北京與上海ARI患兒中小RNA病毒和人冠狀病毒分型檢測(cè).pdf

1、目的：
　　急性呼吸道感染是嬰幼兒發(fā)病和死亡的主要原因之一，小RNA病毒（主要是鼻病毒和腸道病毒）和人冠狀病毒(HCoV)在兒童急性呼吸道感染中有重要意義。急性呼吸道感染住院兒童鼻病毒感染率居第2位，僅次于呼吸道合胞病毒;腸道病毒型別眾多，其與呼吸道感染關(guān)聯(lián)性尚不十分清楚，近年腸道病毒D68型因在歐美爆發(fā)流行并引起重癥呼吸道感染而受到高度關(guān)注。除SARS-CoV與MERS-CoV外，其他常見(jiàn)的4種HCoV也是引起急性呼吸道感染的重

2、要病原，但國(guó)內(nèi)有關(guān)急性呼吸道感染住院患兒中人冠狀病毒感染的分析報(bào)道較為少見(jiàn)。
　　方法：
　　本文收集中國(guó)2個(gè)最大城市急性呼吸道感染住院患兒鼻咽抽吸物樣本700份（北京259份、上海441份），首先對(duì)所有樣本進(jìn)行常見(jiàn)呼吸道病毒的分子檢測(cè)與分析，包括流感A和B、副流感1-3、腺病毒、呼吸道合胞病毒、博卡病毒、偏肺病毒、小RNA病毒（鼻病毒和腸道病毒）和人冠狀病毒。然后重點(diǎn)對(duì)小RNA病毒（鼻病毒和腸道病毒）以及人冠狀病毒進(jìn)行基于

3、序列分析的分子分型檢測(cè)。鼻病毒篩查陽(yáng)性樣本用VP4-VP2引物分型;腸道病毒篩查陽(yáng)性樣本用VP3/VP1引物分型。冠狀病毒用RdRp通用引物檢測(cè)，陽(yáng)性樣本測(cè)序后確定型別。同時(shí)，還進(jìn)行了感染人群的年齡、性別與季節(jié)及臨床癥狀等特點(diǎn)的比較分析。
　　結(jié)果：
　　1.北京259份樣本中，呼吸道病毒檢出陽(yáng)性例數(shù)為238（檢出率91.9％）;其中，病毒檢出率最高的是RSV(52.9％)，其次為小RNA病毒（包括鼻病毒和腸道病毒，35.9

4、％）、人冠狀病毒(18.9％)。上海441份樣本中，呼吸道病毒檢出陽(yáng)性例數(shù)為309(檢出率為70.1％);其中，檢出率最高的是小RNA病毒(33.6％)，其次為博卡病毒(17.7％)。經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)，兩地RSV、HCoVs以及hMPV檢出率的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＜0.01)，均是北京地區(qū)的檢出率高于上海地區(qū)。
　　2.北京地區(qū)259份樣本中，5'-UTR篩查鼻病毒陽(yáng)性89例，用VP4-VP2分型測(cè)序確定A型39例(48.1％)、B型4

5、例(4.9％)、C型38例(46.9％)。上海441份樣本，5，-UTR篩查鼻病毒陽(yáng)性132例，可用VP4-VP2分型測(cè)序確定A型70例(63.1％)、B型10例(9.0％)、C型31例(27.9％)。北京C型陽(yáng)性率明顯高于上海(P=0.0007)。北京A型檢出高峰是在2009年秋季，C型檢出高峰在2009年冬季，上海A型檢測(cè)高峰在2013年9月（秋季），C型高峰在2013年10月（秋季）。兩地的鼻病毒陽(yáng)性樣本中與其它常見(jiàn)呼吸道病毒存在

6、較高的合并感染率;不同型別鼻病毒感染的臨床癥狀無(wú)差異。
　　3.北京檢出腸道病毒4例，可通過(guò)VP3/VP1分型測(cè)序確定B型1例(25.0％)、C型2例(50.0％)、D型1例(25.0％);上海檢出腸道病毒21例，可通過(guò)VP3/VP1分型測(cè)序確定A型10例(52.6％)、B型2例(10.5％)、C型3例(15.8％)、D型4例(21.1％)。腸道病毒D型均為D68，臨床診斷均為肺炎。上海地區(qū)腸道病毒檢出高峰在2013年7月（夏季）

7、。
　　4.北京樣本檢出人冠狀病毒49例，其中HCoV-OC43為40例(15.4％，40/259)、HCoV-229E為1例(0.4％，1/259)、HCoV-NL63為3例(1.2％，3/259)、HCoV-HKU1為5例(1.9％，5/259)。上海冠狀病毒檢出26例，19例存在合并感染;其中HCoV-OC43為19例(4.3％，19/441)、HCoV-229E為2例(0.4％，2/441)、HCoV-NL63為4例(0.

8、9％，4/441)、HCoV-HKU1為1例(0.2％，1/441)。北京地區(qū)OC43和HKU1的檢出率都高于上海。序列分析結(jié)果提示HCoV-OC43主要為D型感染，HKU1主要為A型感染。北京OC43感染高峰是在春季和秋季，上海OC43感染高峰出現(xiàn)在2013年8月（夏季）。不同型別HCoV感染臨床癥狀無(wú)明顯差別。
　　結(jié)論：
　　在北京與上海市急性呼吸道感染住院兒童中，小RNA病毒（鼻病毒和腸道病毒）及冠狀病毒皆是重要病原