我國紫貂的分布和數(shù)量因?yàn)槿藶榛顒釉斐傻臈⒌貑适?、?yán)重的破碎化，以及食物短缺、過度捕獵等原因急劇減少，這一極寒地區(qū)旗艦物種的種群恢復(fù)和棲息地保護(hù)問題亟待解決。
　　微生物是地球上最為豐富的生命形式，人類也因此適應(yīng)了這樣的富含微生物的生活環(huán)境。微生物群落在人體內(nèi)的最大聚集區(qū)位于胃腸道（gastrointesi

3、nal tract，GI），這一群落在宿主體內(nèi)起發(fā)揮著多種重要功能，包括生長發(fā)育、免疫學(xué)、生理學(xué)和營養(yǎng)學(xué)等功能，腸道微生物可能對我們的健康和疾病都有影響。微生物通常被發(fā)現(xiàn)在宿主的不同部位都有繁殖，包括皮膚、口腔、泌尿生殖道和胃腸道等部位，并與其宿主和平共存，被描述為所謂的―正常的微生物群落或者―微生物群落，而其集合基因組—腸道微生物，則是宏基因組的主要組成部分。
　　哺乳動物腸道菌群的組成成分與很多環(huán)境和地理因素相關(guān)，而且腸道菌群

4、在諸如生長發(fā)育、繁殖和疾病等多方面起著非常重要的作用。
　　利用新一代測序技術(shù)對紫貂的16S rRNA基因的測序數(shù)據(jù)尚未見報道。為探究冬季紫貂腸道菌群的基本組成和結(jié)構(gòu)以及對野外紫貂和捕獲后飼養(yǎng)紫貂的腸道菌群進(jìn)行比較分析，本研究對來自內(nèi)蒙古汗馬國家級自然保護(hù)區(qū)的3份紫貂糞便樣品，和捕獲自大興安嶺漠河地區(qū)并在貂廠中飼養(yǎng)3個月的紫貂糞便樣品進(jìn)行總DNA提取，并對16S rRNA基因中V3-V4區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增，并通過Illumina Mise

5、q平臺測序，共獲得84116條讀長。野外紫貂腸道中前三個優(yōu)勢菌門分別為Firmicutes(31.1％)，Bacteroidetes(26.0％)和Proteobacteria(21.5％)，飼養(yǎng)紫貂的優(yōu)勢菌門分別為Firmicutes(55.6％)，Proteobacteria(29.1％)和Actinobacteria(6.0％)。在門水平上，野外紫貂在Bacteroidetes和Actinobacteria兩門相對豐富度大于飼養(yǎng)紫