生物安全導論 —— - 四川農(nóng)業(yè)大學研究生院

1、,The Department of Ecology & Evolutionary Biology, Fudan University Bao-Rong Lu,Scientific Methodology and Scientific Paper Writing,復旦大學 盧寶榮,盧寶榮生態(tài)與進化生物學系主任生物多樣性與生態(tài)工程教育部重點實驗室學術委員會主任研究領域: 保護生物學，系統(tǒng)與進化，分子生態(tài)，生物安全,主要社

2、會兼職:國際生物安全研究學會（ISBR）主席，中國國家生物安全委員會委員，中國植物學會理事，中國生物技術學會理事?lián)尉庉? Environmental Biosafety Research, Crop Research, Asian J of Plant Sciences, J Systematics & evolution,《中國科學》《生物多樣性》，《中國水稻科學》，《植物遺傳資源學報》，《復旦學報》，《云南農(nóng)業(yè)大學

3、學報》等,復旦大學 盧寶榮,,Citation Distribution of Baorong Lu’s Publications Since 1991,復旦大學 盧寶榮,Course designPart 1: Scientific Methodology Part 2: Scientific Paper Writing,復旦大學 盧寶榮,Introduction: scientific research & articl

4、e writingScience & scientific methodologyGeneral procedure of scientific researchScientific question & hypothesis Design a research (project)Conduct a research (project),Part 1: Scientific Methodology,復旦大學

5、盧寶榮,Part 2: Scientific Paper Writing,Organization & format of a scientific paperTitles, authorships & AbstractsHow to write the IntroductionHow to write Materials & MethodsHow to write ResultsHow to wri

6、te DiscussionAcknowledgement & referencesHow to submit your paperThe reviewing & publishing process,復旦大學 盧寶榮,What is the most difficult part in scientific research ?,,復旦大學 盧寶榮,Part 1: Scientific Methodology,什

7、么是科學研究？What is scientific Research?,英文Research是什么意思？Re Search（不斷尋找）尋找什么？？,,,復旦大學 盧寶榮,,科學假設的結果？,尋找答案（結果）？,科學問題 → 假設的結果？,,,復旦大學 盧寶榮,科學問題!,A simple & effective way of scientific research,How ?Which way ? The hyp

8、othesis driven approach,,復旦大學 盧寶榮,,Six steps: research process in fundamental sciences,3. Create hypotheses,4. Test hypotheses,6. Evaluate theories,5. Generate theories,2. Obtain facts,1. Select projects (questions),,,,,

9、,,,復旦大學 盧寶榮,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experiment),,,,,Analysis,,復旦大學 盧寶榮,Formulate a scientific ques

10、tion,(A) Types of scientific questions：What? – the nature of objectivesHow? – the state & movement of objectivesWhy? – the mechanisms of the state & movement of objectives,復旦大學 盧寶榮,Considerations when propose

11、scientific questions:,Scientificity（科學性）Values（重要性）Feasibility （可驗證性）Lead to new questions（豐富性）Innovativeness（創(chuàng)新性）Relevant to scientific &/or social values（理論價值）（經(jīng)濟價值）,復旦大學 盧寶榮,Scientific questions should be:,Si

12、mpleClear (not equivocal)Possible to validate (or test),復旦大學 盧寶榮,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experim

13、ent),,,,,Analysis,,復旦大學 盧寶榮,A statement of expected resultsA possible response (prediction) to the research question"hypothesis" & "theory" are often used as synonym in informal usageA hypothes

14、is is untested theory,Formulate a scientific hypothesis,復旦大學 盧寶榮,Considerations when propose scientific hypotheses:,Testable (at your capacity)Powerful (explain more facts)Highly predictable (mature)Accurat

15、eLogically simpleNo pre-set conditions,復旦大學 盧寶榮,,A hypothesis driven approach of scientific research:,-Conclusion-Finding -Theory,Scientific question,Hypothesis,Proof(design & conduct Experiment),,,,,Analysi

16、s,,,,復旦大學 盧寶榮,A well-down research work-plan:,Title of the experimentRational & Objectives (references)Main research contents & activities (Core)Technical details (Core)Time frame (deadlines) Expected output

17、sBudget,復旦大學 盧寶榮,問 題？,復旦大學 盧寶榮,Part 2: Scientific Paper Writing,The cripple but not lost can surpass the people who walk fast but in a wrong road— Francis Bacon,復旦大學 盧寶榮,Four questions?,Do you want to publish a high

18、quality scientific paper ? Why do you want to publish a paper ?What should you need for publishing a good paper ?After publishing, what do you expect from your papers ?,,復旦大學 盧寶榮,什么是科學論文 ？,科學論文是：記錄原始研究結果，或綜述科學發(fā)現(xiàn)及發(fā)展

19、將正式發(fā)表或出版的書寫文件,復旦大學 盧寶榮,科學論文的結構,結論 （D）（發(fā)現(xiàn)，理論）,背景和研究目的（I）,方法（M&M）,主要結果（R）,,,,復旦大學 盧寶榮,復旦大學 盧寶榮,科學研究與科學論文,科學研究：科學問題 ? 科學假設 ? 實驗驗證 ? 結論（科學發(fā)現(xiàn)）科學論文：研究背景（目的）? 研究方法 ? 研究結果 ? 結論（科學發(fā)現(xiàn)的意義）科學研究與科學論文的形式相似而對應有好的研究結果 ? 才能創(chuàng)

20、作出好的論文,,復旦大學 盧寶榮,怎樣才是一篇優(yōu)秀的 （研究）論文？,包含有意義的科學問題有明確、合理的科學假設有嚴密的實驗設計有令人信服的實驗結果（數(shù)據(jù)）有令人鼓舞的理論、實踐意義有動人的故事情節(jié)（story）,復旦大學 盧寶榮,每一個人都可能是“三者”,讀者作者編者,復旦大學 盧寶榮,1) 科學論文的特點,科學論文的關鍵特性：科學論文向讀者傳遞新知識 清楚 簡單 易懂科學論文撰寫須選擇特

21、定語言,?,復旦大學 盧寶榮,,科學論文的格式 ?,AcknowledgementsReference / literature citedTablesFigure legendsFigures Appendices,TitleAuthorsAddressAbstract / summaryKey wordsIntroductionMaterial & methodsResultsDiscussion,

22、復旦大學 盧寶榮,2) 科學論文的一般格式,研究論文的“三部曲”,前奏： 標題、作者、摘要、關鍵詞主旋律：“IMMRD”尾聲：致謝、參考文獻等,復旦大學 盧寶榮,研究論文的“IMMRD”格式,I = IntroductionM&M = Material & methodR = ResultsD = Discussion,復旦大學 盧寶榮,,科學（研究）論文的格式,題目 & 摘要,前言,材料和方法,結果,

23、討論,復旦大學 盧寶榮,3) IMMRD 的功能,Introduction: What question was studied ? （研究的目的）Materials & methods: how & based on what the problem studied ? （如何實施的）,復旦大學 盧寶榮,,IMMRD 的功能,Results: what are the findings ? （發(fā)現(xiàn)了什么）Discu

24、ssion: what do the findings mean ? （新發(fā)現(xiàn)的意義）,復旦大學 盧寶榮,,其他格式,復旦大學 盧寶榮,Title & Abstract,Introduction,M & M,Conclusion,,,,,其他格式,復旦大學 盧寶榮,,4) 綜述論文的一般格式,什么是綜述論文 ？綜述某一學科領域或某一位（組）科學家的研究進展和現(xiàn)狀格式：Summarize

25、（總結）information that has been publishedAnalyze （分析）…Evaluate （評價）…Synthesize （整合）information that has been published,復旦大學 盧寶榮,5) 論文撰寫的步驟：,前奏：標題、作者、(摘要)、關鍵詞主旋律：組織論文的結果描述獲取結果的方法介紹論文的研究背景及目的討論研究結果的意

26、義尾聲：致謝、參考文獻 …,復旦大學 盧寶榮,,科學論文的格式,題目 & …,Introduction,Materials & methods,Results,Discussion,復旦大學 盧寶榮,A. 如何撰寫論文的題目,論文題目的重要性：論文的題目會被大量讀者閱讀（看到） 好題目的特點：以最少的文字，但最大限度地表述論文的內(nèi)容題目不適宜將導致論文被埋沒或無緣被需要的讀者閱讀,復旦大學 盧寶榮,前奏,論文題目

27、要意思明確,科學論文的題目應該使用意思明確語句使用太“泛”的語句將使題目顯得毫無意義例如：“A study of rice”是一個好的論文題目么？論文題目中的三要素：科學發(fā)現(xiàn)（結論）、研究材料、研究方法,復旦大學 盧寶榮,,,,,復旦大學 盧寶榮,,,,,復旦大學 盧寶榮,,Running title/ 短題目： 用于“頁首”簡短版本的題目,,復旦大學 盧寶榮,,,復旦大學 盧寶榮,,B. 論文摘要的撰寫,I have the

28、strong impression that scientific communication is being seriously hindered by poor quality abstract written in jargon-ridden & mumbo-jumbo -- Sheila M. Mcnab,復旦大學 盧寶榮,摘要應該包括哪些最基本的信息？Minimum

29、information elements,P = purpose of the study（目的）M = methodology（方法）R = results（結果）C = conclusion (& recommendations)（結論&建議）PMRC: 可以代表論文摘要的核心要點,復旦大學 盧寶榮,,復旦大學 盧寶榮,C. 如何撰寫前言,復旦大學 盧寶榮,主旋律,,Title & …,前言,Mate

30、rials & methods,Results,Discussion,科學論文的格式,復旦大學 盧寶榮,前言的作用？,Introduction: What question was studied ? （研究的目的）提供本研究足夠的相關背景信息和目的介紹本研究提出的科學問題：為什么重要？目前知道多少？為什么必須研究？讓讀者（編輯/審稿人）能理解和評價研究結果的意義,復旦大學 盧寶榮,前言Introduction 撰

31、寫的“路線圖”,提出問題,聚焦問題提出假設,綜述和回顧,解決問的題方法,,,,,研究目的（結論）,復旦大學 盧寶榮,D. 如何撰寫材料和方法,復旦大學 盧寶榮,Title & …,Introduction,材料 & 方法,Results,Discussion,科學論文的格式,復旦大學 盧寶榮,撰寫材料和方法的目的？,幫助讀者（編輯/審稿人）理解論文獲得的結果材料和方法的 2 點作用：為有經(jīng)驗的讀者提供重復試驗并驗證結

32、果正確性的機會為審稿人/編輯提供判斷結果是否具有可靠性的基礎,復旦大學 盧寶榮,材料和方法中的副標題,II. DNA extraction DNA from……,III. PCR and electrophoresis The extracted DNA samples……,IV. Data analysis All the collected data were analyzed using…

33、…,I. Plant Materials Twenty-two accessions of……,復旦大學 盧寶榮,E. 如何撰寫結果,復旦大學 盧寶榮,Title & …,Introduction,Materials & methods,結果,Discussion,科學論文的格式,復旦大學 盧寶榮,結果的意義,“結果”決定了一篇論文的科學價值和重要程度 結果是論文的引擎或“駕駛”結果是實驗研究所獲得的

34、“數(shù)據(jù)”,復旦大學 盧寶榮,如何表現(xiàn)“數(shù)據(jù)”?,原則：簡單從記錄本中將原始數(shù)據(jù) “轉移”到論文中的做法不可取要將數(shù)據(jù)變成有用的知識信息應該在結果中包括：有意義的數(shù)據(jù)經(jīng)過消化（分析）的數(shù)據(jù)結果（數(shù)據(jù)）的呈現(xiàn)要有效和有趣,復旦大學 盧寶榮,科學內(nèi)容（science）是論文的精髓,“As long as the science is good & can be clearly understood, I don’t wor

35、ry too much about the English – I have copy editors who can fix that.” （澳大利亞一科學雜志主編）一篇科學論文的關鍵在于：好的科學內(nèi)容清楚易懂的文體,復旦大學 盧寶榮,結果中最忌諱的是重復,結果表現(xiàn)中最易犯的錯誤是重復正文的描述重復表和圖中的內(nèi)容表中重復圖中的內(nèi)容最糟糕的情況是正文中有表和圖的部分或所有內(nèi)容在圖和表的引用時應避

36、免冗長的描述，例如： “It was clearly shown in Table 1 that wild rice was of great diversity in China”“Wild rice in China had great diversity (Table 1)”,復旦大學 盧寶榮,結果中的中的副標題,II. PCR products and electrophoresis A great geneti

37、c variation of was detected by electrophoresis of … (Table 1) …,III. Variation patterns Statistic analysis show that ……,I. An effective DNA extraction method DNA samples are usually difficult to be collected

38、 from……,復旦大學 盧寶榮,F. 如何撰寫討論,復旦大學 盧寶榮,Title & …,Introduction,Materials & methods,Results,討論,科學論文的格式,復旦大學 盧寶榮,為什么要進行討論（目的）,討論獲得結果的重要意義？通?！坝懻摗笔怯脕?解釋 結果（的意義）指出 結果是否驗證了研究的科學假設及意義比較 將研究結果與其他工作相比較,復旦大學 盧寶榮,如何進行討論？,特別

39、要重視重訪“前言”中提到的科學問題和假設討論研究結果可能帶來的的理論意義和應用價值盡量清楚闡述和給出論文的結論對每一條結論均提供充足的證據(jù),復旦大學 盧寶榮,英文論文的時態(tài),Introduction — 現(xiàn)在時 & 過去時) M & M — 過去時Results — 過去時Discussion — 現(xiàn)在時 & 過去時,復旦大學 盧寶榮,8. 如何撰寫致謝和引用參考文獻,復旦大學 盧寶榮,尾聲,向誰進行

40、致謝 ?,支持該研究的基金（基金號. xxx）對本研究的實驗工作有重要幫助的同事對論文的撰寫和修改提出建設性意見的專家,復旦大學 盧寶榮,問 題？,復旦大學 盧寶榮,74,祝大家事業(yè)成功！Good luck with your scientific career！,Thank you !,千里之行，始于足下A thousand miles’ journey starts from the first steps,復旦大學 盧寶榮