重復(fù)序列Itf_1，Itf_2在甘薯核型分析中的應(yīng)用與甘薯及其近緣野生種ITS序列鑒定.pdf

1、本研究選取與栽培種親緣關(guān)系最近的，被公認(rèn)為最有可能是甘薯祖先種的I.trifida（2x），采用二代測(cè)序、克隆、FISH等技術(shù)，對(duì)其重復(fù)序列進(jìn)行了檢出，并很好的運(yùn)用于二倍體 I.trifida的核型標(biāo)準(zhǔn)化，鑒定了I.trifida（6x）與 I. batatas′Xushu18′的核型。另選用10份甘薯近緣野生種材料，通過(guò)對(duì)rDNA ITS序列的分析，鑒定了其與栽培種甘薯（Ipomoea batatas′Xushu18′）之間的親緣關(guān)系

2、。以上分析結(jié)果如下：
　　1.通過(guò)雜交組合分析，篩選出了2個(gè)具有代表性的重復(fù)序列，并將其命名為Itf_1及Itf_2。兩個(gè)序列在I.trifida（2x）上分別顯示8對(duì)和4對(duì)信號(hào)，二者間有4個(gè)信號(hào)位于相同染色體上，Itf_1有1對(duì)信號(hào)與45S部分重疊，Itf_2與5S的1對(duì)信號(hào)部分重疊。
　　2.Itf_1、45S、5S在I.trifida（2x），I.trifida（6x）與I. batatas′Xushu18′中的信號(hào)數(shù)

3、目隨著倍性增加而增加，六倍體信號(hào)數(shù)目為二倍體的3倍；Itf_2在二倍體上顯示的信號(hào)為4對(duì)，在兩個(gè)六倍體中卻為12個(gè)，而不是三倍化的24個(gè)。
　　3.Itf_1、Itf_1、45S與5S序列的定位很好的進(jìn)行了I.trifida（2x）核型標(biāo)準(zhǔn)化及I.trifida（6x）與I. batatas′Xushu18′的核型分析，均繪制了模式圖。核型比較結(jié)果顯示了三者之間較近的親緣關(guān)系。
　　4.甘薯及其近緣野生種nrDNA ITS序

4、列長(zhǎng)度在570-600bp之間，ITS1序列為185-209bp，其（G+ C）含量為53.11％-61.83%；ITS2序列為214-226bp，其（G+ C）含量為61.21%-72.89%；5.8S序列均為165bp，其（G+ C）含量為54.55%-55.76%；信息位點(diǎn)均集中在ITS1和ITS2上；
　　5.系統(tǒng)進(jìn)化分析表明，栽培種甘薯（I. batatas′Xushu18′）和野生種I. triloba、I. cord