小麥4A染色體六個(gè)農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、小麥?zhǔn)鞘澜缟献钪饕募Z食作物之一，不斷提高其單位面積產(chǎn)量一直是現(xiàn)代育種的主要目標(biāo)。小麥產(chǎn)量及其相關(guān)性狀多數(shù)為數(shù)量性狀，研究這些數(shù)量性狀位點(diǎn)（QTL）可為分子標(biāo)記輔助選擇和基因克隆奠定一定的基礎(chǔ)，進(jìn)而指導(dǎo)小麥良種的選育。關(guān)聯(lián)分析是一種以連鎖不平衡（LD）為基礎(chǔ)，鑒定某一群體內(nèi)性狀與遺傳標(biāo)記或候選基因關(guān)系的方法，已成為研究植物基因（QTL）的有效手段之一。
　　 本研究以103份冬性小麥種質(zhì)為材料，首先利用背景標(biāo)記明確這些材料的遺傳

2、多樣性、群體結(jié)構(gòu)（Q）和系譜關(guān)系矩陣（K）；然后通過(guò)檢測(cè)材料中4A染色體上Genomic-SSR標(biāo)記的多態(tài)性，分析4A染色體的連鎖不平衡結(jié)構(gòu)；同時(shí)對(duì)供試材料六個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行重復(fù)的表型鑒定；最后在考慮Q和K的基礎(chǔ)上，進(jìn)行4A染色體上標(biāo)記多態(tài)性與六個(gè)農(nóng)藝性狀之間的關(guān)聯(lián)分析，鑒定出控制六個(gè)農(nóng)藝性狀的QTL。獲得的主要結(jié)果如下：
　　 1．本研究選用49個(gè)Genomic-SSR和40個(gè)EST-SSR標(biāo)記位點(diǎn)對(duì)供試材料進(jìn)行了遺傳多樣性和群

3、體結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明：89個(gè)位點(diǎn)共擴(kuò)增出531個(gè)等位變異，平均每個(gè)位點(diǎn)5.97個(gè)；平均基因多樣性和多態(tài)性信息量（PIC）分別為0.63和0.57，說(shuō)明供試材料遺傳多樣性比較豐富，可用于關(guān)聯(lián)分析；利用NJ法聚類和群體結(jié)構(gòu)分析均將供試材料劃分為六大類群，且聚類結(jié)果基本吻合；群體結(jié)構(gòu)分析還闡明了各材料的遺傳組成，推測(cè)66％的材料血緣相對(duì)比較單一，34％的材料擁有混合來(lái)源。
　　 2．利用小麥4A染色體上的31對(duì)Genomic-SSR引

4、物（標(biāo)記平均間隔距離為2.4cM）對(duì)103份供試材料進(jìn)行標(biāo)記多態(tài)性分析。結(jié)果表明：31對(duì)引物共擴(kuò)增出208個(gè)等位變異，平均6.7個(gè)：平均基因多樣性和PIC分別為0.59和0.55；確定了群體的背景LD值為r2=0.054，并計(jì)算出4A染色體上標(biāo)記間LD衰減距離為～3cM，適合基于基因組掃描的關(guān)聯(lián)分析；同時(shí)在4A染色體長(zhǎng)臂和著絲點(diǎn)附近發(fā)現(xiàn)了3個(gè)LD blocks。
　　 3．利用TASEELV2.01軟件中的混合線性模型進(jìn)行標(biāo)記與