玉米全基因組IQD基因的分析及進(jìn)化研究.pdf

1、獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同二[作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示謝意。學(xué)位論文作者簽名：壘＆簽字日期：刀J≯年b月，日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用

2、學(xué)位論文的規(guī)定，有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子文件，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫》，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文，向社會(huì)公眾提供信息服務(wù)。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書)。學(xué)位論文作者簽名：鎰簽字日期：偽7y年c|月9日學(xué)位論文作者畢業(yè)后去向：工作單位：通信地址：指導(dǎo)教師簽名：之絲簽字日期

3、：仍7b年b月了日電話：郵編：摘要鈣離子是植物細(xì)胞內(nèi)的第二信使參與了胞內(nèi)眾多的生理反應(yīng)。對(duì)于鈣離子受體蛋白的結(jié)合蛋白的研究，將有助與闡明CaM信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的特性及功能。近年來，對(duì)植物中的鈣調(diào)素結(jié)合蛋白類型基因的研究成為熱點(diǎn)問題。本研究通過使用生物信息學(xué)軟件對(duì)玉米全因組中的IQD類型基因進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析、系統(tǒng)進(jìn)化和表達(dá)分析，對(duì)于IQD基因的分子克隆和分子進(jìn)化的研究具有重要指導(dǎo)意義。獲得主要結(jié)果如下：1對(duì)玉米的全基因組進(jìn)行搜索比對(duì)和篩選，一共獲得3

4、1個(gè)不同的IQD基因。分別命名為ZmlQDlZmlQD31。通過進(jìn)化樹的分析，發(fā)現(xiàn)玉米與水稻，高粱的基因具有較高的同源性和共線性，表明玉米IQD類型基因與單子葉植物的親源性較近，而與雙子葉植物間的親源性相對(duì)較遠(yuǎn)，在進(jìn)化關(guān)系上出現(xiàn)物種間的差異性。2對(duì)玉米IQD類型基因進(jìn)行染色體物理位置的定位繪制，結(jié)果顯示31個(gè)IQD基因分散的分布在玉米的十條染色體上，8號(hào)染色體上最多，有7個(gè)基因；2、7號(hào)染色體最少，各有1個(gè)基因，沒有出現(xiàn)明顯的基因簇現(xiàn)象

5、，與其他物種的染色體定位具有相同特性。3對(duì)玉米IQD類型基因的結(jié)構(gòu)進(jìn)行比對(duì)，在進(jìn)化關(guān)系中同屬一個(gè)分類的IQD基因其基因結(jié)構(gòu)較為相似，所含內(nèi)含子與外顯子的個(gè)數(shù)也基本相同。在31個(gè)玉米IQD基因同源性比對(duì)分析表明組成IQD基因功能核心區(qū)域的氨基酸序列具有較高的相似性和重復(fù)性。4基序分析顯示玉米IQD類型基因包含有20種不同的基序。motif16這幾種基序出現(xiàn)在絕大多數(shù)玉米IQD基因中，而motif15，19，20這三種基序只在少數(shù)基因中出現(xiàn)