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1、江南大學(xué)碩士學(xué)位論文酰胺類化合物與DNA堿基相互作用的理論研究姓名:于芳申請學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):應(yīng)用化學(xué)指導(dǎo)教師:王海軍20090701AbstractTheintermolecularinteractionsofthreedifferentbinarysystemswereinvestigatedwithcomputationalquantumchemicalmethodsrespectively,topredictthegeomet
2、riesandtakethesystematicallyanalysistoweakinteractionabouttheprincipleandmechanismFirsttheB3LYP/6—311Gmethodwasperformedoncomplexesofguanine誦tllacrylamide,andninestableconfigurationswereobtained晰tllnealfrequenciesThenthe
3、B3LYP/6—311OandMP2/631G幸methodswereusedtostudythecomplexesbetweencytosineandacrylamideThestructures,bindingenergychargetransferandtopologicalpropertyofthecomplexeswerecalculatedTheresultsindicatedthepresenceofCH0,CHN,NH0
4、andNHNhydrogenbondsbetweenguaninewithaerylamide,cytosineandacrylamideintheseconformersandtheinteractionenergiesofhydrogenbondingofthesystemsdecreasedinthefollowingsequence:AIA2A3A5A4A6A7AsA9(guanineacrylamidesystem),A3A4
5、AIA2A5(cytosineacrylamidesystem)FinallyweperformedDFTcalculationwith6—311G幸basissetonthehydrogenbondedcomplexesbetweenguanineandureaThenearlylinearNH0contactsarestrongerthanaconventionalhydrogenbondinteractionwiththeirHO
6、separationbetween174and268AUreaisagoodhydrogenbondaccepterandforNorOatom,itisagoodhydrogenbonddonorThus,stablecomplexescallformedbetweenureaandguaninewithhydrogenbondsThehydrogenbonds’strengthdecreasedinthefollowingseque
7、nce:NHONHNCHOAccordingtotheAIMandNBOanalysises,hydrogenbondbetweenguanineandureaisimportantandA5isthemoststableoneHbondsinteractionsplayanimportantroleinsupramolecularchemistry,especiallyinbiologicalsystemsAsforsupramole
8、cularbiologicalsystems,thecloselylinearamidehydrogenbondsNH‘0andNHNstronglystabilizethecomplexTheweakerCH。OHbondsarealsodiscussedassignificantinteractioninbiologicalsystemsKeywords:DFT,Abinitio,hydrogenbond,interaction,c
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