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文檔簡介
1、通過PCR擴增和序列測定等技術,對分布于黃、東海海域的魚蝦鳀魚(Engraulis japonicus的ITS-1基因片段及線粒體DNA的16S rRNA、Cytb和CoI基因片段進行初步的研究,分別得到大小約為400bp、550bp、400bp和650 bp的片段.通過序列比較發(fā)現(xiàn)Coi基因片段長度適宜,變異位點適中,且易于擴增,因此適合用于進行群體內(nèi)及群體間的遺傳多樣性分析.該研究進一步對分布于黃、東海海域不 地理群體的鳀魚mtDN
2、A CoI基因片段進行了PCR擴增和測序.用Genedoc軟件進行序列比較,在這45個個體中未發(fā)現(xiàn)堿基插入或缺失,共檢測到45個變異位點,其中有43個轉(zhuǎn)換位點和2個顛換位點.運用MEGA軟件計算出不同個體間的遺傳距離,并據(jù)此構建了UPGMA和NJ系統(tǒng)樹.用DNASP軟件計算出各個群體及總?cè)后w的多態(tài)位點數(shù)(S)、核苷酸多樣性(P<,i>)和平均核苷酸差異數(shù)(K).發(fā)現(xiàn)三個群體的45個個體隨機分布,沒有明顯的聚類現(xiàn)象,且群體內(nèi)的遺傳多樣性參
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