長江中游地區(qū)百合屬種質(zhì)資源遺傳多樣性的SSR分析.pdf

1、我國野生百合種質(zhì)資源豐富，原產(chǎn)于我國的百合屬植物約55種，對野生百合種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性研究具有重要意義，近年來，對百合種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究越來越多，但以長江中游地區(qū)野生百合種質(zhì)資源為實(shí)驗(yàn)試材的研究很少。本研究利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)，對主要采集于長江中游地區(qū)的10個(gè)不同野生百合種共253個(gè)樣本進(jìn)行了遺傳多樣性研究，希望能對該地區(qū)種質(zhì)資源的研究利用和資源保護(hù)提供一定的幫助。
　　 本次研究的主要結(jié)果如下:
　　 1.

2、百合SSR檢測程序的建立。
　　 建立了一套符合要求的基于“變性聚丙烯酰胺凝膠-銀染”技術(shù)的百合屬植物SSR檢測程序，同時(shí)優(yōu)化得到了最合適的SSR-PCR體系。研究結(jié)果顯示:SSR擴(kuò)增對DNA模版質(zhì)量要求不高;降落PCR程序并沒有明顯優(yōu)于普通PCR程序的擴(kuò)增效果;上樣量在2.5μL/孔到4μL/孔之間時(shí)條帶均清晰;變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離效果比非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離效果更好。得到SSR-PCR最優(yōu)體系:Mg2+3.0mm

3、ol.L-1、模版DNA100ng、 Taq酶1.0 U.ul-1、dNTP0.2 mmol.L-1、加純水補(bǔ)足至20 ul。
　　 2.長江中游地區(qū)野生百合種質(zhì)資源遺傳多樣性分析。
　　 篩選出6對SSR引物，共檢測到42個(gè)等位基因，平均每對引物擴(kuò)增出7個(gè)，多態(tài)帶百分率為100％。10個(gè)百合種遺傳多樣性由高到低依次是:野百合＞龍牙百合＞渥丹＞卷丹＞川百合＞宜昌百合＞湖北百合＞東北百合＞南川百合＞藥百合。
　　

4、10個(gè)百合種的觀察雜合度Ho波動(dòng)較大，平均值為0.4877，雜合度較高，種間出現(xiàn)一定的遺傳分化，僅渥丹種群雜合度過剩。
　　 總體上來看，基因型非常豐富。種群內(nèi)的遺傳變異程度小于種群間的遺傳變異，基因流Nm小于1，長江中游地區(qū)百合種遺傳分化嚴(yán)重。
　　 聚類分析顯示10個(gè)百合種被分為三大類群，湖北百合、南川百合以及藥百合為第一大類群;卷丹、渥丹為第二大類群;剩下5個(gè)百合種聚成第三大類群。
　　 3.野百合居群遺傳

5、多樣性分析。
　　 野百合5個(gè)居群的平均等位基因數(shù)A、平均有效等位基因數(shù)Ae、香農(nóng)信息指數(shù)(Ⅰ)平均值分別是3.7667、2.7758、1.0607。5個(gè)不同居群遺傳多樣性由高到低依次為WS＞SNJ＞BD＞ZG＞YC。
　　 野百合雜合度較低，居群雜合度缺失。91個(gè)野百合個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了82種基因型，基因型很豐富?；蛐投鄻有灾笖?shù)k在0.8000到0.9630之間變化，SNJ居群最高。
　　 野百合居群內(nèi)的遺傳變異程

6、度大于居群間的遺傳變異，居群之間存在基因交流。聚類分析顯示5個(gè)野百合居群被分為2大類，居群YC單獨(dú)聚成一支;剩下的4個(gè)居群聚成一支。
　　 4.宜昌百合居群遺傳多樣性分析。
　　 宜昌百合4個(gè)居群的平均等位基因數(shù)A、平均有效等位基因數(shù)Ae、香農(nóng)信息指數(shù)(Ⅰ)平均值分別是2.7084、1.7699、0.6489，4個(gè)不同居群遺傳多樣性由高到低依次為DSN＞BJP＞CBD＞AJP。
　　 宜昌百合居群的觀察雜合度較低

7、，居群CBD雜合度最高，宜昌百合種群雜合度缺失。44個(gè)宜昌百合個(gè)體中發(fā)現(xiàn)了40種基因型，基因型豐富?；蛐投鄻有灾笖?shù)k在0.8000到1.0000之間變化，居群CBD和居群DSN最高，居群AJP最低。
　　 宜昌百合居群內(nèi)的遺傳變異程度大于居群間的遺傳變異;基因流Nm平均值為1.1116，居群之間存在基因交流。聚類分析顯示4個(gè)宜昌百合居群明顯的被分為2大類，居群DSN單獨(dú)聚成一支;居群AJP與居群BJP遺傳距離最小，聚成一小支后