華南野生蓖麻遺傳多樣性分析與核心種質(zhì)構(gòu)建.pdf

1、本文以258份華南野生蓖麻材料為基礎(chǔ),開展了基于表型標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)、SRAP分子標(biāo)記數(shù)據(jù)和SSR分子標(biāo)記數(shù)據(jù)的遺傳多樣性研究,初步構(gòu)建了華南野生蓖麻核心種質(zhì)。主要結(jié)果如下:
　　 一、利用13個性狀的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)、29對SRAP引物數(shù)據(jù)和30對SSR引物數(shù)據(jù)分別對194份、258份、258份華南野生蓖麻材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析。
　　 1、三種聚類結(jié)果的平均遺傳距離分別為為7.144、9.249和6.519,平均Shannon

2、指數(shù)分別為7.486、0.428和0.287,表明SRAP數(shù)據(jù)能更有效地反應(yīng)群體的遺傳多樣性,基因型值數(shù)據(jù)能更全面地反映群體的變異度。
　　 2、SRAP標(biāo)記檢測到的平均等位基因數(shù)與SSR標(biāo)記幾乎相等(分別為1.996和2),但平均有效基因基因數(shù)高于SSR標(biāo)記(分別為1.367和1.182),表明SRAP標(biāo)記檢測到的等位基因在群體中分布更均勻。SRAP標(biāo)記的平均Nei's基因多樣性值(0.263)和平均Shannon指數(shù)(0.4

3、28)高于SSR(0.287和0.153),SRAP標(biāo)記比SSR標(biāo)記更能反映出群體的遺傳分化度和遺傳變異度。
　　 3、三種聚類結(jié)果均表明,材料的親緣關(guān)系與地理遠(yuǎn)近沒有直接關(guān)系,但小范圍內(nèi),材料親緣關(guān)系往往較近。同一地區(qū)的材料在小組中成組趨勢明顯。
　　 4、廣東的材料遺傳多樣性最豐富,廣西次之,海南最低。
　　 二、采用混合線性模型,用最小范數(shù)二階無偏估算法(Minimum Norm QuadraticUnbi

4、ased Estimation,MINQUE)估計各項隨機(jī)效應(yīng)方差,用調(diào)整無偏預(yù)測法(AdjustedUnbiased Prediction,AUP)估算數(shù)量性狀的基因型值,用UPGMA法聚類后,分別以5％、10％、15％、20％、25％、30％的抽樣比例,以最小距離逐步取樣法(LDSS)抽樣,構(gòu)建了6個初級核心子集,經(jīng)代表性評價后從中確定初選核心種質(zhì)；在此基礎(chǔ)上,以6種壓縮方式(基因型值、SRAP、SSR、基因型值+SRAP、基因型值

5、+SSR、基因型值+SRAP+SSR)和3種取樣策略(最小距離逐步聚類隨機(jī)取樣(LDSRS)、最小距離逐步聚類優(yōu)先取樣(LDSPS)和最小距離逐步聚類偏離度取樣(LDSDS))構(gòu)建備選核心子集,根據(jù)對備選核心子集的代表性評價結(jié)果建立備選核心種質(zhì)和核心種質(zhì)。
　　 1、抽樣比例為25％的初級核心子集代表性最好,宜作為初選核心種質(zhì)。
　　 2、初選核心種質(zhì)的平均Shannon(I)指數(shù)達(dá)到原群體的72.96％,平均Simps

6、on(H)指數(shù)達(dá)原群體的98.49％,F值和t值均不顯著,數(shù)量性狀的方差、均值和極差的相關(guān)系數(shù)均高于0.98,數(shù)量性狀變異系數(shù)的相關(guān)系數(shù)為0.5496,均值差異百分率為0.00,方差差異百分率為100％,極差符合率為94.39％,變異系數(shù)變化率為120.59％,對原始群體有較好的代表性。
　　 3、對六種壓縮方式和三種取樣策略的比較分析結(jié)果顯示,以“基因型值+SRAP+SSR”結(jié)合最小距離逐步聚類優(yōu)先取樣法構(gòu)建核心種質(zhì)效果最佳。

7、
　　 4、根據(jù)評價參數(shù)及遺傳多樣性分析結(jié)果,初步確定194份華南野生蓖麻的核心種質(zhì)由以下12份材料組成:HN-HK10、HN-LV55、HN-LV58、GX21、GX29、GX73、DHD66、ZJ95、LZ23、LZ36、YJ2、HY1,占原群體的6.19％。
　　 5、核心種質(zhì)的平均Shannon(I)指數(shù)為0.648,平均Shannon(I)指數(shù)為2.013,F值和t值均不顯著,數(shù)量性狀的方差、均值和極差的相關(guān)系