異源四倍體棉花分子遺傳圖譜構建和纖維品質(zhì)QTL定位.pdf

1、遺傳基礎狹窄已經(jīng)成為目前限制陸地棉遺傳改良的主要因素。在陸地棉和海島棉間進行優(yōu)良基因的高效轉移滲透對二者的遺傳改良具有極為重要的現(xiàn)實意義，而限制這一過程的主要因素是連鎖累贅。分子遺傳圖譜無論在基因定位和輔助選擇以及重要基因的圖位克隆方面,還是在研究棉花的基因組組織結構和起源進化方面都具有重要的理論和應用價值。本研究以海陸雜交群體為基礎，構建了四倍體棉花的分子遺傳圖譜并對纖維品質(zhì)等性狀進行了QTL 標記定位研究。研究的主要結果如下：

2、>　　 1、從2701 對SSR 引物中篩選出753 對多態(tài)性引物，選取其中335 對引物對群體進行分子檢測，獲得372個標記位點。本研究最終用于圖譜構建的SSR 標記位點數(shù)為209個，其中包含121 對錨定引物。對209個標記位點的標記基因型分析表明該群體分離正常，符合遺傳圖譜構建要求。
　　 2、采用連鎖測驗標準LOD值為3.5，最大連鎖距離設為50cM，將209個多態(tài)性標記位點定位到29個連鎖群上，標記間平均遺傳距離為9

3、.6cM，連鎖圖譜覆蓋2010.7cM，約占棉花基因組的40.21％。所獲得的29個連鎖群可以定位到23條染色體和1條未知連鎖群上，分別為A1(chr.1)、D1(chr.15)、A2(chr.2)、D2(chr.4)、A3(chr.3)、D3(chr.7)、A4(chr.4)、D4(chr.22)、A5(chr.5)、D5(chr.19)、D6(chr.25)、A7(chr.7)、D7(chr.16)、A8(chr.8)、D8(chr

4、.24)、A9(chr.9)、A10(chr.10)、D10(chr.20)、A11(chr.11)、D11(chr.21)、A12(chr.12)、A13(chr.13)、D13(chr.18)和Unknown。
　　 3、對209個SSR 標記位點進行卡方檢驗，其中有30個（14.30％）表現(xiàn)偏分離，全部定位到染色體或連鎖群上。偏分離標記位點的分布在染色體或連鎖群以及A、D染色體亞組間很不均勻。分布在A染色體亞組（18.34

5、％）上的偏分離位點顯著多于D染色體亞組（10.20％）。在染色體9上發(fā)現(xiàn)明顯的偏分離標記聚集現(xiàn)象。
　　 4、以新構建的分子遺傳圖譜為基礎，利用BC1和BC1S1 群體表型數(shù)據(jù)，通過復合區(qū)間作圖法對四倍體棉花纖維品質(zhì)性狀進行QTL 定位分析，檢測到13個與纖維品質(zhì)性狀相關的QTL，分布于7條染色體上。纖維長度相關QTL 4個、整齊度2個、伸長率1個、馬克隆值3個、比強度3個，分別可以解釋表型變異的9.55％～19.36％、10.