內(nèi)蒙古絨山羊（阿拉善型）線粒體基因組序列測定與研究.pdf

1、內(nèi)蒙古絨山羊是具有重要經(jīng)濟價值的特色家畜品種，近幾十年來，在絨山羊遺傳育種的研究領域，相關的進展較為迅速，主要是在細胞遺傳學、發(fā)生遺傳學、數(shù)量遺傳學、分子生物學等方面取得了許多進展，但是，有關絨山羊核外遺傳信息系統(tǒng)—線粒體基因組方面的研究，相對甚少。本文以內(nèi)蒙古絨山羊（阿拉善型）為試驗研究對象，利用Illunima Hiseq2000平臺，對絨山羊的線粒體基因組進行了序列測定，經(jīng)生物信息學分析，測序共得到2551175100bp堿基數(shù)，

2、Q20為95.40％，文庫構(gòu)建質(zhì)量好，測序結(jié)果準確性高，得到長度為16642 bp完整的閉合環(huán)狀線粒體基因組，其GC含量為39.17%，K-mer為53bp。系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果表明內(nèi)蒙古絨山羊的三個類群距離比較近，其中阿拉善型和二郎山型的關系最近，阿爾巴斯次之；內(nèi)蒙古絨山羊和遼寧絨山羊可以分為單獨的兩個類群；與國外品種San Clemente的距離最遠。本研究為下一步研究絨山羊的起源、進化、不同類群的分化以及特定遺傳特性形成機理奠定重要基礎