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文檔簡介
1、背景和目的:microRNA(miRNA)參與細胞增殖、分化、凋亡等,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起重要作用。位于miRNA靶基因3’非翻譯區(qū)的單核苷酸多態(tài)(singlenucleotide polymorphism,SNP)可能改變靶基因與miRNA的結(jié)合而影響基因表達,從而與個體的腫瘤易感性和預(yù)后相關(guān)。本研究篩查小細胞肺癌中表達失調(diào)基因的3’非翻譯區(qū)遺傳變異并探討其與小細胞肺癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。
方法:通過數(shù)據(jù)庫挖掘?qū)ふ椅挥谛〖毎?/p>
2、肺癌表達失調(diào)基因3’非翻譯區(qū)有潛在功能的遺傳變異。病例-對照研究包括666例小細胞肺癌病人和758例年齡和性別匹配的正常對照。采用聚合酶鏈式反應(yīng).限制性片段長度多態(tài)性方法分析基因型。以logistic回歸模型計算各基因型的比值比(odds ratios,ORs)及其95%可信區(qū)間(confidenceintervals,CIs)以表示相對危險度。用多變量Cox回歸模型分析MYCL1基因的兩個SNP(rs3134615和rs3134613
3、)對經(jīng)鉑類藥化療的239例小細胞肺癌病人預(yù)后的影響。用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灥纫幌盗猩锘瘜W(xué)和分子生物學(xué)實驗,研究遺傳變異的生物學(xué)功能。用實時定量PCR檢測MYCLI mRNA表達量。
結(jié)果:數(shù)據(jù)庫挖掘發(fā)現(xiàn)在小細胞肺癌表達失調(diào)基因中有2個可能影響miRNA功能的遺傳變異,即rs3134615(MYCLI3'UTR G>T)和rs2291854(ASCLI3'UTR C>T)。病例-對照分析表明,rs3134615T等位基因
4、與小細胞肺癌發(fā)病風(fēng)險增高相關(guān),攜帶至少一個T等位基因者發(fā)生小細胞肺癌的OR為1.87(95%CI=1.26—2.77;P=0.002),并與吸煙有相乘的聯(lián)合作用。rs2291854.SNP與小細胞肺癌易感性無顯著相關(guān)(OR=1.26,95%CI=0.96—1.64;P=0.096),但分層分析顯示該變異在男性實驗對象中與小細胞肺癌發(fā)病風(fēng)險相關(guān),OR(95%CI)為1.40(1.03—1.91)。小細胞肺癌預(yù)后分析表明,rs3134615
5、與小細胞肺癌病人生存無關(guān),但該基因的另一SNP(rs3134613)與小細胞肺癌病人生存相關(guān)。rs3134613GG和GT基因型比TT基因型的中位生存時間長[22月(95%CI=19-25)和19月(95%CI=16-22)比16月(95%CI=11-21),P=0.002和P=0.047]。Cox模型分析結(jié)果表明,與TT基因型比較GT和GG基因型的死亡風(fēng)險分別是0.61(95%CI=0.42—0.90,P=0.012)和0.44(95
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