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文檔簡介
1、上海交通大學博士學位論文不同外源擾動因素對腸道菌群組成結構影響的研究姓名:魏華申請學位級別:博士專業(yè):微生物學指導教師:趙立平20081001摘要第3,5,9周大鼠的新鮮糞便樣本,應用優(yōu)勢細菌(16SrRNA基因的V3區(qū))PCRDGGE以及擬桿菌、柔嫩梭菌、乳酸菌和雙歧桿菌的類群特異性PCRDGGE方法結合多變量統(tǒng)計分析包括主成分分析(Principalcomponentanalysis,PCA)與最小偏二乘判別分析(Partialle
2、astsquaresdiscriminantanalysis,PLSDA),對大鼠的腸道菌群組成進行動態(tài)分析。分析結果顯示,單純二甲肼誘導組大鼠的腸道優(yōu)勢細菌與柔嫩梭菌的組成在實驗第3周與健康對照組沒有明顯差異,在實驗第5周與健康對照組具有差異趨勢,而在實驗第9周,當單純二甲肼誘導大鼠形成(37726)個異常隱窩病灶(Aberrantcryptfoci,ACF)/全結腸時,其腸道優(yōu)勢細菌與柔嫩梭菌的組成與未見明顯ACF的健康對照組具有明
3、顯差異,Martens’uncertaintytest結合ANOVA檢驗◇O05)結果提示優(yōu)勢細菌中的2條PCRDGGE條帶與柔嫩梭菌的5條PCRDGGE條帶是區(qū)分第9周2組動物腸道菌群的重要PCRDGGE條帶,將這些條帶進行割膠測序,這些條帶為Ruminococcusobeum與Allobaculumstercoricanis等的類似菌。針對部分差異序列設計特異引物,熒光定量PCR的結果證實,實驗9周,單純二甲肼誘導組大鼠的腸道Rum
4、inococcusobeum與Allobaculumstercoricanis的類似菌數(shù)量明顯高于健康對照組,差異具有統(tǒng)計學意義,與PCRDGGE結果相符。單純二甲肼誘導組大鼠腸道中乳酸菌和雙歧桿菌的組成沒有發(fā)生明顯改變,其雙歧桿菌數(shù)量也沒有明顯改變。本研究結果提示,與健康對照組相比,動態(tài)監(jiān)控疾病高危動物或人群的腸道菌群組成可能會成為一種無損傷性的評估宿主健康狀態(tài)的方法,腸道菌群組成偏離健康群體的動物,其機體的健康狀態(tài)可能也發(fā)生了改變。
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