中國家驢的母系起源與遺傳多樣性研究.pdf

1、為了研究中國家驢的起源進化與遺傳多樣性，本研究利用線粒體DNA(mtDNA)D-loop序列分析方法對我國12個家驢品種126個個體進行分析，這些家驢品種為泌陽驢、德州驢、關(guān)中驢、淮北灰驢、佳米驢、蒙古驢、涼州驢、慶陽驢、太行驢、西吉驢、新疆驢和云南驢。通過數(shù)據(jù)分析本研究所得出的主要結(jié)論如下： (1)中國家驢具有豐富的遺傳多樣性。在所分析的12個家驢品種126條序列中，共發(fā)現(xiàn)36種單倍型，37個多態(tài)位點，其單倍型多樣度和核苷酸多

2、樣度在各品種中的分布分別為0.4667～0.9778和0.0012～0.0285，均以涼州驢最小，新疆驢最大，平均單倍型多樣度和核苷酸多樣度分別為0.9055和0.0228。 (2)中國家驢的母系起源為非洲起源，并分為兩個支系即索馬里野驢起源和努比亞野驢起源。我們引用了3條非洲索馬里野驢的序列，3條非洲努比亞野驢的序列以及6條亞洲野驢的序列，共代表12種單倍型。將之與中國家驢的36種單倍型用。Kimura雙參數(shù)模型構(gòu)建NJ系統(tǒng)發(fā)

3、育樹，結(jié)果發(fā)現(xiàn)有15種單倍型(代表76條序列)屬于索馬里驢支系，有21種單倍型(代表50條序列)屬于努比亞驢支系；采用簡約中介網(wǎng)絡(luò)法對所有單倍型繪制了網(wǎng)絡(luò)圖，中國家驢同樣分成相互獨立的兩個支系，均呈現(xiàn)星狀發(fā)育模式，其中單倍型CD1和CD5分別位于索馬里驢支系和努比亞驢支系的中心，從而進～步支持了NJ樹的分析結(jié)果。中國家驢的序列和亞洲野驢的序列沒有聚在一起，說明亞洲野驢不是中國家驢的母系祖先。 (3)中國家驢各品種間群體結(jié)構(gòu)不明顯

4、。在所研究的12個家驢品種中，除涼州驢只有索馬里驢支系外，其他11個品種均有索馬里驢和努比亞驢支系分布，AMOVA分析表明品種間方差組分僅占3.09％，其余均為品種內(nèi)方差組分，這說明中國家驢各品種的母系起源與其地理分布沒有明顯的對應(yīng)關(guān)系；按家驢類型來分，大型驢、中型驢和小型驢在兩個支系中均有分布，其中核心單倍型CD1、CD2、CD3和CD4均包含以上3個驢類型，這說明中國家驢各品種的母系起源與其體格大小也沒有關(guān)系；家驢品種間核苷酸分歧度

5、Dxy、凈遺傳距離Da和群體分化指數(shù)Fst均較低，同樣說明各品種間遺傳分化不明顯，可能存在較大的基因流。 (4)中國家驢曾經(jīng)歷了群體擴張。應(yīng)用Arlequin3.1軟件對中國家驢兩個支系的所有個體分別進行不配對分析，發(fā)現(xiàn)索馬里支系和奴比亞支系的不配對分布曲線均呈單峰形，F(xiàn)s值分別為-7.64和-13.12，P值均小于0.01，顯著偏離中性，表明兩個支系均曾經(jīng)歷了群體擴張，且努比亞支系經(jīng)歷了較大的群體擴張。 (5)推測了中

6、國家驢可能的傳播路線。研究證明起源中心的群體與從起源中心分離出去的群體相比具有更高的單倍型多樣度和核苷酸多樣性。據(jù)此我們推測中國家驢的發(fā)源地在新疆，可能的傳播路線為：①從新疆經(jīng)由甘肅、寧夏、陜北延安到陜西的關(guān)中平原，然后，再向東傳播到山西、河北、河南、安徽和山東等地，形成與當?shù)氐乩砗蜌夂蛳噙m應(yīng)的地方品種；②同時還有一部分從新疆經(jīng)由陜北延安、長城沿線、科爾沁草原進入東北平原形成草原生態(tài)類型的東北驢，到內(nèi)蒙古草原形成蒙古驢；③最后，中國的家