應用ABEEM-MM方法研究ILE(H2O)n(n=1-3)團簇的性質.pdf

1、異亮氨酸是人體必需氨基酸之一，在人類生命代謝中占有特別重要的地位，因而探討異亮氨酸與水分子之間的相互作用具有非常重要的意義。
　　 本論文中采用B3LYP/6—311++G(d，p)方法對研究體系進行結構優(yōu)化和頻率計算，在MP2/6—311++G(d，p)水平上進行能量計算，對ILE—水團簇的能量計算同時進行了BSSE校正。首先研究了異亮氨酸單體的幾何構型，得到10個相對穩(wěn)定構型，結果表明最穩(wěn)定的兩個構型是單體a和單體b，甩AB

2、EEM/MM模型對其進行優(yōu)化和電荷分布分析，并與從頭算的計算結果進行比較，擬合了一組比較理想的ILE—H2O勢能模型參數(shù)。其次研究了異亮氨酸與一個水的相互作用，通過分析氫鍵作用區(qū)域可知，能形成5種氫鍵類型，運用ABEEM模型對ILE中氧原子和氮原子以及它們的孤對電子的電荷分布進行分析，可以預測水在某一區(qū)域形成氫鍵的強弱，并用ABEEM/MM和從頭算方法計算穩(wěn)定二聚體的結合能，數(shù)據(jù)表明ABEEM/MM模型與從頭算方法得到的結果有很好的一致