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文檔簡介
1、結(jié)直腸癌是嚴(yán)重危害人類健康的常見消化道惡性腫瘤之一。在我國由于結(jié)直腸癌的發(fā)病率逐漸增加,并且其發(fā)病年齡趨向低齡化,因此人們對結(jié)直腸癌發(fā)生機制的研究日益增加。
腺瘤是結(jié)直腸癌發(fā)生的早期階段,多數(shù)結(jié)直腸癌是從腺瘤癌變而來的,因此切除腺瘤可以有效地降低結(jié)直腸癌的發(fā)病率。然而,約30%~46%的腺瘤患者在接受治療后2.5~7年內(nèi)仍會復(fù)發(fā),原因在于目前尚缺乏有效的指標(biāo)來預(yù)測腺瘤的進一步演進或復(fù)發(fā)。因此對結(jié)直腸腺瘤發(fā)生機制的研究對于結(jié)直腸
2、癌的預(yù)防及治療具有重大意義。
盡管人們對結(jié)直腸癌發(fā)生的分子機理進行了大量的研究,但至今結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展的分子機制仍不清楚。早在1999年,我們實驗室應(yīng)用抑制性消減雜交法(SSH)(利用一個同時患有結(jié)腸腺瘤和腺癌的病例)構(gòu)建了三個eDNA差減文庫,在對腺瘤相對于正常粘膜的差異片段文庫(A-N)分析時發(fā)現(xiàn)再生基因家族成員RegⅣ在腺瘤中相對高表達(dá)。
再生基因(Regenerating gene,Reg)家族屬于C型植物
3、血凝素超家族。該基因家族成員,均為小分子量的分泌性蛋白質(zhì),在結(jié)構(gòu)上具有相似的鈣離子依賴性血凝素結(jié)構(gòu)域。它們與炎癥、組織損傷/修復(fù)、糖尿病及惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。迄今為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的人類Reg家族成員一共有3個,即RegⅠ,RegⅢ及RegⅣ。與其他人類Reg家族成員不同的是,RegⅣ定位于第一號染色體上,而其余成員均定位于第二號染色體。但RegⅣ與Reg家族的其他成員在結(jié)構(gòu)及功能上具有相似性。
近年來人們已證實RegⅣ與結(jié)直
4、腸癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān),然而RegⅣ在結(jié)直腸癌中的生物學(xué)功能及效應(yīng)機制卻研究的不多。為深入研究RegⅣ在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用,我們開展了以下兩部分研究:RegⅣ在結(jié)直腸癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能研究和RegⅣ在結(jié)直腸癌細(xì)胞中的效應(yīng)機制研究。
首先通過RT-PCR和Western blot方法尋找RegⅣ陰性和陽性表達(dá)的結(jié)直腸癌細(xì)胞系。實驗結(jié)果顯示RKO和HT29為RegⅣ陰性表達(dá)細(xì)胞株,LoVo和CW2為RegⅣ陽性表達(dá)細(xì)胞株。然后
5、我們分別轉(zhuǎn)染RegⅣ表達(dá)質(zhì)粒到RegⅣ陰性表達(dá)的結(jié)直腸癌細(xì)胞內(nèi),通過G418篩選得到穩(wěn)定表達(dá)RegⅣ的細(xì)胞克隆,分別記為RKO-RegⅣ細(xì)胞株(RKOR)和HT29-RegⅣ細(xì)胞株(HT29R),它們的對照組分別記為RKO-Ctrl(RKOC)和HT29-Ctrl細(xì)胞株(HT29C);轉(zhuǎn)染RegⅣ干擾質(zhì)粒到LoVo細(xì)胞株中,同樣通過G418穩(wěn)篩出RegⅣ穩(wěn)定干擾的細(xì)胞克隆LoVo-RegⅣ-shRNA和它的對照組細(xì)胞克隆LoVo-Ctr
6、l-shRNA;用siRNA片段瞬時干擾CW2細(xì)胞中RegⅣ的表達(dá),它的RegⅣ干擾的細(xì)胞記為CW2-siRNA-RegⅣ,對照組細(xì)胞記為CW2-siRNA-NC。
獲得RegⅣ穩(wěn)定表達(dá)/干擾的細(xì)胞克隆后,我們對這些細(xì)胞克隆進行生物學(xué)功能研究,通過EdU法、xCELLigence系統(tǒng)及CCK8方法檢測RegⅣ表達(dá)/干擾前后細(xì)胞增殖能力變化,未發(fā)現(xiàn)RegⅣ具有促進細(xì)胞增殖的能力;通過外源性RegⅣ刺激細(xì)胞后同樣發(fā)現(xiàn)RegⅣ未具有
7、促進細(xì)胞增殖的能力;我們又利用流式細(xì)胞術(shù)檢測細(xì)胞周期,結(jié)果顯示并無顯著差異。利用5-FU誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,分別在24小時和48小時檢測細(xì)胞的存活率,發(fā)現(xiàn)這幾組細(xì)胞的存活率也無明顯差異。通過Transwell小室和xCELLigence系統(tǒng)檢測到RegⅣ表達(dá)組細(xì)胞的遷移能力均強于它們的對照組細(xì)胞;而RegⅣ干擾組細(xì)胞的遷移能力比它們的對照組細(xì)胞有所下降。利用鋪有Matrigel的Transwell小室檢測細(xì)胞的侵襲能力,發(fā)現(xiàn)RegⅣ表達(dá)組細(xì)胞
8、的侵襲能力強于它們的對照組細(xì)胞,干擾組結(jié)果反之。綜上可知RegⅣ具有促進結(jié)直腸癌細(xì)胞遷移和侵襲能力,但未見對結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖和凋亡有影響。因此探索RegⅣ如何誘導(dǎo)結(jié)直腸癌細(xì)胞遷移和侵襲的分子機制是我們下一步所要開展的工作。
比較蛋白質(zhì)組學(xué)是當(dāng)今生物學(xué)研究的一個重要領(lǐng)域,比較不同生理和病理狀態(tài)下細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)表達(dá)和蛋白質(zhì)修飾,對于揭示生物系統(tǒng)的復(fù)雜生理和病理過程具有十分重要的意義。同位素標(biāo)記相對和絕對定量(isobaric ta
9、gs for relative andabsolute quantitation,iTRAQ)技術(shù)是近年來最新開發(fā)的一種新的蛋白質(zhì)組學(xué)定量研究技術(shù)。iTRAQ技術(shù)結(jié)合先進的液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(liquid chromatography-mass spectrograph,LC-MS)對蛋白質(zhì)樣本的分離能力強、分析范圍廣、靈敏度高、可同時對多個樣本進行平行分析并可以絕對和相對定量,因此iTRAQ技術(shù)結(jié)合LC-MS必將成為一種功能更強大的
10、蛋白組學(xué)研究方法。
因此我們選用iTRAQ標(biāo)記的比較蛋白組學(xué)方法來探索RegⅣ在結(jié)直腸癌細(xì)胞中的效應(yīng)機制,我們用該方法完成了對1985種蛋白質(zhì)的定量分析。已鑒定出的表達(dá)量上有差異的蛋白質(zhì)是否最終被篩選和認(rèn)定為差異蛋白質(zhì),還需要進行統(tǒng)計學(xué)的驗證。由于RKO和HT29細(xì)胞本身遺傳背景不同,因此它們所得的差異蛋白質(zhì)結(jié)果也存在差異。通過統(tǒng)計學(xué)分析后,所產(chǎn)生的差異蛋白質(zhì)的篩選結(jié)果如下:RKOR/RKOC組鑒定出6個顯著下調(diào)和11個顯著上
11、調(diào)的蛋白質(zhì),HT29R/HT29C組鑒定出18個顯著下調(diào)和13個顯著上調(diào)的蛋白質(zhì)。因為腫瘤的轉(zhuǎn)移過程是多基因、多途徑的過程,因此不同遺傳背景的細(xì)胞所得的實驗結(jié)果可以為RegⅣ分子機制研究提供更多的信息和線索。我們利用GO數(shù)據(jù)庫對鑒定出的所有差異蛋白進行GO功能注釋分析,利用蛋白相鄰類的聚簇(cluster of Orthologous Groups of proteins,COG)對蛋白質(zhì)進行直系同源分類,利用KEGG公共數(shù)據(jù)庫分析、確
12、定蛋白質(zhì)參與的最主要生化代謝途徑和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑。最后我們用Q-PCR檢測了RKOR/RKOC組中15個差異基因和HT29R/HT29C組18個差異基因的表達(dá)情況,其中RKOR/RKOC組中的12個差異基因和HT29R/HT29C組中的14個差異基因的Q-PCR結(jié)果與iTRAQ鑒定的結(jié)果一致。我們又用Western blot驗證了MRPL12、MAGED2、DBN1、TIP47、MAPK3和S100A11的表達(dá)情況,結(jié)果均與iTRAQ鑒定
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