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1、基因芯片技術(shù)是研究不同品種及處理間基因差異表達(dá)的有效手段,它既能直觀反映出基因組中各基因間的相互關(guān)系,也能表現(xiàn)出不同條件下基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控水平,從而通過(guò)基因組轉(zhuǎn)錄效率來(lái)獲得共同表達(dá)的基因信息,有助于篩選目的基因。本研究運(yùn)用基因芯片技術(shù)對(duì)大豆質(zhì)核互作雄性不育系NJCMS2A與其保持系NJCMS2B間差異表達(dá)基因進(jìn)行研究,尋找大豆雄性不育相關(guān)基因,為利用基因工程方法創(chuàng)造大豆雄性不育新材料提供基礎(chǔ)。獲得主要結(jié)果如下:
1.通過(guò)基因
2、芯片數(shù)據(jù)比較大豆質(zhì)核互作雄性不育系NJCMS2A及其保持系NJCMS2B的基因表達(dá)情況,篩選出NJCMS2A與NJCMS2B之間差異2倍以上的基因2176條,其中上調(diào)表達(dá)基因1631條、下調(diào)表達(dá)基因545條。利用GO(GeneOntology)分類(lèi),對(duì)P<0.01、差異2.5倍以上的174條差異表達(dá)基因進(jìn)行進(jìn)一步的功能分類(lèi),結(jié)果表明這些基因主要涉及催化活性、物質(zhì)運(yùn)輸、代謝過(guò)程、生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞繁殖、細(xì)胞器組成等。根據(jù)基因的ID,確定差異表
3、達(dá)基因的EST序列,再進(jìn)行大量的比對(duì)分析、查找資料,從這174個(gè)基因中發(fā)現(xiàn)一些與大豆雄性不育可能有重要關(guān)系的基因包括ATP酶相關(guān)基因、多聚半乳糖醛酸酶相關(guān)基因等。
2.分別從NJCMS2A和NJCMS2B中克隆了Gmatp9基因,序列比較分析表明在NJCMS2A與NJCMS2B中Gmatp9基因序列存在2個(gè)堿基的差異,熒光定量PCR分析結(jié)果顯示Gmatp9基因在NJCMS2A中的表達(dá)量顯著高于NJCMS2B,與基因芯片的分
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