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1、序列比對(duì)分析是生物信息學(xué)研究中的一個(gè)基本內(nèi)容.雖然近年來由于算法自身的不斷改進(jìn)以及計(jì)算機(jī)科學(xué)的發(fā)展,其實(shí)現(xiàn)程序依靠計(jì)算機(jī)硬件和軟件開發(fā)技術(shù)的提高得到了效率和精度上的改善,從而使現(xiàn)在應(yīng)用廣泛的序列比對(duì)或數(shù)據(jù)庫搜索程序如Blast、FASTA、ClustalW等才獲得了相對(duì)滿意的計(jì)算效率,但是從理論基礎(chǔ)和思想原理上改善序列比對(duì)算法以期降低計(jì)算復(fù)雜度,才是提高計(jì)算效率和精度的根本途徑.目前隨著各種基因組測序計(jì)劃陸續(xù)完成,大量序列數(shù)據(jù)急劇增長,
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