人胰島淀粉樣多肽hIAPP單體及二聚體與POPG磷脂膜相互作用的分子動力學(xué)模擬研究.pdf

1、目錄摘要IllABSTRACTIV第1章緒論11.1^1011.1.1缶白質(zhì)的錯誤折脊、聚集與疾病11.1.2hlAPP研究tl的及啟、義31.2人的胰島淀粉ff多肽（hIAPP)簡介31.2.1hIAPP的結(jié)構(gòu)31.2.2hIAPP的纖維化過程51.2.3hIAPP5性的可能機(jī)埋61.3POPG磷脂雙E膜10mm計算方法1121分了動力學(xué)模擬方法112.1.1分子動力學(xué)兌法112.1.2能量優(yōu)化方法122.1.3Berendsen溫度

2、fT強(qiáng)稱合142.1.4分了動力學(xué)模擬紓驗力場152.2分析力法17第3章hIAPP單體、二聚體與POPG膜相互作用的分子動力學(xué)研究203.1hIAPP單體、二聚體模擬體系203.1.1hIAPP單體、一.聚體體系搭建及環(huán)境設(shè)苒203.1.2校型及算法參數(shù)設(shè)S213.2模擬結(jié)果及分析223.2.1hIAPP申體模擬結(jié)果223.2.2hIAPP—聚休校擬結(jié)果243.2.3插入深度的i~J論273.2.40人鏈對膜穩(wěn)定件影響的分析303.2

3、.4.1月免農(nóng)面憐原子zdisplacement分析303.2.4.2SCD分析313.2.4.3膜￥度的分布333.2.5hIAPP中各氨基酸馬POPG磷脂胺相id乍川的能肀分析343.2.6投擬結(jié)果和討論363.3Hit38摘要一型糖尿病的發(fā)病與人胰島淀粉樣多肽（humanisletamyloidpolypeptidehIAPP或Amylin)的病理性聚集密切相關(guān)。越來越多的實驗數(shù)據(jù)表明hIAPP的細(xì)胞毒性很可能是由hIAPP聚集形

4、成的低聚體與人p細(xì)胞膜的相互作用導(dǎo)致的，因此研究hIAPP細(xì)胞膜的相互作用對了解hIAPP的細(xì)胞毒性機(jī)理有著非常重要的意義。然而，由于實驗方法在空間分辨和叫間分辨h的局限性，H前對hIAPP與細(xì)胞膜相互作用過程的原子水平信息并不完全了解。分子動力學(xué)模擬可以給出原子尺度上二者相互作用的詳細(xì)過程，從而彌補(bǔ)實驗方法的不足。木文中，我們米用全原子分子動力學(xué)枚擬研究了hIAPP單體（monomer)及二聚體（dimer)與POPG磷脂膜的相互作用

5、過程。能量分析顯示，靜電作用，尤其是帶正電的LysKArgil與POPG磷脂股的靜電吸引，在hIAPP與磷脂的相互作用過程中起主導(dǎo)作用。在這一過程中，hIAPP的一聚化主要通過肽鏈C端的2037這個片段完成。對二聚體與單體體系中位于POPG分子親水頭部的磷原子位置漲落、疏水尾巴序參數(shù)SCD以及POPG膜度的對比分析表明：hIAPP二聚體對POPG磷脂膜穩(wěn)定性的影響遠(yuǎn)高于爺體，并且這種影響來自于二聚體內(nèi)部肽鏈之間相互作用的協(xié)同性，這種協(xié)同