Molecular characterization of begomoviruses infecting Vernonia cinerea and Ipomoea indica.pdf

1、雙生病毒(雙生病毒科)植物病毒中具有孿生顆粒形態(tài)的單鏈環(huán)狀DNA病毒,已在多個(gè)國家和地區(qū)的多種重要經(jīng)濟(jì)作物上造成毀滅性危害。根據(jù)雙生病毒基因組結(jié)構(gòu)、介體種類、寄主范圍的不同將雙生病毒科劃分為四個(gè)屬,其中菜豆金色花葉病毒屬是種類最多、分布最廣、危害最為嚴(yán)重的一個(gè)屬,在自然條件下一般通過煙粉虱(Bemisia tabaci)以持久性方式傳播,侵染雙子葉植物。多數(shù)菜豆金色花葉病毒屬病毒為雙組份基因組,即DNA-A和DNA-B。而有些為單組份病

2、毒,其基因組結(jié)構(gòu)相當(dāng)于雙組份病毒的DNA-A。多數(shù)舊世界的單組份雙生病毒還伴隨有單鏈DNA衛(wèi)星分子為betasatellites(DNA-β),DNA-β不能自主復(fù)制。需依賴丁輔助病毒編碼的蛋白進(jìn)行復(fù)制和系統(tǒng)運(yùn)輸,并且多數(shù)DNA-β與癥狀誘導(dǎo)相關(guān)。很多雙生病毒／DNA-β復(fù)合物中還伴隨有第三類病毒組分,即alphasatellite(DNA1),DNA1不能單獨(dú)侵染植物,必須依賴于輔助病毒進(jìn)行包裹、移動和系統(tǒng)侵染,對病毒的致病性幾乎沒有

3、影響。在中國,越來越多的菜豆金色花葉病毒被鑒定。
　　 有效的疾病控制策略需要對雙生病毒的感染作出準(zhǔn)確和精確地診斷,單由癥狀的觀察不能對感染的雙生病毒作出可靠的診斷,因?yàn)楦啻嬖诘氖莾蓚€(gè)或兩個(gè)以上病毒的混合侵染。分子診斷提供了一個(gè)具體的病毒病原鑒定的可靠工具。本文對侵染夜香牛及甘薯的雙生病毒進(jìn)行了分子鑒定。
　　 夜香牛(Vernonia cinerea)樣品采自福建省,病株表現(xiàn)為黃脈癥狀。利用雙生病毒的簡并引物PA／P

4、B擴(kuò)增到約500 bp的片段,片段克隆測序結(jié)果顯示為雙生病毒DNA-A的非編碼區(qū)和外殼蛋白基因的部分區(qū)域。根據(jù)此500bp片段設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增病毒全長基因組序列,得到一條2.7kb的片段,通過在Genebank中進(jìn)行BLAST同源性檢索發(fā)現(xiàn),它與分離自印度的夜香牛黃脈病毒(VeYVV)相似性最高,達(dá)78.9％。與之前的報(bào)道相一致,伴隨有VeYVV的還有DNA-β和DNA1衛(wèi)星分子,前者顯示與夜香牛黃脈病毒伴隨的DNA-β分子(VeYVB)有

5、52.1％的同源性,后者顯示與棉花無癥病毒伴隨的DNA1分子(GMusSLA)相似性最高為70.7％。鑒于雙生病毒的分類命名規(guī)則,我們將此命名為福建夜香牛黃脈病毒(Vernoniayellow vein Fujian virus,VeYVFjV)。
　　 甘薯曲葉病毒(Sweet potato leaf curl virus,SPLCV)可在甘薯上引起毀滅性的危害,已經(jīng)在包括美洲、亞洲、非洲以及歐洲的大陸上鑒定了很多種甘薯曲葉病

6、毒及其相關(guān)雙生病毒。同樣在中國,甘薯曲葉病毒引起的曲葉病的危害性也得到了廣泛的注意。甘薯曲葉病毒感染植物后主要引起曲葉、褪綠、黃色斑駁等癥狀。為了明確存在中國的甘薯曲葉病毒的株系,本研究采用分子生物學(xué)的診斷方法對從江蘇和云南兩省采來帶有類似雙生病毒癥狀的銳葉牽牛進(jìn)行了鑒定。使用通用引物PA／PB獲得了500 bp長的DNA片段,然后進(jìn)行克隆和測序。測序結(jié)果可知,兩個(gè)樣品的500 bp長的DNA片段與甘薯曲葉病毒的序列同源性大于89％,按