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1、現(xiàn)代生物學(xué)的發(fā)展促進(jìn)了生物信息學(xué)的產(chǎn)生。生物信息學(xué)是將信息學(xué)的理論技術(shù)應(yīng)用于生物數(shù)據(jù)的管理和分析,是數(shù)學(xué)、物理學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、化學(xué)、生命科學(xué)等多學(xué)科的交叉學(xué)科。生物信息學(xué)研究的范圍十分廣泛,其中數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建就是一個(gè)重要方面。如何用理論和計(jì)算的方法識(shí)別和預(yù)測(cè)內(nèi)含子和外顯子也是目前生物信息學(xué)研究工作的重要任務(wù)。本課題通過(guò)自編程序建立了以中國(guó)馬品種資源為主的中國(guó)馬業(yè)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)www.chinahorse.org.cn。并在建立數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上,
2、初步實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)用,包括基于Web的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)的網(wǎng)絡(luò)化查詢等。它將為建立馬品種資源的科學(xué)研究平臺(tái)打下基礎(chǔ)。 本研究的主要內(nèi)容及結(jié)果如下: 1.建立了專(zhuān)一化、系統(tǒng)化、完整化的馬業(yè)科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。序列數(shù)據(jù)庫(kù)中以基因數(shù)據(jù)庫(kù)和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)為主,非序列數(shù)據(jù)庫(kù)以文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)和圖片數(shù)據(jù)庫(kù)為主。其中,馬的基因數(shù)據(jù)庫(kù)中的記錄量超過(guò)了2萬(wàn),馬的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)的記錄超過(guò)3萬(wàn)。 2.建立了中國(guó)馬物種資源數(shù)據(jù)庫(kù)。涉及品種的外貌、類(lèi)型、典型特征等多個(gè)性狀,為從事
3、中國(guó)物種品種遺傳資源的利用與保護(hù)提供了參考。 3.建立了馬生物信息學(xué)研究平臺(tái)??梢詫?duì)基因和蛋白質(zhì)進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)研究,對(duì)于進(jìn)行科研和教學(xué)具有一定價(jià)值。 4.建立了馬業(yè)科學(xué)實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)站與馬業(yè)論壇。可以通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)的檢索,提高了數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用效率。網(wǎng)站的建設(shè)還可以為數(shù)據(jù)庫(kù)的更新帶來(lái)方便,也為本研究領(lǐng)域內(nèi)的交流與合作起到橋梁作用。本研究還通過(guò)對(duì)已發(fā)表的馬全基因組序列的密碼子使用頻率做了初步的統(tǒng)計(jì)分析工作并對(duì)內(nèi)含子和外顯子進(jìn)行了預(yù)測(cè)?;?/p>
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