哲羅鮭免疫球蛋白重鏈序列研究.pdf

1、哲羅鮭在分類學(xué)上隸屬于硬骨魚(yú)綱（Osteichthyes）、輻鰭亞綱（Actinopterygii）、鯡形總目（Clupeomorpha）、鮭形目（Salmoniformes）、鮭亞目（Salmonoidei)、鮭科（Salmonidae）、鮭亞科（Salmoninae）、鮭屬（Salmo）.具有個(gè)體大、生長(zhǎng)速度快、肉質(zhì)細(xì)嫩鮮美、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值豐富等特點(diǎn).目前我國(guó)內(nèi)陸冷水水域分布有2亞種，有溯河型及純淡水棲息種群之別.
　　魚(yú)類是最早出

2、現(xiàn)免疫球蛋白的生物.免疫球蛋白基因序列在魚(yú)類進(jìn)化分界處表現(xiàn)出了很大的變化，并且鮭科魚(yú)類起源于特殊的地理時(shí)期，因此對(duì)鮭科魚(yú)類的免疫球蛋白基因序列進(jìn)行研究，對(duì)古生物地理學(xué)、古生態(tài)學(xué)、氣候變化及脊椎動(dòng)物進(jìn)化系統(tǒng)等許多方面均具有重要意義.就此，本文采用分子生物學(xué)和生物信息學(xué)相結(jié)合的方法，對(duì)哲羅(Huchotaimen)的免疫球蛋白重鏈可變區(qū)及恒定區(qū)序列進(jìn)行研究和功能分析，并與虹鱒(Oncorhynchusmykiss)序列(Genbank登錄號(hào)

3、為S63348.1)進(jìn)行相似性比較.
　　從哲羅鮭主要免疫器官—脾臟獲得總RNA并采用RT-PCR技術(shù)獲得其免疫球蛋白（Immunoglobulin，Ig）重鏈cDNA克隆，獲得32條完整不重復(fù)可變區(qū)序列以及1條恒定區(qū)序列，經(jīng)過(guò)BLUST網(wǎng)絡(luò)對(duì)比，結(jié)果顯示與GenBank報(bào)道的登錄號(hào)為S63348.1的虹鱒序列的相似性高達(dá)87.4％以上;對(duì)所得核苷酸序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)域可變性分析可見(jiàn)，哲羅鮭Ig重鏈可變區(qū)VH中骨架區(qū)(framework

4、region，F(xiàn)R)部分相對(duì)保守，變異率較低;互補(bǔ)決定區(qū)（Complementaritydeterminingregion，CDRs）變異率較大，特別是CDR3區(qū)變異可達(dá)35.免疫球蛋白重鏈可變區(qū)VH中D和J片段的的隨機(jī)重排，外切酶的作用，以及在重排位點(diǎn)大量N，P片段的插入都大大增加了哲羅鮭免疫球蛋白重鏈可變區(qū)的多樣性.恒定區(qū)序列與斑點(diǎn)叉尾鮰（Ictaluruspunctatus)、草魚(yú)（Ctenopharyngodonidella）、