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1、第二節(jié)、真核生物基因結(jié)構(gòu)及功能,一、基因的概念 基因的概念隨著分子遺傳學(xué)、分子生物學(xué)、生物化學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)展而不斷完善。從遺傳學(xué)角度看: 基因是生物的遺傳物質(zhì),是遺傳的基本單位----突變單位、重組單位和功能單位。從分子生物學(xué)角度看: 基因是負(fù)載著特定遺傳信息的DNA分子片段,在一定條件下能夠表達(dá)這種遺傳信息,執(zhí)行特定的生理功能。,1,一)基因的一般特性,從分子水平看,基因有以下基本特
2、性: 1、Gene自我復(fù)制------半保留復(fù)制 2、基因決定性狀: Protein Gene→mRNA → enzyme 淘汰 3、Gene突變 生物進(jìn)化
3、 保留 遺傳病,,,,2,二)Gene類別,依其功能分為:1、結(jié)構(gòu)Gene---編碼蛋白和酶分子結(jié)構(gòu);2、調(diào)控Gene---調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)基因表達(dá);3、轉(zhuǎn)錄而不翻譯的Gene: rDNA Gene→rRNA→核仁形成區(qū),
4、核糖體組成。 tRNA Gene→tRNA→轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸。,3,三)原核與真核生物基因比較,原核生物Gene:無核膜,散在細(xì)胞質(zhì)。一般只有一個(gè)DNA或RNA分子,Gene 是連續(xù)的。大多數(shù)是雙鏈環(huán)狀,少數(shù)為單鏈、線狀;如:大腸桿菌,雙鏈環(huán)狀DNA分子,3000~4000個(gè) 基因,4.2x106 bp,已經(jīng)定位900多個(gè)基因真核生物Gene:有核膜,在核中和C質(zhì)的線粒體中。Gene結(jié)構(gòu)復(fù)雜,斷裂基
5、因,3~4萬個(gè)Gene;Gene大小差別很大。β珠蛋白 基因(1700bp)=3個(gè)外顯子+2個(gè)內(nèi)含子。DMD基因(2300kb) 79個(gè)外顯子 , 78個(gè)內(nèi)含子。 (迄今認(rèn)識(shí)的最大的基因),4,二、真核生物基因結(jié)構(gòu),真核生物的結(jié)構(gòu)基因的DNA序列由編碼序列和非編碼序列兩部分組成,編碼序列是不連續(xù)的,被非編碼序列分割開來,稱為斷裂基因(split gene)。1、外顯子和內(nèi)含子2、側(cè)翼序列與調(diào)控序列 2
6、.1 啟動(dòng)子 2.2 增強(qiáng)子 2.3 終止子,5,1、外顯子和內(nèi)含子,在結(jié)構(gòu)基因中,編碼序列稱為外顯子(exon),表達(dá)多肽鏈部分。非編碼序列稱為內(nèi)含子(Intron),又稱插入序列。β珠蛋白 基因(1700bp)=3個(gè)外顯子+2個(gè)內(nèi)含子。DMD基因(2300kb)=79個(gè)外顯子+ 78 個(gè)內(nèi)含子。(迄今認(rèn)識(shí)的最大的基因),6,外顯子和內(nèi)含子,真核生物內(nèi)含子和
7、外顯子 不是完全固定不變的,有時(shí)同一DNA 鏈上的某一段DNA序列,當(dāng)它作為編碼某一多肽鏈的基因時(shí)是外顯子,而作為編碼另一多肽鏈時(shí),則是內(nèi)含子。這樣,同一基因卻可以轉(zhuǎn)錄兩種或兩種以上的mRNA。真核生物某些結(jié)構(gòu)Gene沒有內(nèi)含子,如組蛋白Gene,干擾素Gene等。它們多以基因簇形式存在,大多數(shù)的酵母結(jié)構(gòu)Gene也沒有內(nèi)含子。,7,5`GT——AG3`法則,在每個(gè)外顯子和內(nèi)含子的接頭區(qū)都是一段高度保守的共有序列,內(nèi)含子的5`端是GT,
8、3端是AG,這種接頭方式稱為GT-AG法則,普遍存在于真核生物中,是RNA剪接的識(shí)別信號(hào),轉(zhuǎn)錄后的前體RAN中的內(nèi)含子剪接位點(diǎn)。,8,2、側(cè)翼序列與調(diào)控序列,每個(gè)結(jié)構(gòu)基因的第一個(gè)和最后一個(gè)外顯子的外側(cè),都有一段不被轉(zhuǎn)錄的非編碼區(qū),稱為側(cè)翼序列(Flanking sequence)。 它是基因的調(diào)控序列,對基因的有效表達(dá)起調(diào)控作用,包括:啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、終止子等。,9,2.1 啟動(dòng)子,啟動(dòng)子( Promoter)是一段特定的
9、核苷酸序列,位于Gene轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游的100bp 范圍內(nèi),是RNA聚合酶的結(jié)合部位,能促進(jìn)轉(zhuǎn)錄過程。Promoter決定DNA中的轉(zhuǎn)錄鏈。TATA框(TATA Box)是一段高度保守序列,7個(gè)bp,TATAA/ TAA/T,位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游25~30 bp(-30~50)。TATA框與轉(zhuǎn)錄因子TFII結(jié)合,再與RNA 聚合酶II形成復(fù)合物,從而準(zhǔn)確地識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始位置,對轉(zhuǎn)錄水平有定量效應(yīng)。,10,CAAT框(CAAT Box):是
10、一段保守序列,9bp,GGGC/TCAATAC, 位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游-70~-80bp,轉(zhuǎn)錄因子CTF識(shí)別位點(diǎn)并與之結(jié)合,激活轉(zhuǎn)錄。GC框(GC Box):順序?yàn)镚GCGGG,有兩個(gè)拷貝,位于CAAT Box兩側(cè),與轉(zhuǎn)錄因子SP1結(jié)合。(SP1有鋅指區(qū)可以與DNA結(jié)合,在N端有激活轉(zhuǎn)錄的作用)GC框有激活轉(zhuǎn)錄的功能。,11,2.2 增強(qiáng)子,增強(qiáng)子(Enhancer)包括啟動(dòng)子上游或下游的一段DNA序列,可以增強(qiáng)啟動(dòng)子發(fā)動(dòng)轉(zhuǎn)錄,提高轉(zhuǎn)
11、錄效率。 特點(diǎn):在任意位置都有效無方向性有組織特異性 例如:Beta珠蛋白Gene增強(qiáng)子是由串聯(lián)重復(fù)的兩個(gè)72bp長的相同序列組成,位于轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)上游-1400bp或下游3300bp處,均可增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率(活性)200倍。增強(qiáng)子在轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上下游一定范圍內(nèi)增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率。作用可以是5’~3’,也可以是3’~5’方向。,12,2.3 終止子,終止子(Terminator)由一段回文序列以及特定的序列
12、(PolyA)5’--AATAAA--3’組成?;匚男蛄袨檗D(zhuǎn)錄終止號(hào)。PolyA為附加信號(hào)。終止子為反向重復(fù)序列,是RNA聚合酶停止工作的信號(hào),反向重復(fù)序列轉(zhuǎn)錄后,可以形成發(fā)夾式結(jié)構(gòu),并且形成一串U。發(fā)夾式結(jié)構(gòu)阻礙了RNA聚合酶的移動(dòng)。一串U的U與DNA模板中的A的結(jié)合不穩(wěn)定,從模板上脫落下來,終止轉(zhuǎn)錄。,13,2.4 調(diào)控序列,調(diào)控序列(Regulator Sequence)包括啟動(dòng)子,增強(qiáng)子和終止子均屬于基因的順式調(diào)控因子(順式
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