基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的多類腫瘤亞型識(shí)別研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、湖南大學(xué)碩士學(xué)位論文基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的多類腫瘤亞型識(shí)別研究姓名:陽少林申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):計(jì)算機(jī)應(yīng)用技術(shù)指導(dǎo)教師:王樹林20080313基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的多類腫瘤亞型識(shí)別研究A b s t r a c tB u i l d i n ga ne f .f e c t i V ec l a s s i n c a r t i o nm o d e l b a s e d o ng e n ee x p r e s s i o np r o n

2、l e s i so fg r e a ti m p o n a n c ei n t u m o rd i a g n o s i n ga n di t sc l i n i c a l t h e r a p y .T bt h ec l a s s i f i c a t i o np r o b l e m o ft u m o r s u b t y p e ,f i n d i n ga g r o u po fg e n

3、 es u b s e t s t h a ta r er e l e V a n tt ot u m o rs u b t y p ei s ac m c i a lt a s k .I nt h i s w o r k ,f r o mt h e V i e wo fi n f o r m a t i o n 缸ds y s t e ms c i e n c e ,w e w e r ec o m m i t t e d t oe

4、x p l o r i n g t h ep r o b l e m o f A L L s u b t y p ed i s c r i m i n a t i o na n df e a t u r es e l e c t i o nu s i n g m e t h o d o l o g y o f A I a n dc o m p u t i n g t e c h n Q l o g y .T h eA c u t eL

5、y m p h o b l a s t i cL e u k e m i aT u m o rd a t a s e t ( A L L ) w a st a k e na s ac a s ea n dt h er e s e a r c hr e s u l t sa r ea c h i e v e da sf .0 l l o w s .F i r s t l y ,W e a d o p t am e a s u r e a

6、s w e i g h t e d R e l i e f d i s t a n c e a s ac r i t e r i o n o fs c r e e n i n g p r e d i c t i V eg e n e s f o rA L L s u b t y p ec l a s s i f i c a t i o n .C o n s i d e r i n g t h a tA L L h a ss e V e

7、n s u b t y p e s ,w ep r o p o s e d a i m p r o V e dm e a s u r ea l g o r i t h mk n o w n a sR e l i e f - Fa s t h ec r i t e r i o no f g e n es o r t i n ga n d s e l e c t i o n .S e c o n d l y ,I n v i e wo f

8、t h er e s e a r c ho f A L L s u b t y p ef o r e c a s tm o d e l ,w e 姐a l y z e d ac l a s s i f i e dt o o l ’sa p p l i c a t i o n i na c u t el y m p h a t i cl e u k e m i a t u m o r s u b t y p e r e c o g n i

9、 t i o nb a s e d o nn e u r a ln e t w o r k .W ei n t r o d u c e dt h e c h a r a c t e r i s t i co f t h e n e u r a ln e t w o r k a n dt h e i r a p p l i c a t i o n i nt h ep a t t e mc l a s s i f i c a t i o n

10、 ,t h e nw ed e s i g n e d a B P n e t w o r k m o d e lw h i c h h a st h r e e h i d d e nl a y e r ,a n dt h en o d e s o f t h eh i d d e nl a y e rw e r ec h a n g e d a I o n gw i t ht h en u m b e r o fi n f o m

11、a t i v eg e n e s .T h e n w es e l e c t e da s u b s e th a s16 9g e n e s t h a tc o u l d a c h i e V el0 0 %a c c u r a c yb yt h eB P n e t w o r k m o d e la f t e rl e a V e - o n e - o u t c r o s sV a l i d a

12、t i o n ( L O O C V ) a n d i n d e p e n d e n t t e s t ( I T ) .L a s t l y ,w ea n a l y z e dt h e f i l t r a t i o no f r e d u n d a n t g e n e s i nA L L a n d p r o p o s e d a n e wm e t h o d .W e a d o p t

13、K - m e a n sa l g o r i t h m t oa n a l y z e dc l u s t e r i n ga b i l i t yo f t h ei n f o r m a t i V eg e n e sa n dr e m o v e i t s r e d u n d a n tg e n e s .T h e nw ec o m p a r e d w i t h E n g - J u hY

14、b o h ’se x p e r i m e n t a lr e s u l t s ,w e s e l e c t a ni n f o r m a t i V eg e n es u b s e th a sl e s s3 8g e n e sa n dw ea p p l ya r t i n c i a ln e u r a ln e t w o r k s ( A N N ) t oe V a l u a t i n

15、gt h ec I a s s i f i c a t i o na b i l i t yo f t h es e l e c t e dg e n es u b s e t .E x p e r i m e n t sp r o V e dt h a tp r o p o s e dm e t h o di s V e r y e f f .e c t i V ei nm u l t i - c l a s st u m o rs

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