我國籠養(yǎng)食蟹猴種群遺傳多樣性與親子鑒定研究.pdf

1、食蟹猴(Macaca Fascicularis)是實(shí)驗(yàn)靈長類動(dòng)物中用量最大的物種,我國飼養(yǎng)種群全部來源于東南亞各國,卻已經(jīng)成為飼養(yǎng)實(shí)驗(yàn)食蟹猴最大的輸出國。為了清晰掌握我國飼養(yǎng)食蟹猴種群的遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳譜系并提供有效的遺傳監(jiān)測方法,本文利用微衛(wèi)星DNA和MHC基因連鎖的微衛(wèi)星作為分子標(biāo)記,構(gòu)建了快速便捷的復(fù)合擴(kuò)增體系:并對我國飼養(yǎng)食蟹猴群體進(jìn)行了系統(tǒng)的遺傳學(xué)研究,得到以下研究結(jié)果:
　　 1.利用文獻(xiàn)上和GenBank上的引物,本

2、文將所選的24對微衛(wèi)星DNA引物和6對MHC基因連鎖的微衛(wèi)星引物進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增體系構(gòu)建,成功地構(gòu)建了以6個(gè)微衛(wèi)星座位為一個(gè)組合的復(fù)合擴(kuò)增體系。并獲得了對食蟹猴有效的、對檢測數(shù)據(jù)無干擾的18個(gè)微衛(wèi)星座位和6個(gè)MHC微衛(wèi)星座位,為食蟹猴物種提供了快速便捷有效的遺傳分析方法。
　　 2.微衛(wèi)星DNA遺傳分析表明,我國飼養(yǎng)食蟹猴種群具有較高的遺傳多樣性。其18個(gè)微衛(wèi)星基因座的等位基因數(shù)為9-20,平均等位基因數(shù)為16.21,有效等位基因數(shù)

3、為3.7497-13.5035,平均等位基因數(shù)為8.65;多態(tài)信息含量為0.6921-0.9679,平均多態(tài)信息含量為0.8631;觀察雜合度在0.3548-0.8897,平均觀察雜合度為0.6533;期望雜合度為0.7333-0.9259,平均期望雜合度為0.8656,觀察雜合度與期望雜合度之間的最小差值為0.0254(D6S1691),最大差值為0.5711(D22S280);Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)處于不平衡狀態(tài);基因

4、流為2.2806-12.6265,其平均值為5.2992。
　　 3.MHC基因連鎖的STR標(biāo)記分析表明,所選的MHC基因連鎖的STR在我國食蟹猴種群中具有較好的多態(tài)性。其6個(gè)基因座的等位基因數(shù)為4-22,平均等位基因數(shù)為15,有效等位基因數(shù)為2.5944-13.7317,平均等位基因數(shù)為6.9646;多態(tài)信息含量為0.5465-0.9225,平均為0.7620;觀察雜合度在0.4142-0.9588,平均觀察雜合度為0.718

5、3;期望雜合度為0.6311-0.9272,平均期望雜合度為0.7867,觀察雜合度與期望雜合度之間的最小差值為0.0035(D6S2741),最大差值為0.3489(Dqcar);Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)MICA與D6S2741兩個(gè)位點(diǎn)處于平衡狀態(tài),其余4個(gè)位點(diǎn)不平衡;各位點(diǎn)的基因流為1.8145-9.2045,平均為4.2711。
　　 4.利用MHC基因連鎖的STR標(biāo)記分析食蟹猴與恒河猴之間的遺傳差異。經(jīng)過比較

6、食蟹猴表觀等位基因和有效等位基因均分別為15和6.9646,恒河猴等位基因和有效等位基因均分別為13和5.3922,即食蟹猴的等位基因數(shù)均比恒河猴多。食蟹猴的觀察雜合度與期望雜合度分別為0.7183和0.7867,恒河猴的表觀雜合度與期望雜合度分別為0.6712和0.7380,即食蟹猴的觀察雜合度與期望雜合度之間的差值比恒河猴之間的少。食蟹猴的基因流為4.2711,恒河猴的基因流5.2949,食蟹猴的基因流比恒河猴的基因流小。