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文檔簡介
1、如何利用海量基因表達譜數(shù)據(jù)來研究基因間的調(diào)控關系是當前生物信息學的一個重要研究領域,利用數(shù)學模型挖掘基因表達譜數(shù)據(jù)中蘊含的生物信息已成為研究熱點。本文針對某些物種的基因表達譜數(shù)據(jù),構建了基因挖掘的數(shù)學模型,并做了數(shù)值試驗進行驗證。
在文章開始我們簡單地介紹了文章寫作的背景,分析了目前基因表達譜數(shù)據(jù)挖掘的研究現(xiàn)狀,并簡要概括了本文的主要研究工作。
由于基因的序列表達譜的不平穩(wěn)信號中含有大量信息,為了更好地挖掘基因表達譜
2、中的信息,在文章第二部分我們首先對基因表達譜數(shù)據(jù)進行預處理和差異基因初步篩選找出差異較大的相關基因;然后,將初步篩選出的差異較大的基因利用DAVID的功能聚類工具進行基因功能聚類,從而得到不同的基因功能簇(即富集分析);最后,對所得到的各個基因功能簇建立SOM網(wǎng)絡進行分類,按分類的正確率找出差異顯著的基因功能簇。這樣,基于自組織映射網(wǎng)絡對差異表達基因挖掘的數(shù)學模型就建立了。
在第三部分,我們構建了基于前饋神經(jīng)網(wǎng)絡的線性動態(tài)基因
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